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2つの環状染色体よりなるビブリオ属細菌染色体の複製・分配機構と進化についての研究

研究弧菌细菌染色体的复制/分离机制和进化，该染色体由两条环状染色体组成。

基本信息

批准号：
12206054
负责人：
飯田哲也
金额：
--
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12206054/
关键词：
腸炎ビブリオコレラ菌染色体ゲノム進化

项目摘要

腸炎ビブリオ(Vibrio parahaemolyticus)は長年にわたり日本国内における食中毒原因の上位を占めている。一般に細菌の染色体は1個の環状DNAからなると考えられているが、われわれが腸炎ビブリオの染色体遺伝子地図の作製を行った結果、本菌の染色体は3.2Mbと1.9Mbの2つの環状DNAからなることが明らかになった。本研究では、腸炎ビブリオ近縁の菌種がどこまでこのようなゲノム構造をとっているかについて検討を行った。また、昨年ゲノム配列が報告されたコレラ菌(Vibrio cholerae)と腸炎ビブリオの染色体構造の比較を行った。腸炎ビブリオに近縁のビブリオ属またはビブリオ科細菌のゲノムDNAについて、制限酵素処理を行わずにパルスフィールド電気泳動を行い、染色体数とサイズを決定した。その結果、検討した範囲においてすべてのビブリオ属細菌は2つの染色体を有していた。ビブリオ属以外の比較的近縁菌としては、Pseudoalteromonas haloplanktisが2つの染色体をもつことが示唆された。また、腸炎ビブリオとコレラ菌の染色体の遺伝子地図を比較した結果、それぞれの菌で大きい方の染色体および小さい方の染色体に存在する遺伝子はほぼ共通していることが示唆された。今回の結果から、腸炎ビブリオでみられる2つの染色体からなるゲノム構造は系統進化上、ビブリオ属の分岐の頃にできたものであると考えられた。腸炎ビブリオとコレラ菌の大小各染色体上に存在する遺伝子がほぼ共通しているという成績もこのことを支持する。今後より詳細にこれらビブリオ属細菌の染色体構造を比較していくことで、2つの染色体からなるゲノム構造がどのようにして形成されたかについて明らかにしていきたい。

Vibrio parahaemolyticus (Vibrio parahaemolyticus) is the main cause of food poisoning in Japan. In general, the chromosome of bacteria has one circular DNA fragment, and the chromosome of this bacterium has 3.2Mb and 1.9Mb circular DNA fragments. In this study, we discussed the structure of the bacteria in the vicinity of enteritis. A comparative study of the chromosome structure of Vibrio choleras and Vibrio choleras was carried out. Enteritis is caused by DNA sequencing, restriction enzyme processing, electrokinetic sequencing, chromosome number and chromosome number. As a result, the chromosome number of the bacteria was reduced to 2. The chromosomes of Pseudoalteromonas haloplanktis and Pseudoalteromonas haloplanktis were detected. The results of comparison of chromosome DNA sequences of bacteria with those of other bacteria showed that chromosome DNA sequences of bacteria with large and small chromosomes were common. The results of this study are as follows: 1. The evolution of structural system, 2. The differentiation of genetic system, 3. The gene expression in each chromosome of enteritis is common to all strains. In the future, we will compare the chromosome structure of bacteria belonging to this genus in detail.