课题基金 / 基金详情

プロテオーム解析を用いた直接的アプローチ法による薬剤標的同定解析システムの開発

プロテオーム解析を用いた直接的アプローチ法による薬剤標的同定解析システムの開発
使用蛋白质组分析的直接方法开发药物靶点识别分析系统
批准号:
20K05857
负责人:
室井 誠
金额:
$2.75万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
(I) CETSAとChemProteoBaseを組み合わせた解析システム(2DE-CETSA)の構築:化合物が標的タンパク質に結合する時の熱安定性変化を利用したセルサーマルシフトアッセイ(CETSA)法と2次元電気泳動(2DE)に基づくプロテオーム解析を組み合わせた新規の標的タンパク質解析法の2DE-CETSAの解析基盤を整えた。2DE-CETSAの手法、あるいは、関連手法である植物細胞のタンパク質同定について、広く利用される様に、解析手法の詳細について、Methods in Enzymologyにまとめた(Muroi M, Osada H. Methods Enzymol, 675 :425-437, 2022, Moon JY, et al, Methods Enzymol, 680: 421-438, 2023)。(II) 2DE-CETSAを用いた新規化合物の解析による解析系の有用性の証明:がん細胞の増殖阻害を指標にスクリーニングで得られた、標的分子の知られていない活性物質、あるいは、植物細胞を標的とした化合物について2DE-CETSAを用いた解析を行い、標的候補タンパク質を見出し、解析を行った。また、中国との共同研究で、植物由来のIsoquercitrinについて、2DE-CETSAを用いた解析を行い、複数のタンパク質に作用してAMPK/SREBP-1c/FAS/CD36 シグナル伝達経路を経て、抗肥満効果をもたらすことを明らかにした(Manzoor M, et al Food Funct, 13(21): 10923-10936, 2022)。さらに、標的未知の化合物であるAllantopyrone Aの作用解析についても行い、化合物がプロテアソーム系に作用していることが明らかになった(Okuda C, et al. J Antibiot, in press, 2023)。
英文摘要
(I) CETSAとChemProteoBaseを組み合わせた解析システム(2DE-CETSA)の構築:化合物が標的タンパク質に結合する時の熱安定性変化を利用したセルサーマルシフトアッセイ(CETSA)法と2次元電気泳動(2DE)に基づくプロテオーム解析を組み合わせた新規の標的タンパク質解析法の2DE-CETSAの解析基盤を整えた。2DE-CETSAの手法、あるいは、関連手法である植物細胞のタンパク質同定について、広く利用される様に、解析手法の詳細について、Methods in Enzymologyにまとめた(Muroi M, Osada H. Methods Enzymol, 675 :425-437, 2022, Moon JY, et al, Methods Enzymol, 680: 421-438, 2023)。(II) 2DE-CETSAを用いた新規化合物の解析による解析系の有用性の証明:がん細胞の増殖阻害を指標にスクリーニングで得られた、標的分子の知られていない活性物質、あるいは、植物細胞を標的とした化合物について2DE-CETSAを用いた解析を行い、標的候補タンパク質を見出し、解析を行った。また、中国との共同研究で、植物由来のIsoquercitrinについて、2DE-CETSAを用いた解析を行い、複数のタンパク質に作用してAMPK/SREBP-1c/FAS/CD36 シグナル伝達経路を経て、抗肥満効果をもたらすことを明らかにした(Manzoor M, et al Food Funct, 13(21): 10923-10936, 2022)。さらに、標的未知の化合物であるAllantopyrone Aの作用解析についても行い、化合物がプロテアソーム系に作用していることが明らかになった(Okuda C, et al. J Antibiot, in press, 2023)。
期刊论文(22)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Identification of a small molecule that enhances ferroptosis via inhibition of FSP1.
鉴定通过抑制 FSP1 增强铁死亡的小分子。
DOI: 10.1021/acschembio.2c00028
发表时间: 2022
期刊: ACS Chemical Biology
影响因子: 4
作者: [Yoshioka H, Kawamura T, Muroi M, Kondoh Y, Honda K, Kawatani M, Aono H, Waldmann H, Watanabe N, Osada H.]
通讯作者: Osada H.
Isolation of novel chemical components and their plant target proteins under selenium stress
硒胁迫下新型化学成分及其植物靶蛋白的分离
DOI: 10.1016/bs.mie.2022.07.035
发表时间: 2023
期刊: Methods Enzymol
影响因子: --
作者: [Moon Ju Yeon, Miyazaki Takae, Muroi Makoto, Watanabe Nobomoto, Shin Ryoung]
通讯作者: Shin Ryoung
Two-dimensional electrophoresis-cellular thermal shift assay (2DE-CETSA) for target identification of bioactive compounds.
二维电泳细胞热位移测定 (2DE-CETSA) 用于生物活性化合物的靶标鉴定。
DOI: 10.1016/bs.mie.2022.07.018
发表时间: 2022
期刊: Methods Enzymol
影响因子: --
作者: [Muroi M, Osada H]
通讯作者: Osada H
Allantopyrone A interferes with the degradation of hypoxia-inducible factor 1α protein by reducing proteasome activity in human fibrosarcoma HT-1080 cells.
Allantopyrone A 通过降低人纤维肉瘤 HT-1080 细胞中的蛋白酶体活性来干扰缺氧诱导因子 1α 蛋白的降解。
DOI: 10.1038/s41429-023-00610-5
发表时间: 2023
期刊: J Antibiot
影响因子: 3.3
作者: [Okuda C, Ueda Y, Muroi M, Sanada E, Osada H, Shiono Y, Kimura KI, Takeda K, Kawaguchi K, Kataoka T]
通讯作者: Kataoka T
13
    MSベースのプロテオームプロファイリングに基づく薬剤標的解析システムの構築
    プロテオミックス的手法を用いた薬剤作用解析システムの構築
    選択的阻害剤を用いたスフィンゴ脂質の合成と細胞内転送過程の解析
    選択的阻害剤の作用特性の違いを利用した液砲型ATPaseの構造と機能の解析
    海外基金