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温度ジャンプによるプリオン中間体形成反応の速度論的解析

温度ジャンプによるプリオン中間体形成反応の速度論的解析
温度跳跃引起的朊病毒中间体形成反应的动力学分析
批准号:
16041218
负责人:
桑田 一夫
金额:
$9.22万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005

项目摘要

项目成果

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これまで一般的に用いられて来た高速混合法の時間分解能は100マイクロ秒からミリ秒のオーダーであり、蛋白質の構造形成過程を観測するには不十分な場合が多かった。たとえば、マウスプリオンのフォールディング反応の場合、ヘリックスB,Cの形成反応は50μsの時定数で起きるが、ヘリックスAの形成反応はさらに速く、これまでに時定数を求める試みには成功していない。一方、格子モデルを用いた我々の計算機シュミレーションの結果は、非指数関数的な速度過程がフォールディング反応の初期に出現することを示している。我々は、蛋白質の速いフォールディング反応を追跡するため、ナノ秒分解能をもつレーザー温度ジャンプシステムの開発を行った。本システムでは、YAGレーザーにより発振された波長1064nmのパルスレーザー光が、水素ガスを封入されたラマンシフターを通り、1907nmの光に変換される。このレーザー光は、サンプル水溶液に吸収され、サンプルの温度を上昇させる。観測光はXeランプを用いた白色の連続光を用いた。検出側は、ナノ秒時間分解能を持つ光電子増倍管を用いた。このシステムにより、温度ジャンプに伴う蛋白質のナノ秒スケールでの応答を、紫外吸収、あるいは、蛍光を用いてモニターすることが可能となった。我々は本システムを用いて蛋白質β-ラクトグロブリンの低温変性からの巻き戻り反応を観測し、反応開始後30μsに出現する新たな反応過程をみいだした。この反応過程は、現在まで観測されたことのない特徴的な非指数関数的挙動を示した。現在、この反応過程の理論的解析を行っている。
期刊论文(14)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1128/cvi.13.3.415-419.2006
发表时间: 2006-03
期刊: Clinical and Vaccine Immunology
影响因子: --
作者: [K. Kimura;M. Nagaki;J. Nishihira†;S. Satake;Kazuo Kuwata;H. Moriwaki]
通讯作者: K. Kimura;M. Nagaki;J. Nishihira†;S. Satake;Kazuo Kuwata;H. Moriwaki
タンパク質科学-構造・物性・機能-
蛋白质科学-结构、物理性质、功能-
DOI: --
发表时间: 2005
期刊:
影响因子: --
作者: [K.Kimura, H.Moriwaki, M.Nagaki, M.Saio, Y.Nakamoto, M.Naito, K.Kuwata, F.V.Chisari, Kiminori Kimura, Kiminori Kimura, 桑田一夫, Akio Soeda, Kazuyuki Hashimoto, 桑田 一夫 編著, Kazuo Kuwata, 桑田一夫]
通讯作者: 桑田一夫
プリオン中間体と治療薬開発--分子感染機構と創薬制御
朊病毒中间体与治疗药物开发--分子感染机制与药物发现控制
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: 蛋白質核酸酵素 49
影响因子: --
作者: [桑田一夫]
通讯作者: 桑田一夫
Pathogenic role of B cells in anti-CD40 caused necroinflammatory liver disease.
B 细胞在抗 CD40 引起的坏死性肝病中的致病作用。
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: The American journal of Pathology. 168
影响因子: --
作者: [K.Kimura, H.Moriwaki, M.Nagaki, M.Saio, Y.Nakamoto, M.Naito, K.Kuwata, F.V.Chisari, Kiminori Kimura, Kiminori Kimura]
通讯作者: Kiminori Kimura
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    細胞内プリオンタンパク質の立体構造、ダイナミクス、及び立体構造変換反応の解明
    • 批准号:
      20059016
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.71万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      桑田 一夫
    • 依托单位:
    原子分解能かつナノ秒時間分解能でのプリオン・フォールディング反応の観測
    • 批准号:
      18031015
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $7.23万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      桑田 一夫
    • 依托单位:
    プリオン部分ペプチドが作るオリゴマーの立体構造決定
    • 批准号:
      17028019
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $3.97万
    • 财政年份:
      2005
    • 负责人:
      桑田 一夫
    • 依托单位:
    核磁気共鳴法を用いた新しい抗プリオン薬開発戦略の確立
    • 批准号:
      16017238
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $5.63万
    • 财政年份:
      2004
    • 负责人:
      桑田 一夫
    • 依托单位:
    海外基金