分子認識プロテオミクスを目的とする光キャプチャー法開発
分子認識プロテオミクスを目的とする光キャプチャー法開発
批准号:
14658185
负责人:
畑中 保丸
金额:
$1.86万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 2004
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英文摘要
リガンドを固相上に配置した光アフィニティーアレイを構築し、光アフィニティー捕捉(光キャプチャー)した蛋白質を効率良く分離解析する、新しい光アフィニティー法の開拓を目的に、以下の萌芽期の研究計画を年度ごとに具体的に実行してきた。1)アレイ化には大量・多種のプローブが必要なため、これに見合うプローブ合成の効率化の検討。2)DNAアレイ化に比し、プロテオーム解析では蛋白質の非特異的吸着など、アレイ構築にさらに工夫が必要となる。このための新たなアレイ化技術の開拓。3)構築したアレイについての、応用系での検証。初年度および昨年度において、主に1)、2)について検討し、アレイ化のモデル系をほぼ確立した。最終年度は、これらの実績を基に3)の応用系での検討を実施し、以下の成果を得た。1.糖鎖リガンドの効率的プローブ誘導化法を実際に応用し、Sophora japonicaから得られるレクチンのsophoragrinにおける、糖鎖結合サブユニットを明らかにした。2.光キャプチャーは、解析対象のタンパク質のみを釣り上げ、固相上で連続洗浄できるため操作性に優れる。しかし、捕捉・精製した資料をMS解析系に移行させるには、固相から再遊離させる必要がある。この段階につき、アビジン-ビオチン系で化学的方法と酵素法を検討した。a)昨年度に確立した光反応性のフェニルアラニンを用い、光反応性ペプチドのカルモジュリンを合成し、切断性ジスルフィド結合型のビオチンを組み込んで検討した。その結果、アビジン捕捉状態では、ジスルフィド結合開裂が妨げられる場合があることが分かった。b)この解決のため、プロテアーゼ切断性のペプチド型スペーサーを開発し、タンパク質に影響を与えずビオチンを切断してアビジン捕捉試料を回収する可能性を示した。3.遊離させた試料を効率良くMS解析するため、効率の良い安定同位体標識条件を見出した。
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Solubility-insolubility interconversion of sophoragin, a mannose/glucose-specific lectin in Sophora japonica (Japanese pagoda tree) bark, regulated by the sugar-specific interaction
槐素(槐树皮中的一种甘露糖/葡萄糖特异性凝集素)的溶解度-不溶性相互转化,受糖特异性相互作用的调节
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Biochem.J. 382
影响因子:
--
作者:
[Ueda H., Fukushima H., Hatanaka Y., Ogawa H.]
通讯作者:
Ogawa H.
T.Ruhl, D.Volke, K.Stembera, Y.Hatanaka, H.Hennig, F.Schumer, P.Welzel: "Isoserine-based biotinylated photoaffinity probes that interact with penicillin-binding protein 1b"Chem.Commun.. 2002. 1630-1631 (2002)
T.Ruhl、D.Volke、K.Stembera、Y.Hatanaka、H.Hennig、F.Schumer、P.Welzel:“基于异丝氨酸的生物素化光亲和探针与青霉素结合蛋白 1b 相互作用”Chem.Commun. 2002
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Simple synthesis of deuterium and ^<13>C labeled trifluoromethyl phenyl-diazirine derivatives as stable isotope tags for mass spectrometry
简单合成氘和^ 13 C标记的三氟甲基苯基-二氮丙啶衍生物作为用于质谱分析的稳定同位素标签
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Chem.Pharm.Bull. 52
影响因子:
--
作者:
[Hashimoto M., Hatanaka Y.]
通讯作者:
Hatanaka Y.
定金 豊: "プロテオーム解析に役立つ人工大腸菌"ファルマシア. 39. 365-366 (2003)
Yutaka Sadakane:“用于蛋白质组分析的人工大肠杆菌”Pharmacia 39. 365-366 (2003)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Y.Hatanaka, Y.Sadakane: "Photoaffinity labeling in drug discovery and developments : Chemical gateway for entering proteomic frontier"Curr. Top. Med. Chem.. 2. 271-228 (2002)
Y.Hatanaka、Y.Sadakane:“药物发现和开发中的光亲和标记:进入蛋白质组学前沿的化学门户”Curr。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 17 条
光反応性高次認識糖鎖分子の設計と応用
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批准号:11121214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1999
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负责人:畑中 保丸
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依托单位:
光反応性高次認識糖鎖分子の設計と応用
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批准号:10134215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.9万
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财政年份:1998
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负责人:畑中 保丸
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依托单位:
光反応性高次認識糖鎖分子の設計と応用
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批准号:09240214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.9万
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财政年份:1997
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负责人:畑中 保丸
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依托单位:
光切断性タグを利用する糖鎖分子の細胞内合成
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批准号:09878116
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:畑中 保丸
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依托单位:
糖転移酵素および関連蛋白質の光アフィニティーラベリング
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批准号:05274209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1993
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负责人:畑中 保丸
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依托单位:
大環状化合物の新合成法の開発(光化学的アプローチ)
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批准号:58771578
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1983
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负责人:畑中 保丸
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依托单位:
フタルイミドの光脱芳香族化反応を利用した新複素環系の合成
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批准号:57771443
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.48万
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财政年份:1982
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负责人:畑中 保丸
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依托单位:
イミド類の遠隔光環化反応を利用した大員環系の新合成法開発
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批准号:56771027
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1981
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负责人:畑中 保丸
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依托单位:
イミド類の光反応を利用した新複素環系の合成
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批准号:X00210----377684
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.24万
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财政年份:1978
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负责人:畑中 保丸
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依托单位:
海外基金