Construction of Protein-RNA conjugate for intracellular imaging of metabolites

用于代谢物细胞内成像的蛋白质-RNA缀合物的构建

• 批准号: 21850026
• 负责人: ENDOH Tamaki
• 金额: $ 1.73万
• 依托单位: Konan University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21850026/
• 关键词: 代謝産物検; 細胞内イメージング; RNA-タンパク質相互作用; アロステリック相互作用; RNA構造変化; 代謝産物検出; RNAセレクション; リボスイッチ; 代謝産物の検出

In this study, construction of Protein-RNA conjugate, which enables detection of small molecules, was performed. RNA libraries that consist of artificial RNA aptamer and TAR-RNA were designed. RNAs that allosterically interact with Tat-peptide in the presence of the target small molecules were selected from the libraries. By cooperative function of artificially modified Luciferase containing Tat-peptide, the selected RNAs enabled luminometric detection of the small molecules. Additionally, direct conjugation of RNA aptamer and TAR-RNA enabled detection of small molecule by an intracellular gene expression though an allosteric interaction of Tat protein.

在本研究中，构建了能够检测小分子的蛋白质-RNA 缀合物。设计了由人工RNA适体和TAR-RNA组成的RNA文库。从文库中选择在目标小分子存在的情况下与 Tat 肽发生变构相互作用的 RNA。通过人工修饰的含有 Tat 肽的荧光素酶的协同作用，所选的 RNA 能够对小分子进行发光检测。此外，RNA适体和TAR-RNA的直接缀合使得能够通过Tat蛋白的变构相互作用通过细胞内基因表达来检测小分子。

项目成果

Direct detection of RNAs in living cells using peptide-inserted Renilla luciferase

利用肽嵌入式雷尼拉荧光素酶直接检测活细胞中的 RNA

• DOI: 10.1039/c1an15130d
• 发表时间: 2011-01-01
• 期刊: ANALYST
• 影响因子: 4.2
• 作者: Andou, Takashi;Endoh, Tamaki;Kobatake, Eiry
• 通讯作者: Kobatake, Eiry

生命分子の挙動に及ぼす分子環境の効果(26)mRNAの高次構造が影響する翻訳伸長反応の解析手法の構築

分子环境对生物分子行为的影响（26）开发分析受mRNA高阶结构影响的翻译延伸反应的方法

• 发表时间: 2011
• 作者: 末森浩司;谷口弥鈴;植村聖;吉田学;星野聰;小笹健仁;鎌田俊英;川崎悠・遠藤玉樹・杉本直己
• 通讯作者: 川崎悠・遠藤玉樹・杉本直己

話題「遺伝子制御を可能にするRNAの構造スイッチ」

主题：“实现基因调控的RNA结构开关”

• 发表时间: 2011
• 期刊: ファルマシア 47
• 作者: 遠藤玉樹;杉本直己
• 通讯作者: 杉本直己

生命分子の挙動に及ぼす分子環境の効果(27)細胞内分子機能スイッチの構築に向けたタンパク質とのアロステリック相互作用を示すRNAのセレクション

分子环境对生物分子行为的影响 (27) 选择与蛋白质表现出变构相互作用的 RNA，用于构建细胞内分子功能开关

• 发表时间: 2011
• 作者: K.Usui;K.Kobayashi;N.Sugimoto;遠藤玉樹・杉本直己
• 通讯作者: 遠藤玉樹・杉本直己

タンパク質-RNA間相互作用を活用したヒト細胞内で機能する人工リボスイッチシステムの構築

利用蛋白质-RNA相互作用构建在人类细胞中发挥作用的人工核糖开关系统

• 发表时间: 2010
• 作者: K.Usui;M.Mie;T.Andou;N.Sugimoto;H.Mihara;E.Kobatake;遠藤玉樹・杉本直己
• 通讯作者: 遠藤玉樹・杉本直己