Integrated platform for analyzing the modes of actions of natural products

分析天然产物作用模式的综合平台

• 批准号: 21H02073
• 负责人: 中尾 洋一
• 金额: $ 11.15万
• 依托单位: Waseda University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02073/
• 关键词: 天然小分子; 作用メカニズム; 作用メカニズム解明; 天然化合物

本研究では化合物の作用メカニズムを明らかにするためのプラットフォームを構築することを目的として、『①半田ビーズを用いた標的タンパク質の釣り上げ』に加え、『②shRNA／CRISPR-Cas9スクリーニング法』『③RNAシーケンス解析』『④セルベースヒストン修飾解析』という異なるレベルの機能的なスクリーニング・解析を行うことで、各種天然化合物の標的タンパク質や作用経路を絞り込むための研究を行うことを目的としている。2022年度は、海綿由来の細胞毒性天然環状ペプチドkapakahineの標的候補タンパク質として浮かび上がった、ミトコンドリアタンパク質のプロヒビチン１（PHB1）、PHB2、アデニンヌクレオチドトランスロカーゼ２（ANT2）について作用メカニズムにかかわる機能を検証した。特に、がん抑制遺伝子の発現を誘導するPHB2タンパク質は、乳がん細胞においてはBIG3との複合体形成によってその核移行が抑制されることが知られているため、kapakahineがこの複合体形成に影響を及ぼす可能性について検証した。一方、いずれもアストロサイトへの分化誘導活性を示した春ウコン由来のコロナリンDおよび味噌由来のフェルラ酸エチルエステルについて『②shRNA／CRISPR-Cas9スクリーニング法』による標的遺伝子の解析を行った。また、海綿由来の細胞毒性物質onnamideの新規類縁体について単離・構造決定を行い、細胞毒性およびヒストン修飾調節活性について構造―活性相関解析を行うことで、作用メカニズムについて検討を行った。

This study で は compound の role メ カ ニ ズ ム を Ming ら か に す る た め の プ ラ ッ ト フ ォ ー ム を build す る こ と を purpose と し て, "(1) half field ビ ー ズ を with い た mark タ ン パ ク げ の fishing り on" に え, "(2) the shRNA/CRISPR - Cas9 ス ク リ ー ニ ン グ method" "(3) RNA シ ー ケ ン ス parsing" "(4) セ ル ベ ー ス ヒ ス ト ン modified analytic "と い う different な る レ ベ ル の functionary な ス ク リ ー ニ ン グ line, parse を う こ と で, all kinds of natural compounds の mark タ ン パ ク qualitative や role を 経 road ground り 込 む た め の を line う こ と を purpose と し て い る. 2022 annual は, sponge origin の cytotoxicity natural cyclic ペ プ チ ド kapakahine の mark alternate タ ン パ ク qualitative と し て floating か び on が っ た, ミ ト コ ン ド リ ア タ ン パ ク qualitative の プ ロ ヒ ビ チ ン 1 (PHB1 and PHB2, ア デ ニ ン ヌ ク レ オ チ ド ト ラ ン ス ロ カ ー ゼ 2 (ANT2) に つ い て メ role Youdaoplaceholder0 わる わる function を検 certificate た た. に, が ん inhibit heritage 伝 son の 発 now を induced す る PHB2 タ ン パ ク は, milk が ん cells に お い て は BIG3 と の complex formation に よ っ て そ の nuclear migration が inhibit さ れ る こ と が know ら れ て い る た め, kapakahine が こ の complex formation に influence を and ぼ す possibility に つ い て 検 card し た. Party, い ず れ も ア ス ト ロ サ イ ト へ を の differentiation inducing activity in し た spring ウ コ ン origin の コ ロ ナ リ ン D お よ び miso origin の フ ェ ル ラ acid エ チ ル エ ス テ ル に つ い て "(2) the shRNA/CRISPR - Cas9 ス ク リ ー ニ ン グ method" に よ る mark heritage 伝 son の parsing line を っ た. ま た, sponge origin の cytotoxic substance onnamide の new rules class try body に つ い て 単 from tectonic line decision を い, cytotoxicity お よ び ヒ ス ト ン decorate adjust active に つ い て tectonic line - active phase analytical を masato う こ と で, function メ カ ニ ズ ム に つ い て 検 line for を っ た.

项目成果

春ウコンに含まれるアストロサイト分化誘導促進物質の同定

春姜黄中促进星形胶质细胞分化诱导物质的鉴定

• 发表时间: 2023
• 期刊: 化学と生物
• 作者: Tone Yuichiro;Mamchaoui Kamel;Tsoumpra Maria K.;Hashimoto Yasumasa;Terada Reiko;Maruyama Rika;Gait Michael J.;Arzumanov Andrey A.;McClorey Graham;Imamura Michihiro;Takeda Shin'ichi;Yokota Toshifumi;Wood Matthew J.A.;Mouly Vincent;Aoki Yoshitsugu;大塚悟史，中尾洋一
• 通讯作者: 大塚悟史，中尾洋一

クローズアップ実験法 BiPoD：正確かつ高効率な両アレルノックイン新手法

近距离实验方法BiPoD：新型精准高效双等位基因敲入方法

• 发表时间: 2022
• 期刊: 実験医学
• 作者: Tianli Zhang;Hiroyasu Tsutsuki;Motohiro Nishida;Takaaki Akaike;Tomohiro Sawa;新井大祐，中尾洋一
• 通讯作者: 新井大祐，中尾洋一

コーヒー生豆由来ヒストン修飾調節活性物質の探索

寻找源自生咖啡豆的组蛋白修饰调节活性物质

• 发表时间: 2022
• 作者: 山口昂太;木室佑亮;寄立麻琴;平井剛;藤井怜子，中村文彬，中尾洋一
• 通讯作者: 藤井怜子，中村文彬，中尾洋一

Alotamide B, a New Cyclic Depsipeptide Isolated from Assemblies of Marine Cyanobacteria, Mainly Consisting of Moorena sp.

• DOI: 10.1246/cl.230035
• 发表时间: 2023-04-01
• 期刊: CHEMISTRY LETTERS
• 影响因子: 1.6
• 作者: Aihara，Kohshi;Nakamura，Fumiaki;Nakao，Yoichi
• 通讯作者: Nakao，Yoichi

Preparation and Application of a Chemical Probe for Identifying the Targets of the Marine Cyclic Peptide Kapakahine A.

• DOI: 10.3390/molecules27031072
• 发表时间: 2022-02-05
• 期刊: Molecules (Basel, Switzerland)
• 作者: Kamihira R;Nakao Y
• 通讯作者: Nakao Y