蛋白工学的手法による亜硝酸還元系を構成する銅蛋白間の相互作用様式の解析
蛋白工学的手法による亜硝酸還元系を構成する銅蛋白間の相互作用様式の解析
批准号:
07660098
负责人:
西山 真
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份:
1995
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1995 至 --
中文摘要
我々はAlcaligenes faecalisS-6株において、脱窒の一過程である亜硝酸還元を担う銅含有亜硝酸還元酵素(NIR)及び同酵素への直接の電子伝達物質として同菌より単離された青色銅蛋白質シュードアズリン(PA)の間の電子伝達機構についての解析を行ってきた。我々は、両銅蛋白質間の電子伝達機構を解明するための基礎となる両蛋白質間の相互作用様式を解明するために、PA分子表面に存在するリジン残基の改変体を作製し、それらのNIRに対する親和性を調べることによって、PAが自身の銅原子近傍に存在するリジン残基を介してNIRと相互作用することを明らかにしてきた。そこで、本研究ではNIRの分子表面にある種々の酸性残基を改変し、PAとの相互作用の変化を調べることとした。これまでの我々の研究により、NIRに含まれる2種類の銅原子のうちタイプ1銅がPAから電子を受け取り、タイプ2銅へ電子を受け渡すことが明らかとなっているが、その結果と一致するように、タイプ1銅近傍に存在する酸性アミノ酸残基の改変により、PAとの相互作用が低下することが明らかとなった。これらの結果は、両銅蛋白質の相互作用には静電的相互作用が関与することを示唆している。そこで、様々な組み合わせで各改変体間の電子伝達を調べた結果、NIRのE197とPAのK10間、NIRのGlu118とPAのK57/K77間に相互作用が存在していることが明らかとなった。
英文摘要
我々はAlcaligenes faecalisS-6株において、脱窒の一過程である亜硝酸還元を担う銅含有亜硝酸還元酵素(NIR)及び同酵素への直接の電子伝達物質として同菌より単離された青色銅蛋白質シュードアズリン(PA)の間の電子伝達機構についての解析を行ってきた。我々は、両銅蛋白質間の電子伝達機構を解明するための基礎となる両蛋白質間の相互作用様式を解明するために、PA分子表面に存在するリジン残基の改変体を作製し、それらのNIRに対する親和性を調べることによって、PAが自身の銅原子近傍に存在するリジン残基を介してNIRと相互作用することを明らかにしてきた。そこで、本研究ではNIRの分子表面にある種々の酸性残基を改変し、PAとの相互作用の変化を調べることとした。これまでの我々の研究により、NIRに含まれる2種類の銅原子のうちタイプ1銅がPAから電子を受け取り、タイプ2銅へ電子を受け渡すことが明らかとなっているが、その結果と一致するように、タイプ1銅近傍に存在する酸性アミノ酸残基の改変により、PAとの相互作用が低下することが明らかとなった。これらの結果は、両銅蛋白質の相互作用には静電的相互作用が関与することを示唆している。そこで、様々な組み合わせで各改変体間の電子伝達を調べた結果、NIRのE197とPAのK10間、NIRのGlu118とPAのK57/K77間に相互作用が存在していることが明らかとなった。
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Murphy,M.E.P.: "Structure of Alcalingenes faecalis nitrite reductase and a copper site mutant,M150E,that contains zinc." Biochemistry. 34. 12107-12117 (1995)
墨菲,M.E.P.:“粪产碱菌亚硝酸盐还原酶的结构和含锌的铜位点突变体 M150E。”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kukimoto,M.: "Identification of interaction site of pseudoazurin with it redox partner,copper-containing nitrite reductase from Alcaligenes faecalis S-6" Protein Engineering. 8. 153-158 (1995)
Kukimoto,M.:“鉴定假天青与其氧化还原伙伴、来自粪产碱菌 S-6 的含铜亚硝酸还原酶的相互作用位点”蛋白质工程。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Studies on mining of novel enzymes functioning in secondary metabolite biosynthesis in Streptomyces and their molecular mechanism.
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批准号:22H00355
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.37万
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财政年份:2022
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负责人:西山 真
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依托单位:
Elucidation of structures and functions of metabolic enzymes of lysine and related compounds and their molecular evolution
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批准号:17H01465
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.79万
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财政年份:2017
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负责人:西山 真
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依托单位:
リジン生合成および関連一次代謝系酵素群の機能および分子進化の解析
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批准号:24248017
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$14.73万
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财政年份:2012
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负责人:西山 真
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依托单位:
耐熱性リンゴ酸脱水素酵素のドメインの折れたたみ機構に関する研究
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批准号:09261204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:西山 真
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依托单位:
精密な立体構造に基づく2つの銅蛋白質の相互作用様式の解析
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批准号:08660090
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1996
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负责人:西山 真
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依托单位:
ドメインに分断されたリンゴ酸脱水素酵素を用いた折れたたみ機構に関する研究
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批准号:08272204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1996
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负责人:西山 真
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依托单位:
ドメインに分断されたリンゴ酸脱水素酵素を用いた折れたたみ機構に関する研究
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批准号:08272204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1996
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负责人:西山 真
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依托单位:
耐熱性リンゴ酸脱水素酵素の安定性及び折れたたみ機構に関する研究
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批准号:07280201
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1995
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负责人:西山 真
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依托单位:
銅蛋白間の電子伝達機構に関する蛋白工学的研究
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批准号:06660090
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1994
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负责人:西山 真
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依托单位:
蛋白工学を用いた銅蛋白間の電子伝達機構の解析
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批准号:05660086
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1993
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负责人:西山 真
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依托单位:
モデリングに基づく耐熱性リンゴ酸脱水素酵素の補酵素特異性の変換と耐熱機構の解析
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批准号:04760074
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1992
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负责人:西山 真
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依托单位:
蛋白工学的手法による青色銅蛋白Cupredoxinの構造・機能相関の解析
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批准号:03760067
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1991
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负责人:西山 真
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依托单位:
蛋白工学的手法を用いた高度好熱菌由来のリンゴ酸脱水素酵素の耐熱化機構の解析
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批准号:02760062
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1990
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负责人:西山 真
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依托单位:
部位特異的変異を用いた耐熱性リンゴ酸脱水酵素の構造・機能相関の解析
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批准号:01760087
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1989
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负责人:西山 真
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依托单位:
海外基金