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トランスポゾンの転移組み換えの初期反応の解析

转座子转座重组初始反应分析

基本信息

批准号：
09269204
负责人：
大坪栄一
金额：
$ 1.41万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1997
资助国家：
日本
起止时间：
1997 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

生物の多様性、病態を引き起こす突然変異の多くは、挿入・欠失等のように遺伝子の再編によるものである。大腸菌ではこのような変異の多くがトランスポゾンによって誘起される。トランスポゾンTn3と挿入因子IS3はそれぞれがコードするトランスポゼ-スの働きにより転移するが、転移様式は異なる。本研究は、これらの転移の分子機構の解明を目的としたものである。(1)Tn3トランスポゼ-スによるニッキング反応の解析:申請研究期間中に、我々が開発したin vitro系において、Tn3転移のtargetとなるプラスミドがその末端の38bpの逆向き繰り返し配列IRを運んでいる場合、そのプラスミドにTn3が新たに転移できないという「転移免疫」現象を再現し、この現象がtargetプラスミド上のIRにトランスポゼ-スが結合することにより不活性な転移複合体を作るためであることを示した。また、トランスポゼ-スと共にニッキング反応を促進する宿主タンパク質(NSF)を精製し、後者がACP(acyl carrier protein)であると同定した。ニッキングは転移の第一段階の反応であり、それが宿主タンパク質により促進されるという事実は、転移初期反応が単純ではないことを示唆する。(2)IS3トランスポゼ-スによる転移中間体生成の解析:IS3のトランスポゼ-スを産生すると、IS3の分子内転移が起こると同時に、IS3の環状及び直鎖状分子が生ずる。申請研究期間中に、環状分子をクローニングしたプラスミドを持つ大腸菌内でトランスポゼ-スを発現すると直鎖状分子に変換されること、生じた直鎖状分子が実際に環状IS3の3'末端で切断されたものであることを明らかにした。この結果は、レトロウィルスにおいてその逆転写後に、環状及び直鎖状DNAが生じ、直鎖状DNAがインテグラーゼの作用により挿入組み換えを起こすことと非常に良く似ている。

Biological diversity, pathological changes, sudden changes, changes Coliform bacteria can be induced by various factors. The input factor IS3 is different from the input factor IS3. The purpose of this study is to clarify the molecular mechanism of migration. (1) Analysis of Tn3 shift: During the application study period, I have developed in vitro system, Tn3 shift target and 38bp reverse shift at the end of Tn3 shift target and 38bp reverse shift at the end of Tn3 shift target and 38bp reverse shift at the end of Tn3 shift target and 38 bp reverse shift at the end of Tn3 shift target. The host protein (NSF) is refined and the latter is acylated. The first stage of the shift is reversed, and the host is reversed. (2) The analysis of IS3 transition intermediate formation: IS3 transition intermediate formation, IS3 intramolecular transition initiation, IS3 cyclic and straight-chain molecular formation. During the study period, cyclic molecules were isolated from E. coli and isolated from the 3'end of cyclic IS3. The result is that the DNA in the reverse direction, the circular DNA and the linear DNA, are generated and the linear DNA is generated.