脂質二重膜にある蛋白質ナノ複合体の固体NMRによる原子分解能構造解析
脂質二重膜にある蛋白質ナノ複合体の固体NMRによる原子分解能構造解析
批准号:
19042017
负责人:
藤原 敏道
金额:
$3.97万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008
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これまでの研究成果を発展させて、250残基程度の膜蛋白質の構造決定できる方法を確立する。具体的には、同位体標識法、脂質二重膜への再構成法が確立しているATP合成酵素サブユニットc及びハロロドプシンを対象にした。膜貫通している疎水領域と膜外にある親水領域は運動性の違いから、分別してスペクトルを単純化して測定した。また、さらに単純化するためにアミノ酸選択的同位体標識も行った。これらの新しい方法と蛋白質内の核間距離測定法と蛋白質と脂質分子間の距離測定法を組み合わせて、二重膜にある膜蛋白質の構造決定を行った。一連の立体構造情報を取得して、また、データ解析による構造決定として次のことを行った。化学シフトから得た二面角と距離相関から得た情報を組み合わせて構造決定を行った。距離相関の帰属は、スペクトル分解能の制約から容易ではない。しかい、部分的に行ったように、距離相関のスピン対への帰属と構造決定を同時に行う方法で、構造を収束させながら、その構造情報も利用して距離相関情報のスピン対への帰属を行った。蛋白質の構造をほぼ決めた後に、リン脂質二重膜や水層の水との相対的位置関係を決める。また、このことからハロロドプシンのオリゴマー構造やサブユニットcのリング状の構造を決定する。サブユニットcについては、F0リング回転機構について提案されているモデル、グルタミン酸の電荷による構造変化、側鎖構造の変化などを構造から検証した。ハロロドプシンについては、脂質二重膜内におけるオリゴマー状態を初めて構造決定することにより、その光異性化によるポンプとしての機能を解明した。
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Structural Analysis of Pituitary Adenylate Cyclase-Activating Polypeptides Bound to Phospholipid Membranes by Magic Angle Spinning Solid-State NMR
通过魔角旋转固态核磁共振对与磷脂膜结合的垂体腺苷酸环化酶激活多肽进行结构分析
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Biochim.Biophys.Acta 1768
影响因子:
--
作者:
[N., Komi]
通讯作者:
Komi
Chemistry, Physics, and Biology in Macromolecular Science
高分子科学中的化学、物理和生物学
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[T., Kawata, Y., Takabayashi, A., Hashidzume, Y., Morishima, T., Sato, 佐藤尚弘(編者)]
通讯作者:
佐藤尚弘(編者)
A magic-angle-spinning NMR method for 1H-1H distance measurement using coherent polarization transfer in 13C-labeled organic solids.
一种利用 13C 标记有机固体中的相干偏振转移进行 1H-1H 距离测量的魔角旋转 NMR 方法。
DOI:
10.1063/1.2993170
发表时间:
2008
期刊:
The Journal of chemical physics
影响因子:
--
作者:
[Hiroki Takahashi, H. Akutsu, T. Fujiwara]
通讯作者:
T. Fujiwara
Spectral Fitting for Signal Assignment and Structural Analysis of Uniformly C^<13>-Labeled Solid Proteins by Simulated Annealing Based on Chemical Shifts and Spin Dynamics
基于化学位移和自旋动力学的模拟退火对均匀 C^<13> 标记的固体蛋白进行信号分配和结构分析的光谱拟合
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
J. Biomol. NMR 38
影响因子:
--
作者:
[Y, Matsuki]
通讯作者:
Matsuki
多次元固体NMR法による膜蛋白質pHtr IIの構造解析
多维固态NMR法分析膜蛋白pHtr II的结构
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takeda, S., 江川 文子]
通讯作者:
江川 文子
共 8 条
Multi-scale structural analysis of membrane protein in cells by hyperpolarized NMR
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批准号:21K06046
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2021
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
高磁場動的核分極固体NMRの生体系応用法の開発
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批准号:11F01798
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2011
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
F_0F_1-ATP合成酵素サブユニットcの固体NMR法による構造決定
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批准号:13033012
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2001
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
F_0F_1-ATP合成酵素サブユニットcの固体NMR法による構造解析
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批准号:11169214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:1999
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
NMRによるヒトリゾチームの変性構造解析
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批准号:10157208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1998
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
NMRによるリゾチーム非天然構造の比較
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批准号:09261209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
リゾチームの塩酸グアニジン変性構造の解析
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批准号:08272207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1996
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
リゾチームの塩酸グアニジン変性構造の解析
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批准号:08272207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1996
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
リゾチームの塩酸グアニジン変性構造の解析
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批准号:07280206
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1995
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
生体高分子構造解析の国体NMRによる二面角決定法の開発
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批准号:06858070
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1994
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负责人:藤原 敏道
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依托单位:
海外基金