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う触ワクチンの標的としてのGTF発現制御遺伝子のin silico同定

计算机模拟鉴定 GTF 表达控制基因作为龋齿疫苗的靶标

基本信息

批准号：
16659574
负责人：
藤原卓
金额：
$ 2.11万
依托单位：
Nagasaki University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16659574/
关键词：
グルコシルトランスフェラーゼ Stretococcus mutans rgg Streptococcus mutans

项目摘要

ミュータンスレンサ球菌は、gtf遺伝子でコードされる酵素クルコシルトランスフェラーゼ(GTF)を産生する。このGTFはスクロースを基質とし、粘着性グルカンを合成し、プラークバイオフィルムを形成する。従ってこのGTFが齲蝕の主要な病原因子であり、このGTFの発現を抑制すればう蝕の予防が図られる。そこで我々は、抗う蝕ワクチン開発の標的としてGTF発現制御遺伝子に着目した。まず、これまで我々が研究をしてきたStreptococcus oralisのGTF発現制御遺伝子であるrggに注目し、これと相同性が高い遺伝子をStreptococcus mutans全ゲノムのデータベースで検索した。その結果、HTHやMutR familyといった転写制御遺伝子と相同性が高いことを明らかにした。しかし、ゲノム上の配置が離れていることからこれらの遺伝子がS.mutans gtfの発現に関与する確証が得られなかった。そこで、ミュータンスレンサ球菌と他のレンサ球菌種の16S-23S rRNA intergenic spacer遺伝子について解析してS.mutansと近縁のレンサ球菌の進化学的類縁関係を明らかにした。その一方で、rggおよびgtfのレンサ球菌種における遺伝子の水平伝播についても解析を進め、S.oralisは、トランスポゾンによりrggとgtfを獲得した形跡があることをつきとめ、さらにgtf遺伝子の進化学的解析からS.oralisのgtfは最も新しい世代のものであることも明らかにした。そしてこれよりも世代の古いS.mutans gtf遺伝子は、進化の過程でゲノムの再編成によりrggのような転写制御遺伝子と分断され、この遺伝子はgtf遺伝子の発現制御ばかりではなく、他の遺伝子の発現制御も司るためにゲノム上の最適な位置に転移した可能性があるという結論に至った。

The production of GTF by bacteria and gtf genes The GTF is composed of a matrix and an adhesive matrix. This GTF is the main causative factor of caries, and the occurrence of this GTF is inhibited. The GTF has developed a system for detecting and detecting the presence of the virus. The GTF of Streptococcus oralis was developed by the authors of this paper. The result is that the HTH MutR family has the same identity as the family. For example, if you want to change the configuration, you can change the configuration of the S.mutans gtf. The genetic relationship between S.mutans and other species of S. aureus was clarified by analyzing the 16S-23S rRNA intergenic spacer gene. The analysis of horizontal propagation of genes in S.oralis, S. The evolution process of the ancient S.mutans gtf genetic code must be reorganized into the genetic code, and the genetic code must be divided into the genetic code and the genetic code must be reorganized into the genetic code.