未知の広範囲遺伝子欠失断端の簡単な同定法の開発、および本法による疾患多様性の解明

开发一种简单的方法来识别未知的大范围基因缺失残端，并使用该方法阐明疾病多样性

• 批准号: 16659143
• 负责人: 服部 幸夫
• 金额: $ 1.66万
• 依托单位: Yamaguchi University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16659143/
• 关键词: PCR; Real-Time PCR; gene deletion; thalassemia; breakpoint; 定量的PCR; 遺伝子欠失; βサラセミア; αサラセミア

平成16年度に広範囲欠失の詳細な欠失断端を、定量的PCR (LightCycler)と新たに開発したJunction PCRを用いて比較的簡単に同定出来る方法を開発した。そして、日本人には発見されていなかったεγδβ-サラセミアの4例3家系(39,46,118kb欠失)の同定に成功した。本年度はさらに発展して、εγδβ-サラセミア2家系(各1.41,1.4Mbの欠失)、βサラセミア1家系(116kb欠失)、δβサラセミア6家系(27kb欠失)、逆位のδβサラセミア1家系の同定に成功した。最後のケース以外は全て報告のない新しい変異であった。本法によって、従来FISHが効力を発揮していた1Mbを越える広汎欠失の症例も簡単に同定可能であり、しかも厳密な欠失段端をも決定することが可能であることが証明された。本法が遺伝子分析上、画期的な方法であることが分かる。一方、成功していなかったαグロビン遺伝子群の分析の検討を行い、欠失断端近辺に高度の繰り返し配列があるとreal-time PCRが困難であることが明確となった。このような配列の攻略は今後の課題として残る。これらの広範囲欠失はいずれも相同組み換えではないことも明らかとなった。上記の5種類のεγδβ-サラセミアに関しては、ゲノムプロジェクトのデーターベースより、多数のolfactory domainがβグロビン遺伝子群とともに欠失していることが判明しているが、その他に有意な遺伝子が少なく、一見表現型の差は見出されなかった。「嗅覚」の微妙な違いに関しては検査法がない。一方、εγδβ-サラセミアで見られる出生時の貧血の重篤化は症例による差が観察された。

Pp.47-53 16 year に hiroo van 囲 owe lost の な owe end を loss in detail and quantitative PCR (LightCycler) と new た に open 発 し た Junction PCR を with い て comparison of Jane 単 に method with fixed out る を open 発 し た. そ し て, Japanese に は 発 see さ れ て い な か っ た epsilon gamma delta beta サ ラ セ ミ ア の 4 cases 3 family (39,46,118 KB owe loss) with fixed に の successful し た. Exhibition this year は さ ら に 発 し て, epsilon gamma delta beta サ ラ セ ミ ア 2 lines (1.41, 1.4 Mb の owe loss), beta サ ラ セ ミ ア 1 family (116 KB owe lost), the delta beta サ ラ セ ミ ア six department (27 KB owe loss), inverse の delta beta サ ラ セ ミ ア 1 family の with fixed に successful し た. Finally, except for <s:1> ケ ス ス ス, all <s:1> report て the <s:1> な ケ new <s:1> changes であった. This law に よ っ て, 従 to FISH が services を 発 swing し て い た 1 MB を more え る hiroo generic owe cases lost の も Jane 単 に may be で あ り, し か も 厳 dense な owe loss period end を も decided す る こ と が may で あ る こ と が prove さ れ た. This method が leaves 伝 sub-analysis, and the な method for drawing periods である る とが is divided into る る. Party, successful し て い な か っ た alpha グ ロ ビ ン heritage 伝 subgroup analysis の の beg を 検 い, owe end nearly loss 辺 に highly の Qiao り return し match column が あ る と real - time PCR が difficult で あ る こ と が clear と な っ た. <s:1> ような ような to list the <s:1> strategy for future <s:1> topics と て て る る. こ れ ら の hiroo van 囲 owe lost は い ず れ も み in same group え で は な い こ と も Ming ら か と な っ た. Written の 5 kinds の epsilon gamma delta beta サ ラ セ ミ ア に masato し て は, ゲ ノ ム プ ロ ジ ェ ク ト の デ ー タ ー ベ ー ス よ り, most の olfactory Domain が beta グ ロ ビ ン heritage 伝 subgroup と と も に owe lost し て い る こ と が.at し て い る が, そ の に he intentionally な heritage 伝 son が less な く, a see poor phenotypes の は さ れ な か っ た. "Smell 覚" <s:1> subtle な violation of <s:1> に related to <s:1> て 検 検 examination method がな 検. One party, εγδβ-サラセ サラセ アで アで see られる cases of <s:1> anemia and <s:1> severe atelecization <e:1> at birth による poor が観 observation された.

项目成果

A novel ^Gγ^Aγ(δβ)^O-thalassemia with a 27 kb deletion

一种新型 ^Gγ^Aγ(δβ)^O-地中海贫血，具有 27 kb 缺失

• 发表时间: 2005
• 期刊: Hemoglobin. 29(3)
• 作者: Shuto H;Yamauchi A;Ikeda M;Sohda Y;Koga A;Tominaga K;Egawa T;Kataoka Y;Mamiko Kai et al.;日野未奈子;Yasuhiro Yamashiro
• 通讯作者: Yasuhiro Yamashiro

1.4Mbの広範囲欠失による新しいεγδβサラセミアの1例

由于 1.4 Mb 的广泛缺失而导致新的 εγδβ 地中海贫血病例。

• 发表时间: 2005
• 期刊: 臨床血液 47(8)
• 作者: Shuto H;Yamauchi A;Ikeda M;Sohda Y;Koga A;Tominaga K;Egawa T;Kataoka Y;Mamiko Kai et al.;日野未奈子;Yasuhiro Yamashiro;古谷知江美
• 通讯作者: 古谷知江美

ATRX(X-linked a thalassemia with mental retardation)の遺伝子異常の検索

寻找 ATRX 基因异常（X 连锁地中海贫血伴智力低下）

• 发表时间: 2005
• 期刊: 臨床病理 52・補冊
• 作者: 高橋優三;鈴木康之;編著(藤崎和彦;丹羽雅之;加藤智美 分担執筆);太田節夫;日野未奈子;Yasuhiro Yamashiro;古谷知江美;日野未奈子;西田愛恵
• 通讯作者: 西田愛恵

未知の広範囲遺伝子欠失の欠失断端決定法Junction PCR

连接 PCR，一种确定未知大范围基因缺失的缺失残端的方法

• 发表时间: 2006
• 期刊: 臨床血液 (accepted)
• 作者: Shuto H;Yamauchi A;Ikeda M;Sohda Y;Koga A;Tominaga K;Egawa T;Kataoka Y;Mamiko Kai et al.;日野未奈子
• 通讯作者: 日野未奈子

新生児に見つかった1.4Mbの広範囲遺伝子欠失による新規のεγδβサラセミア症例

新生儿因 1.4 Mb 广泛基因缺失而导致 εγδβ 地中海贫血的新病例

• 发表时间: 2005
• 期刊: 日本遺伝子診療学
• 作者: Shuto H;Yamauchi A;Ikeda M;Sohda Y;Koga A;Tominaga K;Egawa T;Kataoka Y;Mamiko Kai et al.;日野未奈子;Yasuhiro Yamashiro;古谷知江美;日野未奈子
• 通讯作者: 日野未奈子