EBウイルスによるDNAメチル化誘導機構の解明と新規上咽頭癌治療法の開発

阐明EB病毒诱导DNA甲基化机制及开发鼻咽癌治疗新方法

• 批准号: 21K09627
• 负责人: 近藤 悟
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kanazawa University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K09627/
• 关键词: EBV; 上咽頭癌; DNAメチル化

本研究の目的は、EBV陽性/陰性上咽頭癌細胞株と生検組織のDNAメチル化状態とEBV遺伝子発現レベルの解析を行い、EBV関連胃癌のデータと比較し上咽頭癌のメチル化標的遺伝子を明らかにすることである。そして、細胞株を用いたEBV感染モデルのDNAメチル化パターンの変化と遺伝子発現への影響を評価する。最後に新規化合物のポリアミド 薬剤を用いメチル化標的遺伝子を活性化させ腫瘍形成能を評価する。発癌に影響を与えるのは、どのメチル化標的遺伝子が重要なのか比較し、治療への応用に向け検討を重ねる。昨年度までに上咽頭癌組織およびEBV陽性/陰性上咽頭癌細胞株のDNAメチル化状態とEBV遺伝子発現レベルを解析し、解析結果は既に解析済みのEBV関連胃癌のデータと比較し、上咽頭癌のメチル化標的遺伝子の抽出を行った。上咽頭癌組織が51サンプル、コントロールの正常上咽頭組織52サンプルを解析した。Infinium 850Kビーズアレイ、パイロシークエンサー解析にて、標的遺伝子メチル化を検証し、宿主・EBV 遺伝子発現レベルをRNA-seqで解析した。これらのデータ取得後に、EBV感染の有無とEBV遺伝子発現レベルで層別化し、クラスター解析を行うとともに、EBV陽性胃癌８例のデータと照合し特異的標的遺伝子を抽出した。具体的にはDerlin-3(DERL3)という遺伝子が上咽頭癌のメチル化遺伝子として抽出されている。本年は上咽頭癌細胞株および他のEBV関連腫瘍の細胞株を用いたEBV感染モデルのDNAメチル化パターンの変化と遺伝子発現への影響を評価する。EBV陰性上咽頭癌細胞株HK-1, EBV陰性上咽頭上皮細胞株NP69、NP460、リコンビナントEBVのAkata-EBV を感染させ、経時的に核酸を抽出し評価した。更にEBV感染胃癌モデル細胞と比較をおこなった。

这项研究的目的是分析EBV阳性/阴性/阴性鼻咽癌细胞系和活检组织的DNA甲基化状态和EBV基因表达水平，并阐明与与EBV相关的胃癌的数据相比，鼻咽癌的甲基化靶基因。然后评估使用细胞系的DNA甲基化模式的变化以及对EBV感染模型基因表达的影响。最后，一种新型的化合物聚酰胺剂用于激活甲基化靶基因并评估致瘤潜能。我们比较哪些甲基化靶基因对影响癌症很重要，并继续检查其在治疗应用中的应用。直到去年，我们分析了鼻咽癌组织的DNA甲基化状态和EBV基因表达水平和EBV阳性/阴性鼻咽癌细胞系，并比较已经分析了EBV与EBV相关的胃癌的数据，并提取了鼻咽癌的甲基化靶基因。分析了51个鼻咽癌组织和52个对照正常鼻咽组织的样品。使用Infinium 850K珠阵列和焦磷酸素素分析验证了靶基因甲基化，并使用RNA-Seq分析了宿主EBV基因表达水平。获取这些数据后，通过存在或不存在EBV感染和EBV基因表达水平，进行了群集分析，并将来自八个EBV阳性胃癌病例的数据进行分层，以提取特定的靶基因。具体而言，已将基因DERLIN-3（DERL3）作为鼻咽癌提取为甲基化基因。今年，我们将使用鼻咽癌和其他与EBV相关的肿瘤的细胞系评估EBV感染模型中DNA甲基化模式的变化以及对基因表达的影响。细胞被EBV阴性鼻咽癌细胞系HK-1，EBV阴性鼻咽上皮细胞系NP69，NP460和Akata-EBV，重组EBV和核酸及时提取并评估。此外，与EBV感染的胃癌模型细胞进行了比较。

项目成果

Relathionship between APOBEC3 expression and viral genome hypermutation and integration in HPV-related oropharyngeal cancers

HPV相关口咽癌中APOBEC3表达与病毒基因组超突变和整合的关系

• 发表时间: 2021
• 作者: Endo Kazuhira;Ueno Takayoshi;Hirai Nobuyuki;Komori Takeshi;Nakanishi Yosuke;Kondo Satoru;Wakisaka Naohiro;Yoshizaki Tomokazu;近藤 悟;Satoru Kondo
• 通讯作者: Satoru Kondo

Intra-arterial chemotherapy targeting metastatic cervical lymph nodes in head and neck cancer

针对头颈癌转移性颈部淋巴结的动脉内化疗

• DOI: 10.1080/00016489.2021.2003858
• 发表时间: 2021
• 期刊: Acta Oto-Laryngologica
• 影响因子: 1.4
• 作者: Murono Shigeyuki;Komori Takeshi;Endo Kazuhira;Kondo Satoru;Wakisaka Naohiro;Yoshizaki Tomokazu
• 通讯作者: Yoshizaki Tomokazu

Genome sequence analysis clarifies Epstein-Barr virus genome variations enhance clinicopathological features of nasopharyngeal cancer in a non-endemic region, Japan

基因组序列分析阐明 Epstein-Barr 病毒基因组变异增强日本非流行地区鼻咽癌的临床病理特征

• 发表时间: 2021
• 作者: Endo Kazuhira;Ueno Takayoshi;Hirai Nobuyuki;Komori Takeshi;Nakanishi Yosuke;Kondo Satoru;Wakisaka Naohiro;Yoshizaki Tomokazu;近藤 悟;Satoru Kondo;Satoru Kondo
• 通讯作者: Satoru Kondo

全ゲノムシークエンスによる上咽頭癌の非流行地域のEpstein Barrウイルス亜型の解析とその臨床的意義

鼻咽癌非流行地区EB病毒亚型全基因组测序分析及其临床意义

• 发表时间: 2021
• 作者: Endo Kazuhira;Ueno Takayoshi;Hirai Nobuyuki;Komori Takeshi;Nakanishi Yosuke;Kondo Satoru;Wakisaka Naohiro;Yoshizaki Tomokazu;近藤 悟
• 通讯作者: 近藤 悟

Epstein-Barrウイルス感染と上咽頭癌

EB病毒感染与鼻咽癌

• 发表时间: 2021
• 作者: Endo Kazuhira;Ueno Takayoshi;Hirai Nobuyuki;Komori Takeshi;Nakanishi Yosuke;Kondo Satoru;Wakisaka Naohiro;Yoshizaki Tomokazu;近藤 悟;Satoru Kondo;Satoru Kondo;近藤 悟
• 通讯作者: 近藤 悟