システマチックアプローチによるMonogenic diabetes発症機序の解明

使用系统方法阐明单基因糖尿病的发病机制

基本信息

  • 批准号:
    21K06281
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

原因遺伝子不明のMODYの遺伝素因の解明を目的として、従来の候補遺伝子に的を絞ったパネル解析とは異なり、全エクソーム解析を用いた網羅的解析を行っている。これまでに単一遺伝子異常による糖尿病が疑われる患者パネルから、原因遺伝子が未同定の患者計72例を対象としてNovaSec6000を用いた全エクソーム解析を行ってきた。アウトプットデータのアノテーションに関しては、一般集団における頻度<0.02のバリアントを選択し、ClinVarデータベースやACMG/AMP guidelineによって病原性を判定した。さらに隠れマルコフモデルによるXHMMアルゴリズムにより遺伝子欠失のスクリーニングを行い、MLPAで確認した。VUSについてはヒト細胞を用いたレポーターアッセイを行い、バリアント機能を検討した。これまでの結果では、72例中20名においてMODY遺伝子内に存在する病原性意義が不明なバリアントを20種類検出した。これらの一部については機能解析を実施し、学会で発表後に論文化した。さらに、XHMM解析により遺伝子(全体若しくは一部)の欠失が疑われ、MLPAにより確認できた4例であった。我が国におけるMODYの診断率は従来20%程度とされてきたが、これらの網羅的かつ段階的な解析を組み合わせることで、最近4年間の解析事例に絞ると、全体で23例(1型糖尿病 6例、2型糖尿病 13例、糖尿病 3例、MODY 1例)中、14例(60.9%)で診断が確定できた。内訳はMODY1 4例、MODY2 4例、MODY3 3例、MODY5 1例、MODY12 1例、Wolfram症候群 1例であった。今後はさらに機能解析を進め、複数の家系で同定されている、2種類の糖尿病関連遺伝子内のVUSについて機能解析を含めた検討を行うことで、日本人(アジア人)特有の新規MODY遺伝子の同定につなげられる可能性が高い。
The cause of the unknown MODY element is explained by the purpose of the analysis, and the candidate element is analyzed by the method of the analysis. 72 cases of diabetes mellitus were diagnosed as having a genetic abnormality, and the cause of the abnormality was unknown. For the detection of antivirus data, the pathogen with a frequency of <0.02 in general groups was selected and determined based on ClinVar data and ACMG/AMP guidelines. XHMM is the first to identify the missing information in MLPA. VUS is the only way to get rid of the virus. The results showed that 20 out of 72 cases were found to be pathogenic, and 20 out of 72 cases were found to be pathogenic. This is a part of the analysis of the function of the implementation, learning to express after the discussion of culture XHMM analysis of the missing child (all if not one part), MLPA, confirmed the four cases The diagnosis rate of MODY in China has dropped from 20% to 60.9% in all 23 cases (6 cases of type 1 diabetes mellitus, 13 cases of type 2 diabetes mellitus, 3 cases of diabetes mellitus, 1 case of MODY). MODY1 4, MODY2 4, MODY3 3, MODY5 1, MODY12 1, Wolfram syndrome 1 In the future, functional analysis will be improved, multiple families will be identified, VUS will be included in functional analysis of 2 types of diabetes-related genes, and the possibility of identification of new MODY genes unique to Japanese will be high.

项目成果

期刊论文数量(40)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genetic screening for monogenic diabetes using whole exome sequencing in a single hospital cohort in Japan
在日本的一个医院队列中使用全外显子组测序对单基因糖尿病进行基因筛查
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Tanaka Satoshi;Akagawa Hiroyuki;Ogata Makiko;Iwasaki Naoko
  • 通讯作者:
    Iwasaki Naoko
WFS1遺伝子における新規複合ヘテロ接合性変異を認めたWolfram症候群の一例
WFS1 基因新型复合杂合突变的 Wolfram 综合征一例
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    氏家 淳;原澤 彰;三宅勇輝;奥村武憲;久保未央;古川 翔;原 健司;阿久澤有;篠﨑浩之;山内元貴;土屋天文;竹林晃三;岩崎直子;橋本貢士
  • 通讯作者:
    橋本貢士
遺伝医学 朝倉内科学 12版
基因医学朝仓内科第12版
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Nagi Kohno;Yoshihiro H. Inoue;岩崎直子
  • 通讯作者:
    岩崎直子
ガイドラインにないリアル糖尿病薬物療法をガイドする(部分執筆、「ミトコンドリア糖尿病」)
指南中未包含的真正糖尿病药物治疗指南(部分写为“线粒体糖尿病”)
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kazuki Takarada;Yoshihiro H. Inoue;岩崎直子
  • 通讯作者:
    岩崎直子
ルーブリック評価概論
评分标准概述
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Juri Kinoshita;Suzuko Kinoshita;Yoshihiro H. Inoue;岩崎直子
  • 通讯作者:
    岩崎直子
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  • 资助金额:
    $ 2.66万
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