肉用牛における肥育状態の生体評価法の開発と産肉制御の分子機構の解明

肉牛育肥状态生物学评价方法的建立及产肉控制分子机制的阐明

• 批准号: 20H03134
• 负责人: 松本 和也
• 金额: $ 8.24万
• 依托单位: Kindai University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20H03134/
• 关键词: バイオマーカータンパク質; 枝肉形質; 機械学習; 肉用牛; 生体評価; 肥育牛; プロテオミクス解析; 生体評価法

（研究課題A）黒毛和種肥育牛（去勢）の産肉形質を生体評価する予測モデルの構築：令和2～3年度に引き続き、黒毛和種肥育牛（去勢）の生後9ヶ月から28ヶ月齢の間で採材したサンプルを供試して、既に確立した定量プロテオミクスSWATH法による血清タンパク質135種類の多項目同時定量解析を行ない、定量情報と経時的な動態情報を獲得した。また、枝肉成績（枝肉重量・ロース芯面積・バラの厚さ・皮下脂肪の厚さ・歩留基準値・脂肪交雑・オレイン酸濃度）を目的変数として、構築する予測モデルにあった特徴量（説明変数）を作成し、線形の回帰タスク（LASSO, IFSによる変数選択と重回帰分析）を実施して予測モデルの構築を行なった。（研究課題B）肥育期間中の産肉形質の発育シミュレーションモデルの構築：研究課題Aで構築された生体評価予測モデルで予測精度の高いモデル（枝肉重量）の特徴量（説明変数）（同定された血清バイオマーカータンパク質）の生理学的機能を、公共データベース（令和３年度に導入したIPAソフトウェア含む）を用いたバイオインフォマティクス解析によって推測した。さらに、得られた血清バイオマーカータンパク質の推定される生理学的機能情報とその動態と、血清生化学値の動態を入力データとして、黒毛和種肥育牛（去勢）の肥育期間中の産肉形質の発育シミュレーションモデル（β版）を構築した。さらに、飼料試験サンプルを用いたシミュレーションモデルの構築も実施し、飼料添加物の試験区において、複数のタンパク質群の動態の変化する時期が変化していることを確認した。

(Research Topic A) <s:1> Meat production texture of black-haired and fattening cattle (castrated) を biological evaluation 価する pretest モデ construction: Make and 2 ~ 3 year に き 続 き, black hair and a kind of fattening cattle (castration) の ヶ 9 month after birth か ら ヶ 28 months 齢 の で mining material between し た サ ン プ ル を selected し て, establishment of both に し た quantitative プ ロ テ オ ミ ク ス SWATH method に よ る serum タ ン パ ク quality more than 135 kinds の line projects at the same time the quantitative analytical を な い, quantitative information と 経 な dynamic intelligence を won Got た た. ま た, branches of meat performance (branch meat weight ロ ー ス core area, バ ラ の thick さ, hypodermic and adipose thick の さ, step left benchmark nt, fat pay 雑, オ レ イ ン acid concentration) を purpose - several と し て, constructing す る be モ デ ル に あ っ た, 徴 quantity (number of variations) を make し, linear の back 帰 タ ス ク (LASSO, If the による variable of IFS is selected as 択と to return to 帰 for analysis, を apply て to pre-test モデ を <s:1> construct を rows なった. (Research Topic B) Construction of <s:1> meat production shape and quality <s:1> during fattening period シ シ ュレ ュレ ショ ショ モデ <e:1> シ : Research topic A で build さ れ た raw body review 価 be モ デ ル で to high measuring accuracy の い モ デ ル meat weight (branches) の 徴 quantity (number of variations) (with fixed さ れ た serum バ イ オ マ ー カ ー タ ン パ ク qualitative) の を physiology function, public デ ー タ ベ ー ス (make and 3 year に import し た IPA ソ フ ト ウ ェ ア む) を with い た バ イ オ イ ン フ ォ マ Youdaoplaceholder0 ス ス analysis によって inference た. さ ら に, ら れ た serum バ イ オ マ ー カ ー タ ン パ ク qualitative の presumption さ れ る physiology function of intelligence と そ の dynamic と, serum biochemistry numerical の dynamic を デ into force ー タ と し て, black hair and a kind of fattening cattle (castration) の fattening period in の meat character の 発 yukon シ ミ ュ レ ー シ ョ ン モ デ ル (beta version) を build し た. さ ら に, feed test サ ン プ ル を with い た シ ミ ュ レ ー シ ョ ン モ デ ル の build も be し, feed additive の test area に お い て, plural の タ ン パ ク mass group の dynamic の variations change す が る period - the し て い る こ と を confirm し た.

项目成果

肥育期間中の血清タンパク質情報を用いた黒毛和種去勢牛の枝肉形質予測モデル式構築 の試み

尝试构建利用育肥期血清蛋白信息预测日本黑牛胴体性状的模型公式

• 发表时间: 2021
• 作者: Miura Hiroto;Jimbo Itsuki;Oda Machi;Noguchi Michiko;Kawasaki Kiyonori;Osada-Oka Mayuko;Tsukahara Takamitsu;Inoue Ryo;田口太郎;村上賢・下河史枝・佐藤礼一郎・恩田賢・舟場正幸;村井篤嗣;石田真結子・岩川奈生・足助聡一郎・黒田慶子・梶村恒・升屋勇人・亀山統一;田口太郎;稲垣京子・原珠里;松橋珠子・池上春香・笠原喜斗・東口奈那美・吉廣卓哉・村瀬華梨・杉本智明 ・大羽真理 ・高取等 ・渡邉智・加藤博己・永井宏平 ・宮本圭 ・ 松本和也
• 通讯作者: 松橋珠子・池上春香・笠原喜斗・東口奈那美・吉廣卓哉・村瀬華梨・杉本智明 ・大羽真理 ・高取等 ・渡邉智・加藤博己・永井宏平 ・宮本圭 ・ 松本和也

血清中タンパク質を用いた肉用牛産肉形質の生体肥育診断システムが肥育農家経営に及ぼす影響の検討

检查使用血清蛋白的肉牛肉性状生物育肥诊断系统对育肥农场管理的影响

• 发表时间: 2022
• 作者: 升屋勇人;梶村恒;辻本悟志;池上春香・長野晟大・松橋珠子・永井宏平・宮本圭・加藤博己・松本和也
• 通讯作者: 池上春香・長野晟大・松橋珠子・永井宏平・宮本圭・加藤博己・松本和也

肥育期間中の血清タンパク質情報を用いた黒毛和種去勢牛の枝肉格付成績予測の試み

利用育肥期血清蛋白信息预测日本黑牛胴体分级性能的尝试

• 发表时间: 2022
• 作者: Zi-Ru Jiang;Hayato Masuya;Norikazu Kameyama;Keiko Kuroda;Hisashi Kajimura;稲垣京子・原珠里;吉成香貫花・前田滋哉・福田信二・黒田久雄;鈴木 宣弘;池上甲一;松橋珠子・池上春香・東口奈那美・村瀬華梨・大羽真理・渡邉智・加藤博己・ 永井宏平・吉廣卓哉・松本和也
• 通讯作者: 松橋珠子・池上春香・東口奈那美・村瀬華梨・大羽真理・渡邉智・加藤博己・ 永井宏平・吉廣卓哉・松本和也