骨髄異形成症候群におけるクローン進化および空間的多様性の解析
骨髄異形成症候群におけるクローン進化および空間的多様性の解析
批准号:
26890016
负责人:
吉田 健一
金额:
$0.92万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份:
2014
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2014-08-29 至 2015-03-31
中文摘要
骨髄異形成症候群(MDS)とその関連疾患は、血球形態の異常を伴った骨髄不全と急性骨髄性白血病への移行を特徴とし、高齢者に好発する慢性骨髄性腫瘍である。2011年、全エクソンシーケンスによる申請者らの研究によってRNAスプライシング因子の系統的な変異が、本症に特異的かつ高頻度(45-85%)に認められることが明らかにされ、本症の病態の解明に大きな突破口が開かれている(Yoshida et al., Nature. 2011)。そこで、本研究では、同研究成果およびこれに続く近年の申請者らの研究成果を踏まえて、MDSにおける遺伝子変異のMDS 発症・進行および白血病化における遺伝学的な役割を明らかにすることにより、MDS の本質的な病態を明らかにし、さらにはMDS の進行や白血病化に関わる新規の遺伝子を同定することで本症の克服に資することである。26年度に予定していた研究のうち、「大量並列シーケンスによるMDS の変異の全体像とクローン進化の解明」については、これまでに経時的な資料の解析を13症例について初診時を含めて55検体の全エクソン解析を行い、MDSの年余に渡る経過中にはクローン構造が大きく変化している症例が観察され、deep sequencingによる正確なクローン構造の解析を行っている。また、血漿由来DNAについても骨髄検体と同様の遺伝子変異に加えて、血漿由来DNAのみで検出される変異が同定され、空間的多様性の存在が示唆され、deep sequencingによる確認を行っている。また、「MDS の進行および白血病化に関わる遺伝子の同定」については、12症例の経時的な解析から複数のMDSの進行とともに拡大したクローンに存在する遺伝子変異を同定し、さらなる解析を進めている。
英文摘要
骨髄異形成症候群(MDS)とその関連疾患は、血球形態の異常を伴った骨髄不全と急性骨髄性白血病への移行を特徴とし、高齢者に好発する慢性骨髄性腫瘍である。2011年、全エクソンシーケンスによる申請者らの研究によってRNAスプライシング因子の系統的な変異が、本症に特異的かつ高頻度(45-85%)に認められることが明らかにされ、本症の病態の解明に大きな突破口が開かれている(Yoshida et al., Nature. 2011)。そこで、本研究では、同研究成果およびこれに続く近年の申請者らの研究成果を踏まえて、MDSにおける遺伝子変異のMDS 発症・進行および白血病化における遺伝学的な役割を明らかにすることにより、MDS の本質的な病態を明らかにし、さらにはMDS の進行や白血病化に関わる新規の遺伝子を同定することで本症の克服に資することである。26年度に予定していた研究のうち、「大量並列シーケンスによるMDS の変異の全体像とクローン進化の解明」については、これまでに経時的な資料の解析を13症例について初診時を含めて55検体の全エクソン解析を行い、MDSの年余に渡る経過中にはクローン構造が大きく変化している症例が観察され、deep sequencingによる正確なクローン構造の解析を行っている。また、血漿由来DNAについても骨髄検体と同様の遺伝子変異に加えて、血漿由来DNAのみで検出される変異が同定され、空間的多様性の存在が示唆され、deep sequencingによる確認を行っている。また、「MDS の進行および白血病化に関わる遺伝子の同定」については、12症例の経時的な解析から複数のMDSの進行とともに拡大したクローンに存在する遺伝子変異を同定し、さらなる解析を進めている。
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Germline mutations of DDX41 predispose to familiar and sporadic MDS/AML
DDX41 种系突变易患熟悉和散发的 MDS/AML
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ayana Kon, Seishi Ogawa他, Kenichi Yoshida,Seishi Ogawa 他]
通讯作者:
Kenichi Yoshida,Seishi Ogawa 他
次世代シーケンサーの原理と臨床応用
新一代测序仪原理及临床应用
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
小児外科
影响因子:
--
作者:
[Chiba K, Shiraishi Y, Nagata Y, Yoshida K, Imoto S, Ogawa S, Miyano S., 吉田健一]
通讯作者:
吉田健一
DOI:
10.1038/leu.2014.144
发表时间:
2015-01
期刊:
Leukemia
影响因子:
11.4
作者:
[]
通讯作者:
ゲノム解析が明らかにした骨髄異形成症候群の原因遺伝子による分類
根据基因组分析揭示的致病基因对骨髓增生异常综合征进行分类
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
血液内科
影响因子:
--
作者:
[JUNICHI OKUYAMA, SHIRO KAGAWA, NOBUAKI ARAI, Makoto Tachibana and Shunsuke Kuroki, 吉田健一]
通讯作者:
吉田健一
Understanding the pathogenesis of myelodysplastic syndromes using next-generation sequencing
使用下一代测序了解骨髓增生异常综合征的发病机制
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kenichi Yoshida, Yusuke Shiozawa, Yasunobu Nagata, Yuichi Shiraishi, Masashi Sanada, Aiko Sato-Otsubo, Yusuke Sato, Ayana Kon, Lee-Yung Shih, Shigeru Chiba, Shuichi Miyawaki, Satoru Miyano, Seishi Ogawa, 黒木 俊介, Kenichi Yoshida]
通讯作者:
Kenichi Yoshida
整閉イデアルの正規還元種数と正規正接錐の研究
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批准号:24K06678
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.5万
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财政年份:2024
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
Concept Driftの網羅探索
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批准号:24K15082
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2024
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
正常肺組織、肺前がん病変のオミックス解析による肺がん発症機序の解明
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批准号:23K27449
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.24万
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财政年份:2024
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
がん抗原特異的メモリーT細胞の検出条件の最適化
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批准号:24H02674
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
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资助金额:$0.3万
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财政年份:2024
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
