课题基金 / 基金详情

一本鎖DNA固定化水晶発振子を用いるDNA塩基対形成の定量的評価

一本鎖DNA固定化水晶発振子を用いるDNA塩基対形成の定量的評価
使用单链 DNA 固定晶体振荡器定量评估 DNA 碱基配对
批准号：
05453203
负责人：
岡畑 恵雄
金额：
$4.54万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
财政年份：
1993
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
1993 至 1994
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-05453203/
关键词：
DNA水晶発振子ハイブリダイゼーション

项目摘要

项目成果

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本研究は、一本鎖DNA固定化した水晶発振子を用いて水溶液中でのターゲットDNAとの塩基対形成(Hybridaization)を振動数の経時変化から、定量的に評価することを目的として行われ、以下のような成果が得られた。1)M13phageDNA(7250量体)のEcoRI認識部位(dGGGAATTCGT)と相補的な塩基配列をもち、5'位末端にSH基を導入したオリゴヌクレオチド(dCCCTTAAGCA)を合成し、9MHz,AT-cutの水晶発振子の金電極上にSH-金基板との相互作用を利用して固定化した。2)オリゴヌクレオチド(プローブ)固定化発振子を水溶液中に入れ、ターゲットDNAとして、塩基配列の異なるオリゴヌクレオチド(10量体)を水溶液中に加えた時の振動数変化から発振子上でのハイブリダイゼーション量をngレベルで定量することができた。また、振動数の経時的変化から二本鎖形成の過程や解離の動力学を求めたところ,温度を上昇したり,塩橋度を上昇させると結合定数が低下した。これは,結合速度が変化したのではなく,解離速度が大きくなったために結果として結合定数が減少することが明らかとなった。3)さまざまな塩基配列を持つターゲットのオリゴヌクレオチドを合成し、ハイブリダイゼーション量、二本鎖形成速度、解離速度などを求め、二本鎖形成のために必要な塩基配列などを検討した。その結果,塩基配列の中央付近にミスマッチを導入すると結合定数が大きく低下し,これは解離速度が上昇するためであることがわかった。
期刊论文(18)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
K.Ijiro and Y.Okahata: "A DNA-Lipid Complex soluble in Organic Solvents" J.Chem.Soc.,Chem.Commun.1339-1341 (1992)
K.Ijiro 和 Y.Okahata：“可溶于有机溶剂的 DNA-脂质复合物”J.Chem.Soc.,Chem.Commun.1339-1341 (1992)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Y.Ebara,H.Ebato,K.Ariga,Y.Okahata: "Interaction of Ca2+ ions with Phospholipid Membranes.Studies on P-A Isotherms,Electrochemical,and Quartz-Crystal Microbalance Measurements" Langmuir. 10. 2267-2271 (1994)
Y.Ebara、H.Ebato、K.Ariga、Y.Okahata：“Ca2 离子与磷脂膜的相互作用。P-A 等温线、电化学和石英晶体微天平测量的研究”Langmuir。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Y.Okahata,K.Yasunaga,and K.Ogura: "Imprinted Chiral Molecular Recognition in Dipeptides Aggregates immobilized on a Quartz-Crystal Microbalance" J.Chem.Soc.,Chem.Commun.469 (1994)
Y.Okahata、K.Yasunaga 和 K.Ogura：“石英晶体微天平上固定的二肽聚集体中的印迹手性分子识别”J.Chem.Soc.，Chem.Commun.469 (1994)
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Y.Okahata,Y.Matsuzaki: "Detection of Dye-Intercalation Behaviors into DNAs by using a Quartz-Crystal Microbalance" Sensors and Actuators B,Chemical. 13. 380-383 (1993)
Y.Okahata、Y.Matsuzaki：“使用石英晶体微天平检测染料插入 DNA 的行为”传感器和执行器 B，化学。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 9 条
    振幅可変型水晶発振子を用いる複雑系タンパク質間相互作用の解明
    • 批准号：
      16655066
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.11万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      岡畑 恵雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    振幅変動型水晶発振子を用いる複雑系タンパク質の相互作用の解明
    • 批准号：
      14658184
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.11万
    • 财政年份：
      2002
    • 负责人：
      岡畑 恵雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    一分子ポリマーサイエンス
    • 批准号：
      13895022
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $2.05万
    • 财政年份：
      2001
    • 负责人：
      岡畑 恵雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    超臨界流体中での脂質修飾酵素を用いる酵素触媒反応
    • 批准号：
      13875180
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $1.41万
    • 财政年份：
      2001
    • 负责人：
      岡畑 恵雄
    • 依托单位：
      Tokyo Institute of Technology
    海外基金