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イネ染色体上に存在する新しいタイプのトランスポゾンの解明

阐明水稻染色体上存在的新型转座子

基本信息

批准号：
06680664
负责人：
大坪栄一
金额：
$ 1.28万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份：
1994
资助国家：
日本
起止时间：
1994 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

我々は、イネにおいてTA配列に特異的に転移する遺伝子Tnr1(約230bp)とトランスポゾン様配列Tnr2(147bp)を見いだしたが、これらは既知の3つのファミリーに属する植物の転移性遺伝因子とは異なる末端逆向き配列をもっていた。両者ともそれらの大きさから考えて、転移に必須のトランスポゼ-スをコードする自律性因子ではなく、その存在によって転移できるような非自律性因子と考えられた。本研究は、1)構造、転移様式が不明であったTnr2に関して、染色体上の種々の異なる座に存在するメンバーを分離し、構造を解析すること、2)Tnr1およびTnr2両者の自律性因子を分離し、トランスポゼ-スをコードする領域を明らかにすることによって、Tnr1とTnr2が新規のトランスポゾンであることを実証することを目的としたものであり、本年度で得られた結果は次のように要約できる。1.イネO.sativaからtotal genomic DNA をpUC118にクローニングしライブラリーを作成し、Tnr2の塩基配列の一部分に対応するオリゴヌクレオチドをプローブとして、異なる座に挿入されているTnr2のメンバーを運ぶクローンを得、クローン内のfragment中に存在するTnr2の塩基配列及びそれに隣接する配列を決定した。その結果、Tnr2メンバーが互いに良く似た大きさの配列からなること、各座において8bpの標的配列が重複しているがそれらに特異性は無いこと、が分かった。2.Tnr1又はTnr2のコンセンサス配列を基にして、その両端から内側に向かってDNAが伸長させられるようなオリゴヌクレオチドを1組ずつ合成し、それらをプライマーとしてPCRを行い、増幅したfragmentの塩基配列を決定した。得られたものは自律性因子の完全長を持つものではなく部分配列であったが、決定した塩基配列内のエクソンにコードされるアミノ酸配列と既知の転移性遺伝子のトランスポゼ-スのアミノ酸配列とのホモロジーを調べたが、相同なものは存在せず、従ってこれらが予想通り新規の転移性遺伝因子であることが明らかになった。

We found that Tnr1(about 230bp) and Tnr2(147bp) were the specific genes of the plant in the middle of the sequence, but they were also the reverse genes of the known plants in the middle of the sequence. The self-discipline factor of the existence of the disease This study consists of: 1) structure, migration formula, existence of different loci on chromosomes, separation, structural analysis, 2) separation of automaticity factors of Tnr1 and Tnr2, identification of new loci, identification of new loci, identification, identification of new loci, identification of new loci, This year's results are the same as those of the previous year. 1. The total genomic DNA from O.sativa is made into a nucleotide sequence in pUC118, and a portion of the nucleotide sequence of Tnr2 is connected to the nucleotide sequence of Tnr2, and the other components of Tnr2 that are inserted into the nucleotide sequence are obtained from the nucleotide sequence, and the nucleotide sequence of Tnr2 that exists in the fragment within the nucleotide and the adjacent sequences are determined. As a result, Tnr2 has a good relationship with each other, and the alignment of the 8bp target in each site is repeated. 2. Tnr1 and Tnr2 have the same nucleotide sequence as Tnr1 and Tnr2, and the DNA sequence is determined by PCR. The complete length of the self-regulating factor is determined by the partial arrangement of the self-regulating factor. The acid arrangement of the self-regulating factor is determined by the partial arrangement of the self-regulating factor. The acid arrangement of the self-regulating factor is determined by the partial arrangement of the self-regulating factor.