網羅的ゲノム1次構造異常解析と発現プロファイリングを応用した新規膵癌治療戦略

应用全面的基因组一级结构异常分析和表达谱分析的新型胰腺癌治疗策略

• 批准号: 19659346
• 负责人: 山上 裕機
• 金额: $ 1.98万
• 依托单位: Wakayama Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19659346/
• 关键词: 膵臓外科学; 包括的ゲノム解析

本研究は、網羅的DNA1次構造異常解析と網羅的遺伝子発現プロファイリングを統合することで、膵癌特異的遺伝子の同定を試みた。まず膵癌摘出標本における凍結サンプルを薄切した後、マイクロダイセクションにより膵癌細胞のみを回収した。そのDNAとRNAを抽出し、DNAはGeneChip Mapping Array10OKに、RNAはGeneChip Human plus U133arrayにかけ、網羅的遺伝子解析を行った。膵癌1次構造異常解析において、homozygous deletionを認めた領域はch3p24.1-p23, ch9p21.3, chgp22.3, ch9q22.32, ch17p12, ch18q21.1の6カ所であった。このうち2サンプル以上(10%)で認めたのは2カ所で、ch9p21.3が9サンプル(45%)とch18q21.1が5サンプル(25%)であった。この2領域の候補遺伝子は前者がCDKN2A(p16),CDKN2B(p15)およびMTAPで、後者はSMAD4であった。次に膵癌におけるLOH領域の同定を試みた。LOH領域のうち、最も頻度が高い領域はch17p13.3-p11.2で18サンプル(90%)、ch9p23-p22.3, ch18q22.1, ch18q22.3で17サンプル(85%)、ch9p21.3, ch18q12.3-q21.1で16サンプル(80%)であった。そのうちch17p13.3-p11.2の18サンプルのうち1サンプルで一部homozygous deletion領域を認め、ch9p21.3ではLOHの16サンプルに加え3サンプルにhomozygous deletionを認め、ch18q12.3-q21.1では16サンプルのうち5サンプルの一部にhomozygous deletion領域を認めた。3copy以上の増幅を認めた領域はch18q11.1-q11.2で9サンプル(45%)と最も頻度が高く、続いてch1q21.1-q23.1, ch1q23.3-q24.1, ch1q42.2-q44, ch7p, ch8q24.21, ch17q12-q21.32で5サンプル(25%)であった。Homozygous deletion領域における候補遺伝子群のRNA発現量の絶対値はいずれも200未満で、ほとんど発現を認めず、DNA1次構造とその発現に矛盾を認めなかった。Hemizygous deletion領域における候補遺伝子群のうち、CDKN2A, CDKN2B, SMAD4の遺伝子発現プロファイルを検討した。SMAD4における1copyサンプルの発現量は、2copyサンプルと0copyサンプルの平均発現量の間に認め、また最大発現量サンプルと最小発現量サンプルとの比は2.1であった。一方、CDKN2AとCDKN2Bにおける1copyサンプルの発現量には、サンプル間で大きなばらつきを認め、最大発現量と最小発現量の比はそれぞれ5.2と3.0であった。このことは、SMAD4の発現量はcopy数に大きく影響を受けるのに対し、CDKN2AとCDKN2Bの発現量はcopy数のみならず、メチル化などのeventに左右されていることが示唆きれた。

