耐熱性リンゴ酸脱水素酵素の安定性及び折れたたみ機構に関する研究
耐熱性リンゴ酸脱水素酵素の安定性及び折れたたみ機構に関する研究
批准号:
07280201
负责人:
西山 真
金额:
$1.6万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1995
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1995 至 --
中文摘要
我々は、これまで高度好熱性細菌Thermus flavusの有する耐熱性リンゴ酸脱水素酵素(tMDH)の耐熱性や、高温下に反応至適を示す好熱性メカニズムについて研究を行ってきた。野性型tMDHは高い安定性を示すと同時に、塩酸グアニジン変性に対しても完全に可逆的に再生され、そのフォールディング機構の解析は、tMDHの高い安定性を理解する上で重要な知見を与えるものと考えられた。そこで本研究では、本酵素をドメイン或いはさらに小さなフラグメントに遺伝子工学的に分断して、そこから再構成されるtMDHの安定性やリフォールディング能について調べることで、蛋白質の折りたたみ機構を解析することとした。NAD結合ドメインと触媒ドメインの2つのドメインから成り立つ本酵素を、ほぼ各ドメイン部分に相当する領域の遺伝子ごとに分断して独立に発現することにより、野性型酵素と完全に同等の活性を有する耐熱性MDHが再構成されることを見いだした。また一方で、この独立したドメインで構成されるtMDH及び各ドメインが、塩酸グアニジン変性に対してどのような再生効率を示すかを調べたところ、再生効率は野性型酵素と比べて大幅に小さく、さらに濃度依存性を示したことから、各ドメインが、協調的にフォールディングする可能性が考えられた。SDS-PAGEからの回収により、各ドメインを分離し、それぞれのドメインを用いた折りたたみ実験を行った結果、やはり再生の協調性がみられたことから、各ドメインが自立的にフォールディングするわけではない可能性が示唆された。現在正確に各ドメインに分断したフラグメント酵素を作製中であり、フォールディングの協調性についての詳細な解析を進行中である。
英文摘要
我々は、これまで高度好熱性細菌Thermus flavusの有する耐熱性リンゴ酸脱水素酵素(tMDH)の耐熱性や、高温下に反応至適を示す好熱性メカニズムについて研究を行ってきた。野性型tMDHは高い安定性を示すと同時に、塩酸グアニジン変性に対しても完全に可逆的に再生され、そのフォールディング機構の解析は、tMDHの高い安定性を理解する上で重要な知見を与えるものと考えられた。そこで本研究では、本酵素をドメイン或いはさらに小さなフラグメントに遺伝子工学的に分断して、そこから再構成されるtMDHの安定性やリフォールディング能について調べることで、蛋白質の折りたたみ機構を解析することとした。NAD結合ドメインと触媒ドメインの2つのドメインから成り立つ本酵素を、ほぼ各ドメイン部分に相当する領域の遺伝子ごとに分断して独立に発現することにより、野性型酵素と完全に同等の活性を有する耐熱性MDHが再構成されることを見いだした。また一方で、この独立したドメインで構成されるtMDH及び各ドメインが、塩酸グアニジン変性に対してどのような再生効率を示すかを調べたところ、再生効率は野性型酵素と比べて大幅に小さく、さらに濃度依存性を示したことから、各ドメインが、協調的にフォールディングする可能性が考えられた。SDS-PAGEからの回収により、各ドメインを分離し、それぞれのドメインを用いた折りたたみ実験を行った結果、やはり再生の協調性がみられたことから、各ドメインが自立的にフォールディングするわけではない可能性が示唆された。現在正確に各ドメインに分断したフラグメント酵素を作製中であり、フォールディングの協調性についての詳細な解析を進行中である。
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会议论文
Studies on mining of novel enzymes functioning in secondary metabolite biosynthesis in Streptomyces and their molecular mechanism.
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批准号:22H00355
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.37万
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财政年份:2022
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负责人:西山 真
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依托单位:
Elucidation of structures and functions of metabolic enzymes of lysine and related compounds and their molecular evolution
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批准号:17H01465
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.79万
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财政年份:2017
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负责人:西山 真
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依托单位:
リジン生合成および関連一次代謝系酵素群の機能および分子進化の解析
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批准号:24248017
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$14.73万
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财政年份:2012
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负责人:西山 真
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依托单位:
耐熱性リンゴ酸脱水素酵素のドメインの折れたたみ機構に関する研究
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批准号:09261204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:西山 真
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依托单位:
精密な立体構造に基づく2つの銅蛋白質の相互作用様式の解析
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批准号:08660090
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1996
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负责人:西山 真
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依托单位:
ドメインに分断されたリンゴ酸脱水素酵素を用いた折れたたみ機構に関する研究
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批准号:08272204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1996
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负责人:西山 真
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依托单位:
ドメインに分断されたリンゴ酸脱水素酵素を用いた折れたたみ機構に関する研究
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批准号:08272204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1996
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负责人:西山 真
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依托单位:
蛋白工学的手法による亜硝酸還元系を構成する銅蛋白間の相互作用様式の解析
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批准号:07660098
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1995
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负责人:西山 真
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依托单位:
銅蛋白間の電子伝達機構に関する蛋白工学的研究
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批准号:06660090
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1994
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负责人:西山 真
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依托单位:
蛋白工学を用いた銅蛋白間の電子伝達機構の解析
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批准号:05660086
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1993
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负责人:西山 真
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依托单位:
モデリングに基づく耐熱性リンゴ酸脱水素酵素の補酵素特異性の変換と耐熱機構の解析
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批准号:04760074
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1992
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负责人:西山 真
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依托单位:
蛋白工学的手法による青色銅蛋白Cupredoxinの構造・機能相関の解析
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批准号:03760067
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1991
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负责人:西山 真
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依托单位:
蛋白工学的手法を用いた高度好熱菌由来のリンゴ酸脱水素酵素の耐熱化機構の解析
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批准号:02760062
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1990
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负责人:西山 真
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依托单位:
部位特異的変異を用いた耐熱性リンゴ酸脱水酵素の構造・機能相関の解析
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批准号:01760087
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1989
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负责人:西山 真
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依托单位:
海外基金