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酸化ストレスに対する適応応答のセンサーアクチベータ蛋白OxyRの機能ドメイン解析

传感器激活蛋白 OxyR 对氧化应激适应性反应的功能域分析

基本信息

批准号：
05268206
负责人：
垰和之
金额：
$ 1.6万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1993
资助国家：
日本
起止时间：
1993 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-05268206/
关键词：
転写因子機能ドメインストレス応答

项目摘要

大腸菌OxyR蛋白は、細胞が酸化ストレスにさらされた時に発現する遺伝子群の転写活性化蛋白である。この研究では、OxyR蛋白の持つストレスセンサー、特異的DNA結合能、RNAポリメラーゼとの相互作用などの諸機能が、蛋白内のどの部分によって担われているかを分子遺伝学的手法により明かにすること、及び、OxyR蛋白により発現の調節される遺伝子のうち、未同定のものについて、それをクローン化し構造解析を行うことにより、酸化ストレス応答のうちOxyR応答の全体像を明かにすることを目指している。今年度は、次のような結果が得られた。1)OxyR蛋白が相互作用すると考えられるRNAポリメラーゼ上の部位の同定を行うため、OxyR蛋白による転写活性化に欠損を持つRNAポリメラーゼの変異体を得ることを試み、そのような性質を示す変異体を18クローン得た。変異部位の同定、変異蛋白による試験管内の実験の結果、OxyR蛋白は、RNAポリメラーゼのαサブユニットのC末端に近い部位のうち、2ヶ所と物理的に接触していることを示す証拠が得られた。2)1)で得られたRNAポリメラーゼ変異をサプレスするoxyR遺伝子の変異を同定することにより、RNAポリメラーゼと相互作用するOxyR蛋白内の部位の同定を行うため、oxyR遺伝子にランダムに変異を導入したライブラリーを作成した。現在、これを用いて、oxyR変異株のスクリーニングを行っている。3)OxyR蛋白により発現の調節される遺伝子を修種クローン化した。そのうちのいくつかについては構造解析を行った。現在引き続き残りのクローン構造解析、それらの遺伝子を欠損する変異株の作成などの作業を行っている。

The OxyR protein of E. coli was acidified and activated, and its subgroup was detected by PCR. In order to study the molecular biology of molecular biology, we need to study the molecular biology of OxyR protein, OxyR protein, specific DNA binding, RNA protein interaction, protein binding, DNA binding, protein binding, DNA binding, protein binding, protein binding, Please tell me how to make the analysis line, and then acidify the OxyR to answer the question of the whole body. The results of this year's annual and sub-annual results have been satisfactory. 1) OxyR protein interaction, RNA protein interaction, OxyR protein interaction, RNA protein interaction, protein interaction, protein interaction and activation. The location was determined, the protein was tested, and the results were detected in the tube. OxyR protein, RNA protein, alpha protein, C-terminal proximity, and physical contact were detected. 2) 1) the same location in the OxyR protein, the same location in the OxyR protein, the same position in the OxyR protein, the same sequence in the OxyR protein, the same sequence in the OxyR protein, the same location in the OxyR protein. Now, we need to use the medicine, and the oxyR plant will not be used in any way. 3) the OxyR protein can be used to improve the quality of the virus. Please tell me how to make the parsing line. At present, it is necessary to make an analysis of the operation of the system, and the operation of the plant is in short supply.