モルテン・グロビュール状態における分子内運動のO-ROESY法による研究

O-ROESY法研究熔球态分子内运动

• 批准号: 07280207
• 负责人: 桑田 一夫
• 金额: $ 1.6万
• 依托单位: Gifu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1995
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1995 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-07280207/
• 关键词: O-ROESY; 緩和行列; スペクトル密度関数; オーダーパラメーター; 緩和時間; モルテン・グロビュール

O-ROESY法のための完全緩和行列法のプログラム(1.CORMA-O-ROESY,2.MARDIGRA-O-ROESY及び3.NONLINEAR-O-ROESY)をFortranで作成した。1は蛋白質または核酸のpdbフォーマット・ファイルから2次元O-ROESYスペクトル強度を算出する。2は、2次元O-ROESY実験から得られた強度から各核間ベクトルの交差緩和時間を完全緩和行列法により算出する。3は2の出力より、スペクトル密度関数(Lipari-Szabotype)のオーダー・パラメーター及び内部回転緩和時間を算出する。2種類の青磁場を用いた場合の3の出力のユニークネスは完全探索法により確認した。またO-ROESY法は未だ理論的に曖昧な部分があったので、れらの点を出来るでけ解決した。即ち、スカラー・カップリングの影響及び遅い(msecオーダー)の運動の影響である。前者はオフ・レゾナンス・ラジオ波照射場では、現実的に無視出来るようになる事が示された。また後者に関しては、O-ROESY法を通じて系統的に観測可能である事が示された。同時にO-ROESY法の量子電磁気力学(QED)的な計算法が、パルスEPRやPHOTON ECHOの様な時間分解光供鳴法に対しても一般に適用出来る事が分かった。実験では,チトクロームCのa.天然状態、b.モルテン・グロピュール状態、c.変性状態について1次元及び2次元O-ROESY測定を行った。1次元スペクトルによる緩和時間解析では、bでは、aやcよりも部分的に緩和時間の短い成分が存在する事が分かった。NMR的にみた場合、これが疎水性コアに由来するのかどうか、現在検討している。

The O-ROESY method and the completely relaxed row method (1.CORMA-O-ROESY,2.MARDIGRA-O-ROESY and 3.NONLINEAR-O-ROESY) are written in Fortran. 1. Calculate the intensity of protein and nucleic acid. 2. Two-dimensional O-ROESY is calculated by the method of complete relaxation of the intersection time between the nuclei. 3. Calculation of the output, selection and density relation (Lipari-Szabotype) and internal return relaxation time. 2. In case of application of green magnetic field, 3. The output of green magnetic field is confirmed by complete search method. The O-ROESY method is not a theoretical ambiguity. That is, the influence of the movement and the influence of the movement. The former is the opposite of the former. The former is the opposite of the latter. The latter is related to the O-ROESY method. At the same time, O-ROESY method and quantum electromagnetic dynamics (QED) calculation method, such as EPR and PHOTON ECHO, are generally applicable. A. Natural state, b. Natural state, c. Variable state, 1-D and 2-D O-ROESY measurement. 1. The analysis of relaxation time in the first dimension is divided into three parts: a, b, c and d. NMR's special circumstances, such as water quality, water quality

项目成果

桑田 一夫: "蛋白質・核酸系の核磁気緩和現象(I)" 生物物理. 35. 19-23 (1995)

Kazuo Kuwata：“蛋白质/核酸系统中的核磁弛豫现象（I）”生物物理学。 35. 19-23 (1995)

Kazuo Kuwata: "Polariztion-Operator Formalism Description of the Off-Resonance ROESY Experiment" J.Magn.Reson.114. 219-229 (1995)

Kazuo Kuwata：“偏共振 ROESY 实验的极化算子形式主义描述”J.Magn.Reson.114。