骨髄異形成症候群におけるクローン進化および空間的多様性の解析

骨髓增生异常综合征的克隆进化和空间多样性分析

• 批准号: 26890016
• 负责人: 吉田 健一
• 金额: $ 0.92万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2014-08-29 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-26890016/
• 关键词: 骨髄異形成症候群; クローン進化

骨髄異形成症候群(MDS)とその関連疾患は、血球形態の異常を伴った骨髄不全と急性骨髄性白血病への移行を特徴とし、高齢者に好発する慢性骨髄性腫瘍である。2011年、全エクソンシーケンスによる申請者らの研究によってRNAスプライシング因子の系統的な変異が、本症に特異的かつ高頻度(45-85%)に認められることが明らかにされ、本症の病態の解明に大きな突破口が開かれている(Yoshida et al., Nature. 2011)。そこで、本研究では、同研究成果およびこれに続く近年の申請者らの研究成果を踏まえて、MDSにおける遺伝子変異のMDS 発症・進行および白血病化における遺伝学的な役割を明らかにすることにより、MDS の本質的な病態を明らかにし、さらにはMDS の進行や白血病化に関わる新規の遺伝子を同定することで本症の克服に資することである。26年度に予定していた研究のうち、「大量並列シーケンスによるMDS の変異の全体像とクローン進化の解明」については、これまでに経時的な資料の解析を13症例について初診時を含めて55検体の全エクソン解析を行い、MDSの年余に渡る経過中にはクローン構造が大きく変化している症例が観察され、deep sequencingによる正確なクローン構造の解析を行っている。また、血漿由来DNAについても骨髄検体と同様の遺伝子変異に加えて、血漿由来DNAのみで検出される変異が同定され、空間的多様性の存在が示唆され、deep sequencingによる確認を行っている。また、「MDS の進行および白血病化に関わる遺伝子の同定」については、12症例の経時的な解析から複数のMDSの進行とともに拡大したクローンに存在する遺伝子変異を同定し、さらなる解析を進めている。

Bone marrow and different forming syndrome (MDS) と そ の masato は even disease and abnormal blood cell morphology の を っ た acute leukaemia of sex of bone marrow and bone marrow is not complete と へ の transitional を, 徴 と し good, high 齢 に 発 す る chronic bone marrow sex is swollen sores で あ る. In 2011, total エ ク ソ ン シ ー ケ ン ス に よ る applicants ら の research に よ っ て RNA ス プ ラ イ シ ン グ factor の system な - different が, this disease に specific か つ high frequency (45-85%) に recognize め ら れ る こ と が Ming ら か に さ れ, this disease の pathological の interpret に big き な breach が open か れ て い る (Yoshida et al., Nature. 2011. そ こ で, this study で は, with research お よ び こ れ に 続 く の applicants in recent years ら の research tread を ま え て, MDS に お け る heritage 伝 sub - の MDS 発 disease, carry on お よ び leukemia change に お け る cut but 伝 learn な service を Ming ら か に す る こ と に よ り and the nature of MDS の な pathological を Ming ら か に し, さ ら に は MDS の に an や leukemia masato わ る new rules の heritage 伝 を son be す る こ と で の overcome this disease に endowment す る こ と で あ る. For the year 26, に is designated to study て て た た <s:1> うち, "a large number of parallel シ ケ ケ スによる スによるMDS. の - all like different の と ク ロ ー ン evolution の interpret "に つ い て は, こ れ ま で に 経 な data analytical を の 13 cases of に つ い て を to begin with including め て 55 検 の whole body エ ク ソ ン parsing を い, MDS の crossing over years に る 経 during に は ク ロ ー ン tectonic が big き く variations change し て い る cases が 観 examine さ れ, deep sequencingによる correct な <s:1> ロ ロ ロ <s:1> construction <s:1> analysis を row って る る る. ま た origin, plasma DNA に つ い て も bone marrow と 検 body with others の heritage 伝 sub - different に plus え て origin, plasma DNA の み で 検 out さ れ る - different が with fixed さ れ and many others in space の is が in stopping さ れ, deep sequencing に よ る confirm line を っ て い る. ま た, "MDS の お よ び leukemia change に masato わ る posthumous son 伝 の with" に つ い て は, 12 cases の 経 な when parsing か ら plural の MDS の for と と も に company, big し た ク ロ ー ン に exist す る heritage 伝 sub - different を same し, さ ら な る parsing を into め て い る.

项目成果

Germline mutations of DDX41 predispose to familiar and sporadic MDS/AML

DDX41 种系突变易患熟悉和散发的 MDS/AML

• 发表时间: 2014
• 作者: Ayana Kon;Seishi Ogawa他;Kenichi Yoshida,Seishi Ogawa 他
• 通讯作者: Kenichi Yoshida,Seishi Ogawa 他

次世代シーケンサーの原理と臨床応用

新一代测序仪原理及临床应用

• 发表时间: 2015
• 期刊: 小児外科
• 作者: Chiba K;Shiraishi Y;Nagata Y;Yoshida K;Imoto S;Ogawa S;Miyano S.;吉田健一
• 通讯作者: 吉田健一

PRPF8 defects cause missplicing in myeloid malignancies.

• DOI: 10.1038/leu.2014.144
• 发表时间: 2015-01
• 期刊: Leukemia
• 影响因子: 11.4

ゲノム解析が明らかにした骨髄異形成症候群の原因遺伝子による分類

根据基因组分析揭示的致病基因对骨髓增生异常综合征进行分类

• 发表时间: 2014
• 期刊: 血液内科
• 作者: JUNICHI OKUYAMA;SHIRO KAGAWA;NOBUAKI ARAI;Makoto Tachibana and Shunsuke Kuroki;吉田健一
• 通讯作者: 吉田健一

Understanding the pathogenesis of myelodysplastic syndromes using next-generation sequencing

使用下一代测序了解骨髓增生异常综合征的发病机制

• 发表时间: 2014
• 作者: Kenichi Yoshida;Yusuke Shiozawa;Yasunobu Nagata;Yuichi Shiraishi;Masashi Sanada;Aiko Sato-Otsubo;Yusuke Sato;Ayana Kon;Lee-Yung Shih;Shigeru Chiba;Shuichi Miyawaki;Satoru Miyano;Seishi Ogawa;黒木 俊介;Kenichi Yoshida
• 通讯作者: Kenichi Yoshida