肝細胞におけるFunctionalGenomics解析系の確立

肝细胞功能基因组分析体系的建立

• 批准号: 13470118
• 负责人: 金子 周一
• 金额: $ 3.46万
• 依托单位: Kanazawa University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 2003
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-13470118/
• 关键词: 肝臓; 慢性肝炎; 肝細胞癌; 遺伝子; ゲノミクス; DNAチップ

遺伝子技術の進歩によって、細胞あるいは臓器において発現している数万種におよぶ遺伝子を同時に包括的に解析する(Genomics)ことが可能となった。肝臓における遺伝子発現の変化は慢性肝炎や肝細胞がんだけでなく、代謝を中心とした肝臓機能の変化とも密接に関連している。本研究では各種の疾病における肝臓の構造および機能とGenomicsとの関連を明らかにするFunctional genomicsの研究開発を行った。正常肝、HBVおよびHCV感染慢性肝炎、肝硬変、肝細胞癌よりなる5種類のSAGEライブフリーを作製し、これらの発現遺伝子のデータベースを構築した。各種の病態における発現遺伝子プロファイルを明らかにし、ウイルス性の慢性肝炎では免疫関連およびストレス関連の遺伝子が亢進しているものの、肝臓機能を示す多くの遺伝子プロファイルは保たれていることを示した。また癌に至ると癌関連の遺伝子が変動するだけでなく、肝臓特有の遺伝子の多くの発現が低下してくることを明らかにした。それらの病態において発現している遺伝子の違いを示した。さらにGenBankに登録されていない多数の新規の遺伝子候補を得て、ヒトゲノム情報を用いた解析を開始した。また細胞回転、癌化、ストレスや免疫関連の遺伝子を選択したDNAチップを作製し、多数例の慢性肝炎および肝細胞癌における発現遺伝子プロファイルの解析を行った。HBVおよびHCVにおける慢性肝炎例のhierarchial clulstering解析では両者が大きく異なる発現遺伝子プロファイルを有していることを示した。また肝細胞癌の解析では、癌の分化度と一致する遺伝子群を明らかにした。これらの解析により、functional genomicsを用いて慢性肝炎および肝細胞癌の診断あるいは治療の選択に役立つ手法を確立できる可能性が示された。

The progress of gene technology, including the development of tens of thousands of genes, including the analysis of genes (Genomics), is possible. The development of liver protein is closely related to the development of liver cells and metabolic centers in chronic hepatitis. This study is aimed at exploring Functional genomics for understanding the relationship between liver structure and function in various diseases. 5 types of SAGE including normal liver, HBV infection, HCV infection, chronic hepatitis, cirrhosis, hepatocellular carcinoma, etc. All kinds of pathological changes occur in the development of chronic hepatitis, which is related to immune system and the development of liver function. The occurrence of cancer related genes is lower than that of liver specific genes. In the middle of the night, the sun rises and the sun rises. Most of the new gene candidates are available in GenBank, and the analysis of the new gene information is initiated. DNA sequencing for the detection of cellular apoptosis, carcinogenesis, and immune-related genes, and analysis of the development of cellular proteins in most cases of chronic hepatitis and hepatocellular carcinoma The hierarchical clustering analysis of HBV and HCV cases shows that there are differences in the development of HBV and HCV. The analysis of hepatocellular carcinoma is consistent with the degree of differentiation of the tumor. The use of analytical and functional genomics in the diagnosis of chronic hepatitis and hepatocellular carcinoma, in the selection of treatment methods, and in the establishment of the possibility

项目成果

Yukihiro Shirota: "Identification of differentially expressed genes in hepatocellular carcinoma with cDNA microarrays"Hepatology. 33・4. 832-840 (2001)

Yukihiro Shirota：“用cDNA微阵列鉴定肝细胞癌中的差异表达基因”Hepatology 832-840（2001）。

Hiroshi F., Kawai: "Alpha-fetoprotein-producing hepatoma cell lines share common expression profiles of genes in various categories demonstrated by cDNA microarray analsis"Hepatology. 33・3. 676-691 (2001)

Hiroshi F., Kawai：“通过 cDNA 微阵列分析证明，产生甲胎蛋白的肝癌细胞系具有共同的基因表达谱”Hepatology 33・3 (2001)。

Tomoya Tsuchiyama: "Improvement of hepatic protoporphyrin accumulation after antibiotic treatment"Digestive Diseases and Sciences. 45. 2411-2413 (2000)

Tomoya Tsuchiyama：“抗生素治疗后肝脏原卟啉积累的改善”消化疾病与科学。

Masao Honda: "Differential Gene Expression Between Chronic Hepatitis B and C Hepatic Lesion"Gastroenterology. 120・4. 955-966 (2001)

本田正夫：“慢性乙型肝炎和丙型肝炎肝损伤之间的差异基因表达”胃肠病学120・4（2001）。

Taro Yamashita: "Serial Analysis of Gene Expression in Chronic Hepatitis C and Hepatocellular Carcinoma"Biochemical and Biophysical Research Communications. 282. 647-654 (2001)

山下太郎：“慢性丙型肝炎和肝细胞癌基因表达的系列分析”生物化学和生物物理研究通讯。