パルスデザインによる蛋白質分子内部運動の解析
パルスデザインによる蛋白質分子内部運動の解析
批准号:
09261212
负责人:
桑田 一夫
金额:
$1.28万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
1997
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1997 至 --
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英文摘要
酵母で発現したウシβラクトグロブリンA(BLG)の主鎖の原子核を、種々の溶媒条件下で、多次元・多核NMRを用いて帰属し、同時に、主鎖のダイナミクスを調べた。天然状態の溶液中における二次構造は、X線解析の結果とかなり一致していたが、βシートの端が合わない部分が多数認められた。全体として、後半のβシート群が、疎水性のコアを形成しているという考えを支持する結果が得られた。BLGはトリフルオロエタノール(TFE)中でヘリックス構造をとることが知られているが、ヘリックス構造が安定となるTEF50%中において、主鎖の原子を多次元・多核NMRを用いて帰属し、同時に、主鎖のダイナミクスを調べた。得られた二次構造では、約52%のαヘリックスが含まれていた。BLGのα→β転移の中点に当たるTEF15%中で、種々の温度下で、2次元HSQCスペクトルを測定した。この結果、BLGの水溶液中における天然立体構造形成過程においても、後半(β_E〜β_H)部分が先に疎水的なコアを形成するが、前半部分(β_A〜β_D)は局所的相互作用が優勢で、ヘリックスのまま、一時的に留まっていると考えられた。パルス・デザインにおいては、α→β転移のような、ゆっくりした構造揺らぎの周波数を、全ての原子において明らかにするため、多次元・多核NMRにおける、オフ・レゾナンス・スピン・ロックを行うためのパルス系列を複数開発した。これにより、原子の運動を、kMzオーダー周波数として、観測出来るようになると考えられる。現在、TFE15%中のBLGを用い、観測を行っている。
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Kazuo Kuwata: "Rotational correlation times of internuclear vestors in a DNA duplex with G-A mismatch determined in aqueous solution by complate relaxation matrix analysis of off-resonance ROESY (O-ROESY)spectra" J.Magn.Reson.128・1. 70-81 (1997)
Kazuo Kuwata:“通过非共振 ROESY (O-ROESY) 谱的计算机弛豫矩阵分析,在水溶液中确定具有 G-A 错配的 DNA 双链体中核间维斯特的旋转相关时间”J.Magn.Reson.128・1。 81 (1997)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kazuo Kuwata: "Alteration of redox state of human serum albumin in patients under anesthesia and invasive surgery" J.Chromatogr.B. 698. 27-33 (1997)
Kazuo Kuwata:“麻醉和侵入性手术患者中人血清白蛋白氧化还原状态的改变”J.Chromatogr.B。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
桑田一夫: "タンパク質のかたちと物性" 共立出版, 234 (1997)
桑田一夫:“蛋白质的形状和物理性质”Kyoritsu Shuppan,234(1997)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kazuo Kuwata: "Cross-relaxation times of normal and biochemically induced osteoarthritic rabbit knee cartilages" Jpn.J.of Physiol.47・3. 291-297 (1997)
Kazuo Kuwata:“正常和生化诱导的骨关节炎兔膝软骨的交叉松弛时间”Jpn.J.of Physiol.47・3(1997)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kazuo Kuwata: "High level expression of bovine β-Lactoglobulin in Pichia pastoris and characterization of its physical properties" Prot.Eng.in press.
Kazuo Kuwata:“牛 β-乳球蛋白在毕赤酵母中的高水平表达及其物理特性的表征”Prot.Eng.in press。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
細胞内プリオンタンパク質の立体構造、ダイナミクス、及び立体構造変換反応の解明
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批准号:20059016
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.71万
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财政年份:2008
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
原子分解能かつナノ秒時間分解能でのプリオン・フォールディング反応の観測
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批准号:18031015
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.23万
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财政年份:2006
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
プリオン部分ペプチドが作るオリゴマーの立体構造決定
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批准号:17028019
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.97万
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财政年份:2005
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
核磁気共鳴法を用いた新しい抗プリオン薬開発戦略の確立
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批准号:16017238
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.63万
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财政年份:2004
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
温度ジャンプによるプリオン中間体形成反応の速度論的解析
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批准号:16041218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$9.22万
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财政年份:2004
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
プリオン活性型立体構造に基づくプリオン病予防・治療薬の開発
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批准号:14037224
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2002
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
モルテン・グロビュール状態における分子内運動のO-ROESY法による研究
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批准号:07280207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1995
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负责人:桑田 一夫
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依托单位: