蛋白工学を用いた銅蛋白間の電子伝達機構の解析
蛋白工学を用いた銅蛋白間の電子伝達機構の解析
批准号:
05660086
负责人:
西山 真
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份:
1993
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1993 至 --
中文摘要
活性汚泥から単離した脱窒菌Alcaligenes faecalis S-6株において、同菌の脱窒の一過程を担う亜硝酸還元系は、亜硝酸還元酵素(NIR)およびシュードアズリンという二つの銅蛋白によって構成されている。同様な銅蛋白による亜硝酸還元系は後になって微生物からカビにわたって広く分布することが明かとなってきた。しかしながら今までに蛋白の銅配位環境と蛋白としての機能の関係、さらには二つの銅蛋白の銅原子間でどのように受け渡しされるのかについては全く明らかになっていなかった。本研究では蛋白工学的に蛋白を改変しそれらの性質を調べることで銅蛋白の構造と機能および銅蛋白間の電子伝達機構を明らかにすることとした。まず、そのための前段階として大腸菌でのNIR遺伝子の発現の最適化を行った。その結果、改変した分泌シグナルをNIR遺伝子に連結し、lacプロモーターの制御下、25-30・Cの低温で培養することにより、1リッター当たり3mg程度のNIRを大腸菌ペリプラズムに分泌する系を確立することに成功した。この系を用いて、NIRがサブユニット当たり1原子ずつ保持しているタイプI銅、タイプII銅の銅原子配位座(リガンド)のうち、タイプI銅リガンドのMet150をGluに、タイプII銅リガンドのHis135をLysに改変した酵素を作製、精製した。Met150Glu改変体は予想どおりタイプI銅を欠失していたが、His135Lys改変体はタイプIIリガンドのうちの1つが変化しているにも関わらず、タイプI、タイプIIの両方の銅を結合していることが明らかになった。次に、これらの改変体の活性を低分子のメチルビオロジェンを電子供与体として用いて測定したところ、His135Lysでは全く活性が検出されない一方、Met150Glu改変体では、十分な亜硝酸還元活性が検出された。これらの結果から、NIRにおいてはタイプII銅が活性に直接的に関わることがはじめて直接的に明らかになった。また、シュードアズリンの銅の周辺に位置するLys残基を中性または酸性残基に変換したところ、Lys10およびLys38の改変により、NIRへの電子伝達能が大きく低下することが明らかになりつつあり、シュードアズリンの銅原子周辺が、NIRと直接的に相互作用していることが示唆された。現在、NIRに含まれるタイプI銅の役割および、シュードアズリンのLys改変体を用いた、NIRとシュードアズリンの相互作用様式の解析を進めている。
英文摘要
活性汚泥から単離した脱窒菌Alcaligenes faecalis S-6株において、同菌の脱窒の一過程を担う亜硝酸還元系は、亜硝酸還元酵素(NIR)およびシュードアズリンという二つの銅蛋白によって構成されている。同様な銅蛋白による亜硝酸還元系は後になって微生物からカビにわたって広く分布することが明かとなってきた。しかしながら今までに蛋白の銅配位環境と蛋白としての機能の関係、さらには二つの銅蛋白の銅原子間でどのように受け渡しされるのかについては全く明らかになっていなかった。本研究では蛋白工学的に蛋白を改変しそれらの性質を調べることで銅蛋白の構造と機能および銅蛋白間の電子伝達機構を明らかにすることとした。まず、そのための前段階として大腸菌でのNIR遺伝子の発現の最適化を行った。その結果、改変した分泌シグナルをNIR遺伝子に連結し、lacプロモーターの制御下、25-30・Cの低温で培養することにより、1リッター当たり3mg程度のNIRを大腸菌ペリプラズムに分泌する系を確立することに成功した。この系を用いて、NIRがサブユニット当たり1原子ずつ保持しているタイプI銅、タイプII銅の銅原子配位座(リガンド)のうち、タイプI銅リガンドのMet150をGluに、タイプII銅リガンドのHis135をLysに改変した酵素を作製、精製した。Met150Glu改変体は予想どおりタイプI銅を欠失していたが、His135Lys改変体はタイプIIリガンドのうちの1つが変化しているにも関わらず、タイプI、タイプIIの両方の銅を結合していることが明らかになった。次に、これらの改変体の活性を低分子のメチルビオロジェンを電子供与体として用いて測定したところ、His135Lysでは全く活性が検出されない一方、Met150Glu改変体では、十分な亜硝酸還元活性が検出された。これらの結果から、NIRにおいてはタイプII銅が活性に直接的に関わることがはじめて直接的に明らかになった。また、シュードアズリンの銅の周辺に位置するLys残基を中性または酸性残基に変換したところ、Lys10およびLys38の改変により、NIRへの電子伝達能が大きく低下することが明らかになりつつあり、シュードアズリンの銅原子周辺が、NIRと直接的に相互作用していることが示唆された。現在、NIRに含まれるタイプI銅の役割および、シュードアズリンのLys改変体を用いた、NIRとシュードアズリンの相互作用様式の解析を進めている。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
M.Nishiyama: "Cloning and characterization of a nitrite reductase gene from Alcaligenes faecalis and its expression in Escherichia coli" Journal of General Microbiology. 139. 725-733 (1993)
M.Nishiyama:“粪产碱菌亚硝酸还原酶基因的克隆和表征及其在大肠杆菌中的表达”普通微生物学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Studies on mining of novel enzymes functioning in secondary metabolite biosynthesis in Streptomyces and their molecular mechanism.
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批准号:22H00355
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.37万
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财政年份:2022
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负责人:西山 真
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依托单位:
Elucidation of structures and functions of metabolic enzymes of lysine and related compounds and their molecular evolution
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批准号:17H01465
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.79万
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财政年份:2017
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负责人:西山 真
