Development of a universal genomic method for the species identification and phylogenetic analysis of parasitic worms

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本研究の目的は、18Sリボソーム遺伝子の塩基配列だけでは決定できない属から亜種のレベルでの系統関係を、幅広い寄生虫に対して高い信頼性で明らかにできる標準法を確立することである。2022年度は、新規に得られた両生類寄生性および爬虫類寄生性の種を含めたStrongyloides属の系統解析とマンソン孤虫と芽殖孤虫の分泌タンパク質の網羅的解析を実施した。糞線虫の虫体は、ホンハブ、シマヘビ、イエアメガエル、ミーアキャット、ムツオビアルマジロから採取した。個別虫体からゲノムDNAを調整して塩基配列を取得し、ミトコンドリアゲノム上のタンパク質コード配列に基づく分子系統解析と核ゲノム遺伝子11個を用いた多遺伝子座系統解析を実施した。核遺伝子の結果では、これまでに明らかにしてきたヒト糞線虫/タヌキ糞線虫群と乳頭糞線虫群に加えて、新たに両生類・爬虫類群amphibian/reptile infecting groupを糞線虫属内の明確な種グループとして見出すことができた。ドブネズミを宿主とするネズミ糞線虫と新世界ザル寄生性のS. cebusは、単独で糞線虫属の基部に近いところに位置していた。ただし、ミトコンドリアゲノムでの系統解析の結果では若干の種において食い違いがみられた。今後は、鳥類に寄生する糞線虫を加えて属内系統解析をおこないたい。マンソン孤虫と芽殖孤虫の分泌タンパク質の網羅的解析では、それぞれ800個程度のタンパク質を同定し、量的な比較から各種に特異的に多い分泌タンパク質を明らかにした。