使用全基因组测序研究正常血细胞的体细胞突变-猫眼课题宝

使用全基因组测序研究正常血细胞的体细胞突变

批准号：

22K20840

负责人：

吉田健一

金额：

$1.83万

依托单位：

National Cancer Center Japan

依托单位国家：

日本

项目类别：

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

财政年份：

2022

资助国家：

日本

项目状态：

已结题

起止时间：

2022-08-31 至 2024-03-31

来源：

https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K20840/

关键词：

血液細胞全ゲノム解析血液体細胞性変異

项目摘要

项目成果

吉田健一的其他基金

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本研究では単一細胞由来の血液細胞コロニーを作製して全ゲノム解析を行うことにより、正常な血液細胞に獲得される遺伝子異常（変異、挿入欠失、構造異常、染色体コピー数異常）の蓄積量や、塩基置換などのパターン（変異シグネチャー）の解析を行う。得られたデータから、正常な血液細胞に遺伝子変異が蓄積する原因を解析し、さらに年齢や飲酒、喫煙などの環境因子との関連について解析することにより、血液腫瘍の発症機序を明らかにすることを目的としている。本年度はまず本研究について所属施設の倫理委員会に申請を行い、承認が得られた。多数症例の検体を解析する前の予備実験として血液腫瘍の2症例から造血コロニーの作製およびコロニーから抽出した微量DNAからの全ゲノムシークエンスのライブラリー作成を行う実験を行った。回収したコロニーの大部分からライブラリー作製に必要な量のDNAが抽出可能であり、ライブラリー作成およびシークエンスを行った。解析したデータをがん解析用のパイプラインで解析して体細胞性変異を同定し、変異アレル頻度から作製した造血コロニーが単一細胞由来であることを確認した。今後予定している多数の臨床情報付きの健常人由来血液検体を共同研究施設から提供を受ける共同研究について、所属施設、共同研究施設での倫理審査が完了した。今後多数の健常人血液検体を収集し、年齢や生活歴の情報から症例を選定し、実験・解析を行なっていく予定である。

期刊论文(2)

专著(0)

科研奖励(0)

会议论文

Clonal evolution in normal lung tissue leading to lung cancer development

正常肺组织的克隆进化导致肺癌的发展

DOI： --

发表时间： 2023

期刊：

影响因子： --

作者：

[Tamaki Sawako, Suzuki Koichi, Abe Iku, Endo Yuhei, Kakizawa Nao, Watanabe Fumiaki, Saito Masaaki, Tsujinaka Shingo, Miyakura Yasuyuki, Ohta Satoshi, Tago Kenji, Yanagisawa Ken, Konishi Fumio, Rikiyama Toshiki, Kenichi Yoshida]

通讯作者： Kenichi Yoshida

正常組織の全ゲノム解析によるがんの病態解明

通过正常组织的全基因组分析阐明癌症的病理学

DOI： --

发表时间： 2023

期刊：

影响因子： --

作者：

[川瀬航, 廣島幸彦, 佐藤愼哉, 大島貴, 宮城洋平, 吉田健一]

通讯作者：吉田健一