モルテン・グロビュール状態における分子内運動のO-ROESY法による研究
モルテン・グロビュール状態における分子内運動のO-ROESY法による研究
批准号:
07280207
负责人:
桑田 一夫
金额:
$1.6万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1995
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1995 至 --
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英文摘要
O-ROESY法のための完全緩和行列法のプログラム(1.CORMA-O-ROESY,2.MARDIGRA-O-ROESY及び3.NONLINEAR-O-ROESY)をFortranで作成した。1は蛋白質または核酸のpdbフォーマット・ファイルから2次元O-ROESYスペクトル強度を算出する。2は、2次元O-ROESY実験から得られた強度から各核間ベクトルの交差緩和時間を完全緩和行列法により算出する。3は2の出力より、スペクトル密度関数(Lipari-Szabotype)のオーダー・パラメーター及び内部回転緩和時間を算出する。2種類の青磁場を用いた場合の3の出力のユニークネスは完全探索法により確認した。またO-ROESY法は未だ理論的に曖昧な部分があったので、れらの点を出来るでけ解決した。即ち、スカラー・カップリングの影響及び遅い(msecオーダー)の運動の影響である。前者はオフ・レゾナンス・ラジオ波照射場では、現実的に無視出来るようになる事が示された。また後者に関しては、O-ROESY法を通じて系統的に観測可能である事が示された。同時にO-ROESY法の量子電磁気力学(QED)的な計算法が、パルスEPRやPHOTON ECHOの様な時間分解光供鳴法に対しても一般に適用出来る事が分かった。実験では,チトクロームCのa.天然状態、b.モルテン・グロピュール状態、c.変性状態について1次元及び2次元O-ROESY測定を行った。1次元スペクトルによる緩和時間解析では、bでは、aやcよりも部分的に緩和時間の短い成分が存在する事が分かった。NMR的にみた場合、これが疎水性コアに由来するのかどうか、現在検討している。
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
桑田 一夫: "蛋白質・核酸系の核磁気緩和現象(I)" 生物物理. 35. 19-23 (1995)
Kazuo Kuwata:“蛋白质/核酸系统中的核磁弛豫现象(I)”生物物理学。 35. 19-23 (1995)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kazuo Kuwata: "Polariztion-Operator Formalism Description of the Off-Resonance ROESY Experiment" J.Magn.Reson.114. 219-229 (1995)
Kazuo Kuwata:“偏共振 ROESY 实验的极化算子形式主义描述”J.Magn.Reson.114。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
細胞内プリオンタンパク質の立体構造、ダイナミクス、及び立体構造変換反応の解明
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批准号:20059016
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.71万
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财政年份:2008
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
原子分解能かつナノ秒時間分解能でのプリオン・フォールディング反応の観測
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批准号:18031015
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.23万
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财政年份:2006
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
プリオン部分ペプチドが作るオリゴマーの立体構造決定
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批准号:17028019
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.97万
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财政年份:2005
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
核磁気共鳴法を用いた新しい抗プリオン薬開発戦略の確立
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批准号:16017238
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.63万
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财政年份:2004
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
温度ジャンプによるプリオン中間体形成反応の速度論的解析
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批准号:16041218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$9.22万
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财政年份:2004
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
プリオン活性型立体構造に基づくプリオン病予防・治療薬の開発
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批准号:14037224
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2002
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
パルスデザインによる蛋白質分子内部運動の解析
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批准号:09261212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:桑田 一夫
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依托单位: