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システマチックアプローチによるMonogenic diabetes発症機序の解明

システマチックアプローチによるMonogenic diabetes発症機序の解明
使用系统方法阐明单基因糖尿病的发病机制
批准号:
21K06281
负责人:
岩崎 直子
金额:
$2.66万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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原因遺伝子不明のMODYの遺伝素因の解明を目的として、従来の候補遺伝子に的を絞ったパネル解析とは異なり、全エクソーム解析を用いた網羅的解析を行っている。これまでに単一遺伝子異常による糖尿病が疑われる患者パネルから、原因遺伝子が未同定の患者計72例を対象としてNovaSec6000を用いた全エクソーム解析を行ってきた。アウトプットデータのアノテーションに関しては、一般集団における頻度<0.02のバリアントを選択し、ClinVarデータベースやACMG/AMP guidelineによって病原性を判定した。さらに隠れマルコフモデルによるXHMMアルゴリズムにより遺伝子欠失のスクリーニングを行い、MLPAで確認した。VUSについてはヒト細胞を用いたレポーターアッセイを行い、バリアント機能を検討した。これまでの結果では、72例中20名においてMODY遺伝子内に存在する病原性意義が不明なバリアントを20種類検出した。これらの一部については機能解析を実施し、学会で発表後に論文化した。さらに、XHMM解析により遺伝子(全体若しくは一部)の欠失が疑われ、MLPAにより確認できた4例であった。我が国におけるMODYの診断率は従来20%程度とされてきたが、これらの網羅的かつ段階的な解析を組み合わせることで、最近4年間の解析事例に絞ると、全体で23例(1型糖尿病 6例、2型糖尿病 13例、糖尿病 3例、MODY 1例)中、14例(60.9%)で診断が確定できた。内訳はMODY1 4例、MODY2 4例、MODY3 3例、MODY5 1例、MODY12 1例、Wolfram症候群 1例であった。今後はさらに機能解析を進め、複数の家系で同定されている、2種類の糖尿病関連遺伝子内のVUSについて機能解析を含めた検討を行うことで、日本人(アジア人)特有の新規MODY遺伝子の同定につなげられる可能性が高い。
期刊论文(40)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Genetic screening for monogenic diabetes using whole exome sequencing in a single hospital cohort in Japan
在日本的一个医院队列中使用全外显子组测序对单基因糖尿病进行基因筛查
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Tanaka Satoshi, Akagawa Hiroyuki, Ogata Makiko, Iwasaki Naoko]
通讯作者: Iwasaki Naoko
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [氏家 淳, 原澤 彰, 三宅勇輝, 奥村武憲, 久保未央, 古川 翔, 原 健司, 阿久澤有, 篠﨑浩之, 山内元貴, 土屋天文, 竹林晃三, 岩崎直子, 橋本貢士]
通讯作者: 橋本貢士
遺伝医学 朝倉内科学 12版
基因医学朝仓内科第12版
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Nagi Kohno, Yoshihiro H. Inoue, 岩崎直子]
通讯作者: 岩崎直子
ガイドラインにないリアル糖尿病薬物療法をガイドする(部分執筆、「ミトコンドリア糖尿病」)
指南中未包含的真正糖尿病药物治疗指南(部分写为“线粒体糖尿病”)
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Kazuki Takarada, Yoshihiro H. Inoue, 岩崎直子]
通讯作者: 岩崎直子
20
    全ゲノム解析結果に基づいた2型糖尿病候補遺伝子解析と糖尿病網膜症関連遺伝子の解析
    • 批准号:
      16012261
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.84万
    • 财政年份:
      2004
    • 负责人:
      岩崎 直子
    • 依托单位:
    全ゲノム解析結果に基づいた2型糖尿病候補遺伝子の解析と糖尿病網膜症関連遺伝子の解析
    • 批准号:
      15012250
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $4.22万
    • 财政年份:
      2003
    • 负责人:
      岩崎 直子
    • 依托单位:
    日本人2型糖尿病原因遺伝子の全ゲノム解析結果に基づいた2型糖尿病候補遺伝子の検討
    • 批准号:
      14013059
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.97万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      岩崎 直子
    • 依托单位:
    日本人2型糖尿病原因遺伝子の全ゲノムレベル解析とクローニング
    • 批准号:
      13204082
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
    • 资助金额:
      $3.97万
    • 财政年份:
      2001
    • 负责人:
      岩崎 直子
    • 依托单位:
    海外基金