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脊椎動物の形態的・生理的特性を支える進化的.遺伝的基盤の解明

阐明支持脊椎动物形态和生理特征的进化和遗传基础

基本信息

批准号：
09740566
负责人：
颯田葉子
金额：
$ 1.28万
依托单位：
The Graduate University for Advanced Studies
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份：
1997
资助国家：
日本
起止时间：
1997 至 1998
项目状态：
已结题

项目摘要

1. 脊椎動物の体制の特徴の一つである未知の外来抗原に反応する予見的免疫システムの獲得の過程を明らかにするために、下等脊椎動物であるヌタウナギのゲノムライブラリーの構築を進めた。昨年度までにヌタウナギの血球細胞を分離し、高分子量のDNAが単離されていることを確認している。100ないし300kbのゲノム断片を含むライブラリーの構築を目指したが、実際にベクターに取り込まれているゲノム断片のサイズは50ないし80kbとなりシンテニーを検出するには小さな断片となった。今後は、このライブラリーからNotch遺伝子を含むクローンを分離し、オーバーラップクローンを単離していく。更に、大きなゲノム断片を含むライブラリーづくりを続ける。2. MHC遺伝子座領域の進化の様相を明らかにするには、この領域でのゲノム再編のメカニズムを知ることが必要である。昨年度はヒトMHC遺伝子座領域を用いてこの領域での組み換え率の推定を試みたが、本年度は、この解析をMHC遺伝子座近傍の4000kbの領域に拡大した。その結果、MHC遺伝子座近傍の広範な領域での組み換え率は、1Mbが1cMから0.1cMに相当した。推定値に大きな開きがあるのは、MHC遺伝子座から離れるにつれ多型の程度が中立に近づくため、10倍の組み換え率を区別するのに十分な配列データが入手できなかったことによる。今後は、高い組み換え率の推定値の精度をあげるために、ヒトのMHC遺伝子座近傍領域の塩基配列決定とともに、同じ様な解析を下等脊椎動物やキョク皮動物を用いて行い、ゲノムの組み換え率が生物を問わず一定であるかどうかを検証する。

1. The structural characteristics of vertebrates are characterized by the acquisition of unknown foreign antigens and the construction of immune systems in lower vertebrates. Last year, we identified the presence of high molecular weight DNA in isolated blood cells. 100 kb to 300kb fragment to include the construction of the target, in fact, the selection of the target fragment to 50 kb to 80kb fragment to include the construction of the target fragment. In the future, the number of entries in the list will be changed from zero to zero, and the number of entries will be changed from zero to zero. More information about the new website. 2. It is necessary to understand the evolution of the MHC gene domain. Last year, the MHC gene domain was used in the field, and the estimated conversion rate of the domain was tested. This year, the analysis of the MHC gene domain was expanded to 4000kb. As a result, the rate of change in the region near the MHC locus is 1Mb from 1 cM to 0.1 cM. Presumption of large open range, MHC sequence separation, polytype degree, neutral close range, 10-fold group conversion rate, differential ten-fold alignment, starting range In the future, the accuracy of the estimated value of the high and middle group conversion rate will be determined by the determination of the base alignment in the near field of the MHC gene loci. The same analysis will be performed on the lower vertebrates and the lower vertebrates.