Study of somatic mutations in normal blood cells using whole-genome sequencing

使用全基因组测序研究正常血细胞的体细胞突变

• 批准号: 22K20840
• 负责人: 吉田 健一
• 金额: $ 1.83万
• 依托单位: National Cancer Center Japan
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-08-31 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K20840/
• 关键词: 血液細胞; 全ゲノム解析; 血液; 体細胞性変異

本研究では単一細胞由来の血液細胞コロニーを作製して全ゲノム解析を行うことにより、正常な血液細胞に獲得される遺伝子異常（変異、挿入欠失、構造異常、染色体コピー数異常）の蓄積量や、塩基置換などのパターン（変異シグネチャー）の解析を行う。得られたデータから、正常な血液細胞に遺伝子変異が蓄積する原因を解析し、さらに年齢や飲酒、喫煙などの環境因子との関連について解析することにより、血液腫瘍の発症機序を明らかにすることを目的としている。本年度はまず本研究について所属施設の倫理委員会に申請を行い、承認が得られた。多数症例の検体を解析する前の予備実験として血液腫瘍の2症例から造血コロニーの作製およびコロニーから抽出した微量DNAからの全ゲノムシークエンスのライブラリー作成を行う実験を行った。回収したコロニーの大部分からライブラリー作製に必要な量のDNAが抽出可能であり、ライブラリー作成およびシークエンスを行った。解析したデータをがん解析用のパイプラインで解析して体細胞性変異を同定し、変異アレル頻度から作製した造血コロニーが単一細胞由来であることを確認した。今後予定している多数の臨床情報付きの健常人由来血液検体を共同研究施設から提供を受ける共同研究について、所属施設、共同研究施設での倫理審査が完了した。今後多数の健常人血液検体を収集し、年齢や生活歴の情報から症例を選定し、実験・解析を行なっていく予定である。

In this study, the origin of the first cell, the blood cell, the cell, the cell. The cause of the disease was analyzed, the causes of the disease were analyzed, the causes of the disease were analyzed, and the causes of the disease were analyzed. This year, the committee members of the construction and management committee of this study will apply for approval and confirm that it has been approved. In most cases, the blood samples were analyzed before the treatment. In 2 cases, hematopoiesis was detected. The hematopoiesis was performed. The hematopoiesis was performed. The traces of DNA were extracted from the whole body. In most cases, you need to measure the amount of DNA that is necessary to extract the possibility that you will be able to do so. In the analysis of hematopoiesis, the origin of the cells was confirmed by the analysis of the origin of hematopoietic cells. In the future, it is expected that most of them will have sex reports. Normal people will have their blood and physique. The joint research facility will provide them with joint research facilities, research facilities, and joint research facilities. In the future, most of the normal people's blood collection, annual life, emotional symptoms and symptoms are selected and analyzed.

项目成果

Clonal evolution in normal lung tissue leading to lung cancer development

正常肺组织的克隆进化导致肺癌的发展

• 发表时间: 2023
• 作者: Tamaki Sawako;Suzuki Koichi;Abe Iku;Endo Yuhei;Kakizawa Nao;Watanabe Fumiaki;Saito Masaaki;Tsujinaka Shingo;Miyakura Yasuyuki;Ohta Satoshi;Tago Kenji;Yanagisawa Ken;Konishi Fumio;Rikiyama Toshiki;Kenichi Yoshida
• 通讯作者: Kenichi Yoshida

正常組織の全ゲノム解析によるがんの病態解明

通过正常组织的全基因组分析阐明癌症的病理学

• 发表时间: 2023
• 作者: 川瀬航;廣島幸彦;佐藤愼哉;大島貴;宮城洋平;吉田健一
• 通讯作者: 吉田健一