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大腸菌由来7α-ヒドロキシステロイド脱水素酵素の動的X線結晶構造解析

大腸菌由来7α-ヒドロキシステロイド脱水素酵素の動的X線結晶構造解析
大肠杆菌7α-羟基类固醇脱氢酶的动态X射线晶体结构分析
批准号:
09780600
负责人:
野中 孝昌
金额:
$1.41万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
1997
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1997 至 1998

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
ケージ化グリコケノデオキシコール酸(caged GCDCA)の溶液に7α-ヒドロキシステロイド脱水素酵素の結晶を一昼夜浸した後、取り出してキャピラリーに封入し、高エネルギー加速器研究機構所放射光研究施設のビームライン18Bにおいて光を当てない状態でラウエ回折強度データを収集した。1フレームにつき20ミリ秒の露出とし、10゚(スピンドル軸の角度)間隔で合計6フレームの撮影を行った。キャピラリーをゴニオメータヘッドに取り付けたまま、照明を点灯し、1時間後に再度、同じ条件でラウエ回折強度データを収集した。反応の前後の2つのデーターセットに対し、結晶構造解析を行い、酵素反応の前後での構造の比較を行った。400×800mm^2の大型イメージングプレートを用いて収集したラウエ回折強度データは、プログラムLAUEGENを用いて処理を行った。積分強度の波長に対する規格化を行った後、すべてのフレームのデータをマージして一つのデータセットとした。プログラムREFMACを用いて酵素反応の前後の立体構造の精密化を行い、両者の比較を行った。両者とも差フーリエ図上にグリコケノデオキシコール酸、あるいはその反応産物に対応する電子密度分布を観測することはできなかった。そもそも、ケージ化グリコケノデオキシコール酸が7α-ヒドロキシステロイド脱水素酵素の結晶に導入されていなかった可能性がある。
英文摘要
ケージ化グリコケノデオキシコール酸(caged GCDCA)の溶液に7α-ヒドロキシステロイド脱水素酵素の結晶を一昼夜浸した後、取り出してキャピラリーに封入し、高エネルギー加速器研究機構所放射光研究施設のビームライン18Bにおいて光を当てない状態でラウエ回折強度データを収集した。1フレームにつき20ミリ秒の露出とし、10゚(スピンドル軸の角度)間隔で合計6フレームの撮影を行った。キャピラリーをゴニオメータヘッドに取り付けたまま、照明を点灯し、1時間後に再度、同じ条件でラウエ回折強度データを収集した。反応の前後の2つのデーターセットに対し、結晶構造解析を行い、酵素反応の前後での構造の比較を行った。400×800mm^2の大型イメージングプレートを用いて収集したラウエ回折強度データは、プログラムLAUEGENを用いて処理を行った。積分強度の波長に対する規格化を行った後、すべてのフレームのデータをマージして一つのデータセットとした。プログラムREFMACを用いて酵素反応の前後の立体構造の精密化を行い、両者の比較を行った。両者とも差フーリエ図上にグリコケノデオキシコール酸、あるいはその反応産物に対応する電子密度分布を観測することはできなかった。そもそも、ケージ化グリコケノデオキシコール酸が7α-ヒドロキシステロイド脱水素酵素の結晶に導入されていなかった可能性がある。
期刊论文(9)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
M.Irie: "Biochemistry of frog ribonucleases." Cell Mol.Life Sci.54. 775-784 (1998)
M.Irie:“青蛙核糖核酸酶的生物化学。”
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
N.Niimura: "Neutron Laue diffractometry with an imaging plate provides an effective data collectiou regime for neutron protein crystallography." Nat.Struct.Biol.4. 909-914 (1997)
N.Niimura:“使用成像板的中子劳厄衍射法为中子蛋白晶体学提供了有效的数据收集方案。”
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
T.Tanabe: "Roles of the Ser146,Tyr159,and Lys163 residues in the catalytic action of 7α-hydroxysteroid dehydrogenase from Escherichia coli." J.Biochem.(Tokyo). 124. 634-641 (1998)
T.Tanabe:“Ser146、Tyr159 和 Lys163 残基在大肠杆菌 7α-羟基类固醇脱氢酶的催化作用中的作用。J.Biochem.(东京)124. 634-641 (1998)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
6
    超高分解能X線結晶構造解析によるファミリー18キチナーゼの反応機構の解明
    • 批准号:
      13780528
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额:
      $1.41万
    • 财政年份:
      2001
    • 负责人:
      野中 孝昌
    • 依托单位:
    芳香環を直接水酸化できる多成分ジオキシゲナーゼBphAの立体構造と機能
    • 批准号:
      99F00181
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $0.51万
    • 财政年份:
      2000
    • 负责人:
      野中 孝昌
    • 依托单位:
    センチニクバエ由来NF-kB様転写因子5-kDa蛋白質のX線結晶構造解析
    • 批准号:
      11160205
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
    • 资助金额:
      $1.09万
    • 财政年份:
      1999
    • 负责人:
      野中 孝昌
    • 依托单位:
    集合系マシーナリーとしての微生物の芳香環分解代謝系の構造生物学
    • 批准号:
      11169215
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $54.66万
    • 财政年份:
      1999
    • 负责人:
      野中 孝昌
    • 依托单位:
    海外基金