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Development of DNA microarray-based reseqeuncing system for neurological diseases.

开发基于 DNA 微阵列的神经系统疾病重测序系统。

基本信息

批准号：
16209028
负责人：
TSUJI Shoji
金额：
$ 31.78万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16209028/
关键词：
Parkinson disease neurodegenerative diseases DNA microarray DNA chip resequencing disease-associated genes PCR molecular genetics DNA microarray DNA chip 疾患関連遺伝子分子遺伝学 DNA micro array

项目摘要

The purpose of this project is to develop a high throughput mutational analysis system for neurological diseases. The approach consists of 1.to develop microarray bases reseqeuncing of causative genes for neurological diseases. 2.application of comprehensive analysis of candidate genes for sporadic diseases. and 3.analysis of phenotypic variations bases on comprehensive mutational analysis. To accomplish, these aims, we have developed DNA microarrays for Alzheimer's disease, Parkinson disease, amyotrophic lateral sclerosis, adrenoleukodsytrophy, familial spastic paraplegia. We have confirmed that the sensitivity and specificity of DNA microarray-bases reseqeuncing are comparable to those based on dideoxynucleotide chain terminator method. We have applied DMA microarray-based reseqeuncing for comprehensive mutational analysis of causative genes for 43 patients with spastic paraplegia. We have identified 7 patients with SPG4 and a patient with SPG3A. Among the SPG4 patients, there are two sporadic cases, suggesting reduced penetrance of the mutations. Thus, we have demonstrated that the high throughput DNA microarray-based resegeuncing system is highly useful for molecular dissection of neurological diseases including Alzheimer's disease, Parkinson disease, amyotrophic lateral sclerosis, adrenoleukodsytrophy, familial spastic paraplegia

本项目的目的是开发一个高通量的神经系统疾病突变分析系统。该方法包括1.to开发微阵列基地reseqeuncing致病基因的神经系统疾病。2.散发性疾病候选基因综合分析的应用。3.综合突变分析基础上的表型变异分析。为了实现这些目标，我们开发了用于阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症、肾上腺脑白质营养不良、家族性痉挛性截瘫的DNA微阵列。我们已经证实，DNA微阵列碱基重测序的敏感性和特异性与基于双脱氧核苷酸链终止子的方法相当。我们应用DNA微阵列技术对43例痉挛性截瘫患者的致病基因进行了全面的突变分析。我们已经确定了7例SPG4患者和1例SPG3A患者。在SPG4患者中，有两例散发病例，表明突变的发生率降低。因此，我们已经证明了基于高通量DNA微阵列的再测序系统对于神经系统疾病的分子解剖是非常有用的，所述神经系统疾病包括阿尔茨海默氏病、帕金森病、肌萎缩性侧索硬化、肾上腺脑白质营养不良、家族性痉挛性截瘫、脊髓灰质炎和脊髓灰质炎。

项目成果

期刊论文数量（18）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Adult-onset leukoencephalopathy with vanishing white matter with a missense mutation in EIF 2B5.

成人发病的白质脑病，伴有白质消失，且 EIF 2B5 存在错义突变。

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
Neurology 62
影响因子：
0
作者：
Ohtake H;Shimohata;T.;Terajima;K.;Kimura;T.;Jo;R.;Kaseda;R.;Iizuka;O.;Takano;M.;Akaiwa;Y.;Goto;H.;Kobayashi;H.;Sugai;T.;Muratake;T.;Hosoki;T.;Shioiri T.;Okamoto;K.;Onodera;O.;Tanaka;K.;Someya;T.;Nakada;T.;Tsuji;S.
通讯作者：
S.

Interference with activity-dependent transcriptional activation of BDNF gene depending upon the expanded polyglutamines in neurons.

根据神经元中扩展的聚谷氨酰胺，干扰 BDNF 基因的活性依赖性转录激活。

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Biochem Biophys Res Commun 333(4):
影响因子：
0
作者：
Miyashita T;Tabuchi A;Fukuchi M;Hara D;Kisukeda T;Shimohata T;Tsuji S;Tsuda M.
通讯作者：
Tsuda M.

Polyglutamine represses cAMP-responsive-element-mediated transcription without aggregate formation.

聚谷氨酰胺抑制 cAMP 响应元件介导的转录而不形成聚集体。