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ビブリオ属細菌の2つの環状レプリコンよりなる染色体についての研究

ビブリオ属細菌の2つの環状レプリコンよりなる染色体についての研究
弧菌两个环状复制子染色体的研究
批准号:
11770139
负责人:
飯田 哲也
金额:
$1.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份:
1999
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1999 至 2000

项目摘要

项目成果

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腸炎ビブリオ(Vibrio parahaemolyticus)についてはゲノムプロジェクトが2000年から本格的に動きだしており、2000年11月現在、ランダムフェーズの80,000クローンの塩基配列解析が完了している。一般に細菌の染色体は1個の環状DNAからなると考えられているが、われわれが腸炎ビブリオの染色体遺伝子地図の作製を行った結果、本菌の染色体は3.2Mbと1.9Mbの2つの環状DNAからなることが明らかになった。本研究では、腸炎ビブリオ近縁の菌種がどこまでこのようなゲノム構造をとっているかについて検討を行った。また、昨年ゲノム配列が報告されたコレラ菌(Vibrio cholerae)と腸炎ビブリオの染色体構造の比較を行った。腸炎ビブリオに近縁のビブリオ属またはビブリオ科細菌のゲノムDNAについて、制限酵素処理を行わずにパルスフィールド電気泳動を行い、染色体数とサイズを決定した。その結果、検討した範囲においてすべてのビブリオ属細菌は2つの染色体を有していた(図)。ビブリオ属以外の比較的近縁菌としては、Pseudoalteromonas haloplanktisが2つの染色体をもつことが示唆された。また、腸炎ビブリオとコレラ菌の染色体の遺伝子地図を比較した結果、それぞれの菌で大きい方の染色体および小さい方の染色体に存在する遺伝子はほぼ共通していることが示唆された。今回の結果から、腸炎ビブリオでみられる2つの染色体からなるゲノム構造は系統進化上、ビブリオ属の分岐の頃にできたものであると考えられた。腸炎ビブリオとコレラ菌の大小各染色体上に存在する遺伝子がほぼ共通しているという成績もこのことを支持する。今後より詳細にこれらビブリオ属細菌の染色体構造を比較していくことで、2つの染色体からなるゲノム構造がどのようにして形成されたかについて明らかにしていきたい。
期刊论文(22)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Sawata et al.: "Applcation of peptide nucleic acid to the direct detection of deoxynbonudoic acid."Biosonsors Bioelectronics. 14. 397-404 (1999)
Sawata 等人:“肽核酸在脱氧核糖酸直接检测中的应用。”Biosonsors Bio electronics。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Park et al.: "Genetic characterization of DNA region containing the trh and ure genes of Vibrio parahaemolyticus"Infect.Immun. 68. 5742-5748 (2000)
Park 等人:“含有副溶血弧菌 trh 和 ure 基因的 DNA 区域的遗传特征”Infect.Immun。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Makino et al.: "Complete nucleotide sequences of 93-kb and 3.3kb plasmido of an enterohemonhagic Eschericha coli 0157: H7 derived from Sakai outbreak,"DNA Res.. 5. 1-12 (1998)
Makino 等人:“肠出血性大肠杆菌 0157 的 93-kb 和 3.3kb 质粒的完整核苷酸序列:来自酒井爆发的 H7”,DNA Res.. 5. 1-12 (1998)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Yamaichi Y.,Iida T.et al.: "Physical and genetic map of the genome of Vibrio parahaemohyticus: presence of two chumosomos in Vibrio Species"Mol.Microbiol.. 31. 1513-1522 (1999)
Yamaichi Y.,Iida T.等人:“副溶血弧菌基因组的物理和遗传图谱:弧菌物种中存在两种 chumosomos”Mol.Microbiol.. 31. 1513-1522 (1999)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
11
    Distribution of type three secretion system genes and their association with the diarrheagenicity of genus Providencia
    • 批准号:
      23KF0152
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.34万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      飯田 哲也
    • 依托单位:
    Genomic survey of enteric pathogens in India for developing anti-adhesion therapies
    • 批准号:
      20KK0183
    • 项目类别:
      Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
    • 资助金额:
      $11.9万
    • 财政年份:
      2020
    • 负责人:
      飯田 哲也
    • 依托单位:
    2つの環状染色体よりなるビブリオ属細菌染色体の複製・分配機構と進化についての研究
    • 批准号:
      13206044
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
    • 资助金额:
      $2.88万
    • 财政年份:
      2001
    • 负责人:
      飯田 哲也
    • 依托单位:
    2つの環状染色体よりなるビブリオ属細菌染色体の複製・分配機構と進化についての研究
    • 批准号:
      12206054
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
    • 资助金额:
      $0.0万
    • 财政年份:
      2000
    • 负责人:
      飯田 哲也
    • 依托单位:
    海外基金