Charakterisierung von Zielgenen des MADS-Box Gens DEFICIENS aus Antirrhinum majus mittels Makroarray- und Chromatin-Immunopräzipitations-Analysen
使用宏阵列和染色质免疫沉淀分析表征金鱼草 MADS 盒基因 DEFICIENS 的靶基因
基本信息
- 批准号:5403189
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- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Research Grants
- 财政年份:2003
- 资助国家:德国
- 起止时间:2002-12-31 至 2004-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
In den letzten Jahren wurde in Modelorganismen wie Antirrhinum majus, Arabidopsis thaliana und Petunia hybrida intensiv die Funktion von homöotischen MADS-Box Genen untersucht, die die Blütenoranogenese steuern. Es ist aber immer noch ungeklärt, welche Zielgene das regulatorische Potential dieser Transkriptionsfaktoren in den einzelnen Blütenwirteln realisieren. Das Modellsystem Antirrhinum bietet optimale Voraussetzungen, um die Fragestellung zu untersuchen. Es stehen Makroarrays mit mehr als 11.000 verschiedenen cDNA Klonen und eine konditionelle Mutante des MADS-Box Gens DEFICIENS für 'expressions-profiling' Analysen zur Verfügung. Die Größe der Antirrhinum Blüte ermöglicht, diese Untersuchungen Stadien- und Organ-spezifisch durchzuführen. Über einen Vergleich zwischen dem Sepalen- und Petalentraskriptom sollen Petalen-spezifische Gene identifiziert werden, aus denen mittels konditioneller Mutanten direkte und indirekte Zielgene ermittelt werden. Ob ausgewählte Zielgene unter einer direkten oder indirekten Kontrolle von DEF stehen, soll mit einer etablierten Chromatin-Immunopräzipitations Methode geklärt werden, die es ermöglicht, eine in vivo Bindung der Proteine an genomische DNA-Fragmente nachzuweisen.
近年来,在金鱼草、拟南芥和矮牵牛等模式生物中,发现了同源MADS盒基因的功能,即蓝斑病的发生。这是一个非常令人惊讶的事实,因为Zielgene的调节器在一个蓝色的物体上具有潜在的transskriptionsfaktoren。金鱼草的模型系统是最佳的,它可以用来分析碎片。这是一种使用梅尔11,000个验证cDNA克隆的小型微阵列,用于表达谱分析的MADS盒基因突变体。蓝色金鱼草的绿色部分,是通过体育场和器官的特殊性来实现的。通过对Sepalen-和Petalentraskriptom-的比较,可以识别出Petalen-特异性的基因韦尔登,从不同的突变体中直接识别出和间接识别出Zielgene韦尔登。通过一种简单的染色质免疫纯化方法,可以直接或间接控制DEF,从而在体内与蛋白质和基因组DNA片段结合。该方法韦尔登,可靠。
项目成果
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