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次世代シークエンサーを用いた鼻腔内混合感染の実態調査および重症化リスクの検証

使用新一代测序仪调查混合鼻感染的实际情况并验证加重的风险

基本信息

批准号：
20K17196
负责人：
大野歩
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Okayama University (2021)Tokai University (2020)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2022-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

鼻腔は多くの呼吸器感染症の原因となる各種病原微生物が侵入・定着する場所である。そのことから、呼吸器感染症の予防および治療には鼻腔の細菌叢を効果的に制御することが重要であることがすでに報告されている。本研究では、2017年に開発された感染症診断用のポータブル型ゲノム解析システムを基盤とし、ナノポアDNAシークエンサーによる鼻腔内の細菌叢および呼吸器ウイルスを網羅的に検出可能な技術の開発を目的の一つとして挙げている。2021年度では課題2として設定した「呼吸器ウイルスの検出技術の確立」について、3種のRNAウイルス(RSウイルス、ライノウイルス、パラインフルエンザウイルス)を購入し、検討した。ゲノム抽出法および次世代シークエンサー解析用のライブラリ調製方法の検討の結果、網羅的に検出可能であることが示唆された。また検出効率の低いウイルスの存在が懸念されるものの、サンプル中のウイルスゲノムが少量であっても、PCR増幅せずに検出可能な方法であることが期待された。このことから、見出した方法を用いて呼吸器感染症患者から採取された鼻腔ぬぐい液18例からの細菌およびウイルスの検出を試みた。その結果、細菌検出では慢性副鼻腔炎との関連が報告されているPeptoniphilus lacydonensisが検出し、本研究の症例との関連性を検討している。また、ウイルス検出では、多数のウイルスが検出されたものの、残念ながら本研究の症例との関連性が疑われるウイルスは検出されなかった。今後は症例数を増やし検討を進める予定である。

The causes of respiratory infections in the nasal cavity are various pathogenic microorganisms. The prevention and treatment of respiratory infections are important for the control of nasal flora. This study is aimed at identifying possible technologies for the development of bacterial flora in nasal cavities and respiratory tract systems for the diagnosis of infectious diseases developed in 2017. In 2021, the second issue was set up in the "Establishment of Respirator Detection Technology", and three kinds of RNA (RS, RS, RS) were purchased and discussed. The results of the investigation of the method of extraction and the next generation of the modulation method for the analysis of the network are shown in this paper. The presence of low detection rate and low detection rate is expected to increase the detection rate of PCR products. 18 cases of respiratory infection were detected by nasal cavity fluid. The results of this study, the association between bacterial detection and chronic paranasal sinusitis were reported. Peptoniphilus lacydonensis was detected. The association between the symptoms of this study and chronic paranasal sinusitis was discussed. However, most of the symptoms were detected, and the connection between the symptoms and the findings in this study was questionable. In the future, the number of cases will increase.