Development of Single-molecule Identification Using Quantum Interference
Development of Single-molecule Identification Using Quantum Interference
批准号:
22H00281
负责人:
谷口 正輝
金额:
$26.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2025-03-31
中文摘要
DNAを構成する4つの核酸である、アデノシン、シチジン、グアノシン、チミジンの1分子コンダクタンスを計測した。計測で得られた大量の電流―時間波形からランダムに抽出した波形を調べたところ、アデノシンの波形にのみ、2つのコンダクタンスプラトーが、高頻度で観察された。アデノシンの量子化学計算から、最適化構造と分子軌道が決定され、1分子コンダクタンスにおける量子干渉則により、電子的な電極―分子間相互作用と、電流経路の許容・禁制の複数の組合せを決定した。電極から分子への電子の入射と、分子から電極への電子の出射を量子ビットに対応させ、計測で得られた1分子コンダクタンス、電極―分子の電子的な接合状態、および量子干渉則を満たす量子ゲートを、Xゲート、Y回転ゲート、制御NOTゲートから構築した。Y回転ゲートの回転角θは、重ね合わせ状態をつくる電流経路に重み付けを与えた。計測で得られた核酸分子の1分子コンダクタンスの度数分布を作成し、度数分布に基づき、回転角θの分布を決定した。アデノシンでは、高い、低い、および重ね合わせ状態の中間状態の1分子コンダクタンスの回転角θを、それぞれ、0°、90°、45°と決定した。決定した量子ゲートによる量子計算を介して、1分子コンダクタンス計測データからアデノシンの識別強度を計算した。シミュレーションで得られたアデノシンの1分子コンダクタスをテストデータに用いると、量子シミュレーションでは100%の識別精度が得られた。さらに、5ビットの量子コンピュータを用いてアデノシンの識別を行ったところ、81%の識別精度が得られ、構築したアデノシンの量子ゲートがアデノシン識別器として機能することを実証した。さらに、4つの核酸の計測データを量子コンピュータで解析した結果、アデノシンを100%の強度で識別することに成功した。
英文摘要
DNAを構成する4つの核酸である、アデノシン、シチジン、グアノシン、チミジンの1分子コンダクタンスを計測した。計測で得られた大量の電流―時間波形からランダムに抽出した波形を調べたところ、アデノシンの波形にのみ、2つのコンダクタンスプラトーが、高頻度で観察された。アデノシンの量子化学計算から、最適化構造と分子軌道が決定され、1分子コンダクタンスにおける量子干渉則により、電子的な電極―分子間相互作用と、電流経路の許容・禁制の複数の組合せを決定した。電極から分子への電子の入射と、分子から電極への電子の出射を量子ビットに対応させ、計測で得られた1分子コンダクタンス、電極―分子の電子的な接合状態、および量子干渉則を満たす量子ゲートを、Xゲート、Y回転ゲート、制御NOTゲートから構築した。Y回転ゲートの回転角θは、重ね合わせ状態をつくる電流経路に重み付けを与えた。計測で得られた核酸分子の1分子コンダクタンスの度数分布を作成し、度数分布に基づき、回転角θの分布を決定した。アデノシンでは、高い、低い、および重ね合わせ状態の中間状態の1分子コンダクタンスの回転角θを、それぞれ、0°、90°、45°と決定した。決定した量子ゲートによる量子計算を介して、1分子コンダクタンス計測データからアデノシンの識別強度を計算した。シミュレーションで得られたアデノシンの1分子コンダクタスをテストデータに用いると、量子シミュレーションでは100%の識別精度が得られた。さらに、5ビットの量子コンピュータを用いてアデノシンの識別を行ったところ、81%の識別精度が得られ、構築したアデノシンの量子ゲートがアデノシン識別器として機能することを実証した。さらに、4つの核酸の計測データを量子コンピュータで解析した結果、アデノシンを100%の強度で識別することに成功した。
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バイオナノテクノロジー研究分野(谷口(正)研)
生物纳米技术研究领域(谷口正史实验室)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Challenges of the practical applications of solid-state nanopore platforms for sensing biomolecules
固态纳米孔平台传感生物分子的实际应用面临的挑战
DOI:
10.35848/1882-0786/ac7bd4
发表时间:
2022
期刊:
Applied Physics Express
影响因子:
2.3
作者:
[仁井田海渡, 宮崎雅義, 細野秀雄, 北野政明, Taniguchi Masateru]
通讯作者:
Taniguchi Masateru
Single‐Molecule Classification of Aspartic Acid and Leucine by Molecular Recognition through Hydrogen Bonding and Time‐Series Analysis
通过氢键分子识别和时间序列分析对天冬氨酸和亮氨酸进行单分子分类
DOI:
10.1002/asia.202200179
发表时间:
2022
期刊:
Chemistry - An Asian Journal
影响因子:
--
作者:
[Ryu Jiho, Komoto Yuki, Ohshiro Takahito, Taniguchi Masateru]
通讯作者:
Taniguchi Masateru
量子コンピュータを用いた1分子識別法の開発
利用量子计算机开发单分子识别方法
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[谷口 正輝, 大城 敬人, 多田 朋史]
通讯作者:
多田 朋史
Quantitative Microscopic Observation of Base?Ligand Interactions via Hydrogen Bonds by Single-Molecule Counting
通过单分子计数定量显微观察氢键碱基配体相互作用
DOI:
10.1021/jacs.2c11260
发表时间:
2023
期刊:
Journal of the American Chemical Society
影响因子:
15
作者:
[Takashima Yusuke, Komoto Yuki, Ohshiro Takahito, Nakatani Kazuhiko, Taniguchi Masateru]
通讯作者:
Taniguchi Masateru
1分子ペプチドシークエンシング法の開発
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批准号:26246004
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$9.73万
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财政年份:2014
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负责人:谷口 正輝
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依托单位:
マイクロヒータ組込み型ゲーティングナノポアデバイスの創製
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批准号:14F04355
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2014
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负责人:谷口 正輝
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依托单位:
ハイコンダクタンス単一分子接合に向けた電極―分子界面の創製
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批准号:20027009
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.07万
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财政年份:2008
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负责人:谷口 正輝
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依托单位:
分子-電極接合の界面制御技術の開発
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批准号:18041011
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.82万
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财政年份:2006
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负责人:谷口 正輝
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依托单位:
分子デバイス配線法の開発
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批准号:18710122
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2006
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负责人:谷口 正輝
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依托单位:
プログラムされた分子ワイヤの合成とナノ電極による電気伝導測定
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批准号:16710101
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.73万
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财政年份:2004
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负责人:谷口 正輝
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依托单位:
DNAを用いたナノデバイスの創製と分子操作技術の開発
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批准号:01J00447
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2001
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负责人:谷口 正輝
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依托单位:
超伝導性有機材料の分子設計と合成に関する研究
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批准号:98J09768
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.73万
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财政年份:1998
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负责人:谷口 正輝
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依托单位: