細胞内プリオンタンパク質の立体構造、ダイナミクス、及び立体構造変換反応の解明
細胞内プリオンタンパク質の立体構造、ダイナミクス、及び立体構造変換反応の解明
批准号:
20059016
负责人:
桑田 一夫
金额:
$3.71万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2009
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英文摘要
プリオンの立体構造やダイナミクスは、現在まで主に溶液中または結晶中で決定がなされてきた(Kuwata et al., Biochemistry, 2001, 2003)。近年に至り、細胞外でもラフトの周辺でかつ、膜にアンカーしたプリオンに対して構造変換反応が起きることが分かってきた。さらに、標識したプリオンを細胞に注入すると、ゴルジ装置周辺への集積などが見られる。プリオンが細胞内において特異的な挙動を示すことは、プリオンが何らかの特異的な構造を有し、細胞内過程がプリオンの毒性・感染性に関連を有する可能性を示している(Kuwata et al., Proc. Natl Acad. Sci., U.S.A., 2003)。本研究では、細胞内におけるプリオンの立体構造を解析し、その動的性質や、プリオン立体構造変換反応を原子分解能かつリアルタイムで解析した。アフリカツメガエルの卵母細胞の抽出液を用い、細胞内環境に近い状態のプリオンのNMRスペクトルを観測した。その結果、プリオンのNMRスペクトルを観測できたが、プリオンタンパク質は、他の細胞内蛋白質等と相互作用するため、非常に多くの残基に化学シフトの変化が観測された。すなわち、細胞内ではユニークな立体構造を持ち得ない事が分かった。しかし、運動性に関しては、水溶液に近い状態で存在していた。また、スクレイピー感染マウスの脳乳液と^<15>Nラベルしたリコンビナントプリオンタンパク質とを混合し、生理的条件下における異常立体構造変換反応をNMRで観測した。その結果、スクレイピー型への異常構造変換初期過程として、B-ヘリックスのC末端側からB-Cループにかけて顕著な構造変化が観測された。当該部位には、ポリスレオニン配列(TTTT)が含まれており、マイクロ秒からミリ秒の遅い構造揺らぎを示す部位と一致していた。この配列は、哺乳類にしかないため、プリオン異常立体構造変換反応の起源を示すものと考えられる。
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アイソトープ標識化合物及びアイソトープ標識化合物前駆体
同位素标记的化合物和同位素标记的化合物前体
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
プリオン病治療薬の論理的開発をめざして-蛋白質のダイナミクス解析から構造変換制御物質の探索へRational drug discovery for prion diseases-
以朊病毒疾病治疗药物的逻辑开发为目标 - 朊病毒疾病的合理药物发现 - 从蛋白质动力学分析到结构转化控制物质的寻找
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
蛋白質核酸酵素 53
影响因子:
--
作者:
[Kei-ichi Yamaguchi, et.al., 桑田一夫]
通讯作者:
桑田一夫
Small anti-HIV compounds found with in silico screening and MTT assay
通过计算机筛选和 MTT 测定发现小型抗 HIV 化合物
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hironori K, Nakamura]
通讯作者:
Nakamura
抗インフルエンザ薬の開発を目指したNucleoprotein結合化合物のスクリーニング
筛选核蛋白结合化合物用于开发抗流感药物
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hironori K, Nakamura, 桑田一夫, 上田敦史]
通讯作者:
上田敦史
DOI:
10.1016/j.cplett.2009.04.045
发表时间:
2009-05-25
期刊:
CHEMICAL PHYSICS LETTERS
影响因子:
2.8
作者:
[Ishikawa, Takeshi, Kuwata, Kazuo]
通讯作者:
Kuwata, Kazuo
共 67 条
原子分解能かつナノ秒時間分解能でのプリオン・フォールディング反応の観測
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批准号:18031015
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$7.23万
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财政年份:2006
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
プリオン部分ペプチドが作るオリゴマーの立体構造決定
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批准号:17028019
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.97万
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财政年份:2005
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
核磁気共鳴法を用いた新しい抗プリオン薬開発戦略の確立
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批准号:16017238
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.63万
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财政年份:2004
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
温度ジャンプによるプリオン中間体形成反応の速度論的解析
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批准号:16041218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$9.22万
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财政年份:2004
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
プリオン活性型立体構造に基づくプリオン病予防・治療薬の開発
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批准号:14037224
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2002
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
パルスデザインによる蛋白質分子内部運動の解析
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批准号:09261212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
モルテン・グロビュール状態における分子内運動のO-ROESY法による研究
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批准号:07280207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1995
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负责人:桑田 一夫
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依托单位:
海外基金