自己切断機能をもったDNAに関する研究

具有自切割功能的DNA研究

• 批准号: 04804040
• 负责人: 牧野 圭祐
• 金额: $ 1.09万
• 依托单位: Kyoto Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
• 财政年份: 1992
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1992 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-04804040/
• 关键词: DNA; 高次構造; NMR; 二次元NMR; NOE; 脱プリン反応; 自己分解反応

自己切断機能をもったDNAに関する研究を行った。詳しくは、一本鎖でありながら高次構造に基づくグアニンの8位のプロトン間に核オーバーハウザー効果(NOE)の観察される4量体(HTTG、GATG)についての核磁気共鳴による水容液高次構造の解析と昇温下の自己分解反応についての速度論的な検討を行った。上記の4量体オリゴヌクレオチドを一次元ならびに二次元NMR(COSY,NOESY,ROESY)によって測定し、全プロトンの帰属に成功した。GTTGではグアニンの8位のプロトン間ならびにチミンの6位のプロトン間に強いNOE間が観測されこれらの塩基同士が強い相互作用を行っていることが示唆されたが、この相互作用は40ﾟC以上の昇温によっても消失しない極めて安定な相互作用であることを確認した。一方GATGでは0ﾟC近傍の低温ではグアニンのプロトン間に弱いNOEが見られたが、これは昇温によって消失したこの相互作用が弱いことが分った。また他の塩基配列の4量体についても同様の測定を行ったが、塩基間の相互作用は観測されなかった。すなわち、GTTGは4量体という小分子でありながら水溶液中で堅い構造をもつことを発見した。なお、このような安定な高次構造をもった小オリゴヌクレオチドを見出した過去の報告はない。一方上記の4量体オリゴヌクレオチドを昇温したときの自己分解についても速度論的に解析した。その結果、5'ならびに3'端にグアニンをもつオリゴヌクレオチドでは塩基の脱プリン反応が容易におき、これに引き続きおきるβ脱離によって5'端ならびに3'端のヌクレオチド単位が消失しやすいことを明らかにした。現在、高次構造と分解反応の程度と相関を検討しており、さらには脱プリン反応以外にも、インターヌクレオチドリン酸結合の加水分解反応についても検討を行っている。

The function of self-cutting is related to DNA research. In this paper, we discuss the rate-theoretic analysis of higher-order structures, base structure, 8-bit structure, 8-bit structure, 8-bit The above four quantities were successfully determined by primary and secondary NMR(COSY,NOESY,ROESY). GTTG is the 8-bit and 6-bit interaction between NOE and NOE. The interaction between NOE and NOE is the strongest interaction between NOE and NOE. The interaction between NOE and NOE is the strong interaction between NOE and NOE. The interaction between NOE and NOE is the NOE. A side of the GATG is close to 0 ° C, and the interaction between the two is weak. The interaction between the four components of the matrix is measured. GTTG is a small molecule in 4-dimensional solution. The high-order structure of the structure is stable and stable, and the structure is stable and stable. On the other hand, it is necessary to keep in mind the four dimensions of temperature and decomposition, and the analysis of velocity theory. As a result, the 5'and 3' end of the base is easy to remove, and the 5'and 3' end of the base are easy to remove. Now, the degree of correlation between high-order structure and decomposition reaction is discussed. In addition, the degree of correlation between high-order structure and decomposition reaction is discussed.

项目成果

Akira Murakami: "Separation and characterization of diastereomeric oligonucleotides," Nacleic Acids Research Symposium Series. 27. 137-138 (1992)

Akira Murakami：“非对映寡核苷酸的分离和表征”，核酸研究研讨会系列。

Akira Murakami: "Interaction of antisense DNA with nucleic acids/proteins." Nucleic Acids Research Symposium Sories. 27. 123-124 (1992)

Akira Murakami：“反义 DNA 与核酸/蛋白质的相互作用。”

Akira Murakami: "Synthesis and properties of fluorescent labeled oligonucleotides containing deoxyethenoadenosine at 5'end." Nucleic Acids Research Symposium Series. 27. 125-126 (1992)

Akira Murakami：“5 端含有脱氧乙烯腺苷的荧光标记寡核苷酸的合成和特性。”

Akira Murakami: "NMR・Studies on solution structure of single-stranded oligonucleotides causing line broadening." Nucleic Acids Research Symposium Series. 27. 55-56 (1992)

Akira Murakami：“NMR·引起谱线展宽的单链寡核苷酸溶液结构的研究。” 核酸研究研讨会系列 27. 55-56 (1992)

村上 章: "アンチセンス技術の医療への応用" Human Science. 3(3). 106-121 (1992)

Akira Murakami：“反义技术的医学应用”《人类科学》106-121（1992）。