Study of the mechanisms of lung cancer development through multi-omics analysis of normal tissues and precancerous lesions of the lung
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批准号:23H02758
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$12.06万
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财政年份:2023
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
Study of somatic mutations in normal blood cells using whole-genome sequencing
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批准号:22K20840
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项目类别:Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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资助金额:$1.83万
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财政年份:2022
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
遠隔授業に対応した物理教材の開発
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批准号:21K02936
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.58万
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财政年份:2021
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
整閉イデアルを用いた正標数の特異点の研究
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批准号:19K03430
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.16万
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财政年份:2019
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
離散的なオンラインデータ解析法の開発と応用
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批准号:19H04165
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.82万
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财政年份:2019
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
次世代シーケンサーを用いた骨髄異形成症候群の新規標的遺伝子の探索
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批准号:12J04216
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2012
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
ゲノム機能解析に基づくパスウエイデザインによる有用希少イノシトール類の生産
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批准号:20018016
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.42万
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财政年份:2008
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
共生開始シグナル・イソフラボンを感知するダイズ根粒菌NodDの活性化機構
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批准号:20658019
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2008
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
新たに見出された細胞周期関連遺伝子群の機能解析
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批准号:17770169
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2005
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
PLD法を用いた固体酸化物燃料電地材料の新物質探索
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批准号:16760577
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2004
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
DNA複製因子の機能解析からウイルス増殖制御機構解明へ向けて
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批准号:15659109
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2003
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
枯草菌のアスパラギン生合成の逆遺伝学的研究
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批准号:14704012
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$6.32万
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财政年份:2002
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
枯草菌のイノシトール分解系の解明
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批准号:12760071
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:2000
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
哺乳動物発生・分化におけるBH-プロトカドヘリンの機能解析
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批准号:99J08571
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:1999
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
幹細胞同定のためのGFP標識細胞動物系の開発
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批准号:96J04203
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1998
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负责人:吉田 健一
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依托单位:
枯草菌のイノシトール分解素の解明
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批准号:10760062
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1998
-
负责人:吉田 健一
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依托单位:
海外基金