U6核内低分子RNAの触媒機構に関する研究

U6核小RNA催化机制研究

• 批准号: 04272213
• 负责人: 谷 時雄
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1992
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1992 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-04272213/
• 关键词: mRNA前駆体スプライシング; U6核内低分子RNA; U2核内移分子RNA; snRNA; (_-)sTRSV; キメラRNA; イントロン

我々は、mRNA前駆体のスプライシング反応がU6snRNAによって触媒されている可能性を探るため、in vitroで合成したU6snRNAを用いて、5'スプライス部位を含む合成RNAの切断活性を種々の反応条件を用いて検討したが、U6snRNA単独では切断活性は検出されなかった。しかし、U6snRNAと(_-)sTRSVの触媒部位との間に構造的な類似性が見いだされたことから、これら2つのRNAのキメラRNAを作成してその活性を解析したところ、U6snRNAのヘアピン領域の数塩基が(_-)sTRSV型であれば基質RNAに対する切断活性が生じることが判明した。次に、スプライシング触媒活性にはU6snRANのみでなく、U6snRNAと他のsnRNAとの相互作用が必要である可能性を検討した。U6snRNA遺伝子に見いだされたmRNA型イントロンは、何らかのmRNA前駆体からスプライシング反応によって切り出されたイントロンが、逆にスプライシング反応の触媒部位に挿入され、そのcDNAがゲノム内に固定されて生じたという仮説が正しければ、U6snRNA以外に触媒部位を形成するsnRNAが存在する場合、それらのsnRNAの遺伝子にもmRNA型イントロンが生じる可能性がある。そこで、酵母R.hasegawaeにおいて、U6snRNA以外のsnRNAの遺伝子のmRNA型イントロンが存在するかを解析した。その結果、U2RNA遺伝子に60塩基からなる典型的なmRNA型のイントロンが存在していることが明らかになった。しかも、そのmRNA型イントロンが見いだされた位置は、U2snRNAの塩基配列中生物種間に於て極めて良く保存された領域に隣接していた。以上の結果は、U2snRNAがブランチ部位の認識だけでなく、U6snRNAと塩基対合することにより、スプライシング反応触媒部位の形成に深く関与している可能性を示唆する。

U6snRNA is synthesized in vitro and its cleavage activity is detected in the 5'-position of the mRNA precursor. The structural similarity between the catalytic site and the matrix RNA of U6snRNA and (_-)sTRSV was identified. The activity of U6snRNA in the catalytic site and the matrix RNA of (_-)sTRSV was analyzed. In addition, the possibility of interaction between U6 snRNA and other snRNA is discussed. U6snRNA gene fragments are found in mRNA type gene fragments, in mRNA precursor fragments, in reverse transcription fragments, in cDNA fragment fragments, in cDNA fragments, in cDNA fragments The possibility of SNRNA gene mutation is discussed. Analysis of the mRNA types of snRNA genes other than U6snRNA in yeast R. hasegaeae As a result, the U2RNA gene is 60-fold higher than the typical mRNA type. The gene sequence of U2snRNA is closely related to that of U2snRNA. The above results indicate that U2snRNA is closely related to the formation of catalytic sites, and U6snRNA is closely related to the formation of catalytic sites.

项目成果

Tokio Tani: "Synthesis of chimeric RNAs between U6 small nuclear RNA and (-)sTRSV and analysis of their cleavage activities against substrate RNA" IRL Press,Nineteenth Symposium on Nucleic Acids Chemistry. 19-20 (1992)

Tokio Tani：“U6 小核 RNA 和 (-)sTRSV 之间的嵌合 RNA 的合成及其对底物 RNA 的切割活性的分析”IRL Press，第十九届核酸化学研讨会。

Tokio Tani: "Activity of chimeric RNAs of U6snRNA and (-)sTRSV in the cleavage of a substrate RNA" Nucleic Acids Research. 20. 2991-2996 (1992)

Tokio Tani：“U6snRNA 和 (-)sTRSV 的嵌合 RNA 在底物 RNA 裂解中的活性”核酸研究。