は this study, a net DNA1 times tectonic anomaly analytic と snare of 伝 son 発 now プ ロ フ ァ イ リ ン グ を integration す る こ と で, Cui cancer specific heritage 伝 son の be を try み た. Pick the specimen に ま ず Cui carcinoma お け る freeze サ ン プ ル を thin slice し た, マ イ ク ロ ダ イ セ ク シ ョ ン に よ り Cui cancer の み を 収 back し た. そ の DNA を drew し と RNA, DNA は GeneChip Mapping Array10OK に, RNA は GeneChip Human plus U133array に か け line, the net but 伝 analytical を っ た. Analysis of the first structural anomaly of 膵 cancer にお 膵 て て, homozygous deletionを recognize the であった in the めた domain of カ ch3p24.1-p23, ch9p21.3, chgp22.3, ch9q22.32, ch17p12, ch18q21.1 カ 6カ. こ の う ち 2 サ ン プ ル (10%) above で recognize め た の は 2 カ で, ch9p21. 3 が 9 サ ン プ ル (45%) と ch18q21. 1 が 5 サ ン プ ル (25%) で あ っ た. こ の 2 areas の alternate heritage 伝 son は former が CDKN2A (p16), CDKN2B (p15) お よ び MTAP で, the latter は SMAD4 で あ っ た. In the field of に膵 cancer におけるLOH, the を test みた was conducted. LOH field の う ち, most も high frequency が い field は ch17p13. 3 - p11.2 で 18 サ ン プ ル (90%), ch9p23 - p22.3 ch18q22. 1, ch18q22. 3 で 17 サ ン プ ル (85%), ch9p21. 3, ch18q12.3-q21.1で16サ プ プ であった (80%)であった. そ の う ち ch17p13. 3 - p11.2 の 18 サ ン プ ル の う ち 1 サ ン プ ル で a homozygous deletion を recognize め, ch9p21. 3 で は LOH の 16 サ ン プ ル に plus 3 サ え ン プ ル に homozygous Deletion を confess め, ch18q12. 3 - q21.1 で は 16 サ ン プ ル の う ち 5 サ ン プ ル の a に homozygous deletion areas を recognize め た. More than 3 copy の raised を picture recognition め た field は ch18q11. 1 - q11.2 で 9 サ ン プ ル (45%), the most も と high frequency が く, 続 い て ch1q21. 1 - q23.1, ch1q23. 3 - q24.1 ch1q42. 2 - q44, ch7p, ch8q24. 21, ch17q12-q21.32で5サ プ プ であった (25%)であった. Traces of Homozygous deletion areas に お け る alternate 伝 subgroup の RNA 発 amount is の unique numerical は seaborne い ず れ も 200 not against で, ほ と ん ど 発 を now recognize め ず, DNA1 times tectonic と そ の 発 に contradictions を now recognize め な か っ た. In the field of Hemizygous deletion, the における candidate heritage 伝 subgroup <s:1> うち, CDKN2A, CDKN2B, and SMAD4 heritage 伝 subgroups present プロファ を検 and を検 respectively. SMAD4 に お け る 1 copy サ ン プ ル の は 発 now quantity, 2 copy サ ン プ ル と zero copy サ ン プ ル の に recognition between average amount 発 is の め, ま た maximum 発 now サ ン プ ル と 発 now minimum サ ン プ ル と の は 2.1 で あ っ た. Party, CDKN2A と CDKN2B に お け る 1 copy サ ン プ ル の 発 now quantity に は, サ ン プ ル で between big き な ば ら つ き を confess め, maximum 発 now と 発 now minimum の than は そ れ ぞ れ と 3.0 5.2 で あ っ た. こ の こ と は and SMAD4 の 発 now quantity は に copy number big き く を by け る の に し seaborne, CDKN2A と CDKN2B の 発 now quantity は copy number の み な ら ず, メ チ ル change な ど の event about に さ れ て い る こ と が in stopping き れ た.

项目成果

Intraabdominal hemorrhage after a pancreatectomy

• DOI: 10.1007/s00534-007-1303-9
• 发表时间: 2008-05-01
• 期刊: JOURNAL OF HEPATO-BILIARY-PANCREATIC SURGERY
• 作者: Tani, Masaji;Kawai, Manabu;Yamaue, Hiroki
• 通讯作者: Yamaue, Hiroki

Transection using bipolar scissors reduces pancreatic fistula after distal pancreatectomy

• DOI: 10.1007/s00534-008-1330-1
• 发表时间: 2008-07-01
• 期刊: JOURNAL OF HEPATO-BILIARY-PANCREATIC SURGERY
• 作者: Kawai, Manabu;Tani, Masaji;Yamaue, Hiroki
• 通讯作者: Yamaue, Hiroki

膵臓外科の現状と将来に向けた課題

胰腺外科现状及未来挑战

• 发表时间: 2009
• 作者: Yamaue H;et al.;川井 学;谷 眞至;東口 崇;山上 裕機;山上 裕機
• 通讯作者: 山上 裕機

Prognostic factors for long-term survival in patients with locally invasive pancreatic cancer

局部浸润性胰腺癌患者长期生存的预后因素

• 发表时间: 2007
• 期刊: Hepatobiliary pancreat Surg 14
• 作者: Yamaue H;et al.;川井 学;谷 眞至
• 通讯作者: 谷 眞至

CLIP method (preoperative CT image-assessed ligation of inferior pancreaticoduodenal artery) reduces intraoperative bleeding during pancreaticoduodenectomy

• DOI: 10.1007/s00268-007-9305-y
• 发表时间: 2008-01-01
• 期刊: WORLD JOURNAL OF SURGERY
• 影响因子: 2.6
• 作者: Kawai, Manabu;Tani, Masaji;Yamaue, Hiroki
• 通讯作者: Yamaue, Hiroki