Systembiologische Analysen des Krebsgenoms mit Hilfe deduktiver Datenbanken

使用演绎数据库对癌症基因组进行系统生物学分析

• 批准号: 249380227
• 负责人: Privatdozent Dr. Peter Frommolt
• 金额: --
• 依托单位: Max-Planck-Institut für Biochemie (MPIB)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research data and software (Scientific Library Services and Information Systems)
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2013-12-31 至 2017-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/249380227?language=en
• 关键词: Systembiologische; Analysen; des; Krebsgenoms; mit

The goal of this project is to develop a deductive database system enabling the integration of various types and sources of highdimensional molecular tumor data sets. We thereby approach a systems biology view on cancer cells by a joint investigation of different molecular aspects given e.g. by genomic data and expression data. Furthermore, the system does not only enable the user to store and analyze his own research data, but also provides a comparative view with data from other research data repositories for cancer genomics. This will highly increase the scope of information available in the analysis of research data and enable novel approaches in scientific investigation. The system will be realized in a public instance in which the data and analysis options are accessible to everyone according to the respective restrictions of usage. On the other hand, each institution can operate its own local instance as needed to use the system for the nonpublic storage and analysis of its own research data.

本项目的目标是开发一个能够整合各种类型和来源的高维分子肿瘤数据集的演绎数据库系统。因此，我们通过对不同分子方面的联合调查，例如通过基因组数据和表达数据，来接近癌细胞的系统生物学观点。此外，该系统不仅使用户能够存储和分析自己的研究数据，而且还提供了与来自癌症基因组学的其他研究数据库的数据的比较视图。这将大大增加研究数据分析中可用信息的范围，并使科学调查能够采用新的方法。该系统将在一个公共实例中实现，每个人都可以根据各自的使用限制访问数据和分析选项。另一方面，每个机构都可以根据需要运行自己的本地实例，以使用该系统进行非公共存储和分析自己的研究数据。