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依托单位:
リジン生合成および関連一次代謝系酵素群の機能および分子進化の解析
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批准号:24248017
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$14.73万
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财政年份:2012
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负责人:西山 真
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依托单位:
耐熱性リンゴ酸脱水素酵素のドメインの折れたたみ機構に関する研究
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批准号:09261204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:西山 真
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依托单位:
精密な立体構造に基づく2つの銅蛋白質の相互作用様式の解析
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批准号:08660090
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1996
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负责人:西山 真
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依托单位:
ドメインに分断されたリンゴ酸脱水素酵素を用いた折れたたみ機構に関する研究
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批准号:08272204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1996
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负责人:西山 真
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依托单位:
ドメインに分断されたリンゴ酸脱水素酵素を用いた折れたたみ機構に関する研究
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批准号:08272204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1996
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负责人:西山 真
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依托单位:
耐熱性リンゴ酸脱水素酵素の安定性及び折れたたみ機構に関する研究
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批准号:07280201
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1995
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负责人:西山 真
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依托单位:
蛋白工学的手法による亜硝酸還元系を構成する銅蛋白間の相互作用様式の解析
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批准号:07660098
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1995
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负责人:西山 真
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依托单位:
銅蛋白間の電子伝達機構に関する蛋白工学的研究
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批准号:06660090
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1994
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负责人:西山 真
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依托单位:
モデリングに基づく耐熱性リンゴ酸脱水素酵素の補酵素特異性の変換と耐熱機構の解析
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批准号:04760074
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1992
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负责人:西山 真
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依托单位:
蛋白工学的手法による青色銅蛋白Cupredoxinの構造・機能相関の解析
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批准号:03760067
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1991
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负责人:西山 真
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依托单位:
蛋白工学的手法を用いた高度好熱菌由来のリンゴ酸脱水素酵素の耐熱化機構の解析
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批准号:02760062
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1990
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负责人:西山 真
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依托单位:
部位特異的変異を用いた耐熱性リンゴ酸脱水酵素の構造・機能相関の解析
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批准号:01760087
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1989
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负责人:西山 真
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依托单位:
海外基金