Multi-scale structural analysis of membrane protein in cells by hyperpolarized NMR
Multi-scale structural analysis of membrane protein in cells by hyperpolarized NMR
批准号:
21K06046
负责人:
藤原 敏道
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2023-03-31
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相互作用する膜蛋白質に重点を置き細胞を対象にしてマルチスケールにわたる構造解析を行う方法の開発とその応用実証を行った。この課題で重要なのは,最先端のNMR測定法とその応用に最適な細胞試料調製法を組み合わせて解析を行うことである。NMRの低感度に対しては,温度20Kの高磁場動的核分極法(DNP)を用いて超偏極核スピン状態を作り出し,マジック角試料回転により高分解能NMR感度を5000倍向上させた。このための超偏極クライオNMR装置開発では,冷却Heガス循環法によって実用的で長時間安定して低温によりノイズも削減してNMR感度向上を実現した。これを応用して,感度の低い蛋白質・糖,蛋白質・脂質などについても分子間相互作用をNMR交差信号として検出できるようにした。従来のin-cell NMR法では,分子量5万以上の蛋白質検出が困難という制約を受けるが分解能で優れる溶液NMRが用いられていた。今回は,その分子量に関する選択性に影響されずに,全ての分子を定量的に測定できる固体NMR法を用いた。これを利用して細胞数計測と組み合わせて1細胞当たりの分子状態を反映した存在量を計測する。これで,運動性の低い膜蛋白質や重合体の構造解析を可能にした。細胞内の位置測定のために,イメージング法MRIで用いる常磁性造影剤とDNP用分極剤を用いて,細胞内の位置情報をNMR信号強度にエンコードした。このために造影剤Gd3+錯体が局在することで大腸菌表面を内部特別して選択的にNMR測定できることを示した。常磁性緩和促進と1Hスピン拡散により膜蛋白質と膜から離れて細胞内にある蛋白質を区別できることを示した。この解析には,相補的な構造情報を得られる電子顕微鏡細胞観察とも組み合わせた。
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A hybrid strategy combining solution NMR spectroscopy and isothermal titration calorimetry to characterize protein-nanodisc interaction
结合溶液核磁共振波谱和等温滴定量热法来表征蛋白质-纳米盘相互作用的混合策略
DOI:
10.1016/j.ab.2021.114521
发表时间:
2022
期刊:
Analytical Biochemistry
影响因子:
2.9
作者:
[Sugiki Toshihiko, Lee Young-Ho, Alsanousi Nesreen, Murata Kaito, Kawamura Izuru, Fujiwara Toshimichi, Hanada Kentaro, Kojima Chojiro]
通讯作者:
Kojima Chojiro
機能構造計測学研究室
功能结构计量实验室
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Cryogenic signal amplification combined with helium-temperature MAS DNP toward ultimate NMR sensitivity at high field conditions
低温信号放大与氦温 MAS DNP 相结合,可在高场条件下实现终极 NMR 灵敏度
DOI:
10.1016/j.jmr.2021.107139
发表时间:
2022
期刊:
Journal of Magnetic Resonance
影响因子:
2.2
作者:
[Matsuki Yoh, Nakamura Shinji, Hobo Fumio, Endo Yuki, Takahashi Hiroki, Suematsu Hiroto, Fujiwara Toshimichi]
通讯作者:
Fujiwara Toshimichi
DOI:
10.1007/s00723-022-01519-2
发表时间:
2023-01-05
期刊:
APPLIED MAGNETIC RESONANCE
影响因子:
1
作者:
[Suetake,Isao, Sato,Kazunobu, Arata,Toshiaki]
通讯作者:
Arata,Toshiaki
Evolution of α-synuclein conformation ensemble toward amyloid fibril via liquid-liquid phase separation (LLPS) as investigated by dynamic nuclear polarization-enhanced solid-state MAS NMR
通过动态核极化增强固态 MAS NMR 研究 α-突触核蛋白构象整体通过液-液相分离 (LLPS) 向淀粉样原纤维的演化
DOI:
10.1016/j.neuint.2022.105345
发表时间:
2022
期刊:
Neurochemistry International
影响因子:
4.2
作者:
[Mika Takamuku, Tomoaki Sugishita, Hajime Tamaki, Lingyingzi Dong, Masatomo So, Toshimichi Fujiwaraa, Yoh Matsuki]
通讯作者:
Yoh Matsuki
共 11 条
高磁場動的核分極固体NMRの生体系応用法の開発
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批准号:11F01798
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2011
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
脂質二重膜にある蛋白質ナノ複合体の固体NMRによる原子分解能構造解析
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批准号:19042017
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.97万
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财政年份:2007
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
F_0F_1-ATP合成酵素サブユニットcの固体NMR法による構造決定
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批准号:13033012
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2001
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
F_0F_1-ATP合成酵素サブユニットcの固体NMR法による構造解析
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批准号:11169214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:1999
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
NMRによるヒトリゾチームの変性構造解析
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批准号:10157208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1998
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
NMRによるリゾチーム非天然構造の比較
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批准号:09261209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
リゾチームの塩酸グアニジン変性構造の解析
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批准号:08272207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1996
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
リゾチームの塩酸グアニジン変性構造の解析
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批准号:08272207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1996
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
リゾチームの塩酸グアニジン変性構造の解析
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批准号:07280206
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1995
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
生体高分子構造解析の国体NMRによる二面角決定法の開発
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批准号:06858070
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1994
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负责人:藤原 敏道
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依托单位: