原子レベルの立体構造に基づくチトクロム酸化酵素の動作機構の解明
原子レベルの立体構造に基づくチトクロム酸化酵素の動作機構の解明
批准号:
11169233
负责人:
伊藤 恭子
金额:
$13.12万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 2003
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チトクロム酸化酵素はミトコンドリア内膜呼吸鎖の末端酸化酵素で分子状酸素を水にまで還元するとともに膜の内側から外側へとプロトンの能動輸送を行う。この酵素の機能の解明のためには立体構造に関する情報が不可欠であるため、我々のグループではX練結晶構造解析を進めている。本酵素を真の意味で理解するためには酸化型だけでなく還元状態や配位子又は、阻害剤結合状態の異なる種々の酵素の水素の座標を含めた詳細な構造を明らかにする必要がある。本研究では結晶化条件、結晶の凍結方法等の改良を行うことにより酸化型では1.8Å分解能での構造が明らかにした。又、この酸化型結晶を各種溶液に浸せきさせることで還元状態や配位子結合状態の異なる結晶を低温捕捉した。これまでに、還元型1.9Å,CO結合型2.1Å,NO結合型2.1Å,CN結合型2.1Å,P型中間体1.86Å、F型中間体2.0Å分解能でのX線結晶構造を各々決定することに成功した。又、結晶用の分光器を作製したことによりこれらの結晶が各々の状態であることを直接結晶の吸収スペクトルを測定することによって確かめられるようになった。このようにまだ水素の位置を決定できるほどに精度は上がっていないものの、かなり詳細に構造の比較検討ができるようになった。酸化還元に伴って大きく変化することが認められたアスパラギン酸51のカルボキシル基がヘムaのプロピオン酸やアルギニン38を介して、マトリックス側から細胞質側へとプロトンを能動輸送するのに重要な働きをすることが新たに確かめられた。また、このカルボキシル基の変化はFTIRで我々の結晶標品を用いた得られた結果ともよく一致した。
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Kim: "Presence of the heme-oxo intermediate in oxygenation of carbon monoxide by cytochrome c oxidase revealed by resonance Raman spectroscopy"J.Am.Chem.Soc.. 123. 757-758 (2001)
Kim:“通过共振拉曼光谱揭示细胞色素 C 氧化酶氧化一氧化碳过程中血红素-氧代中间体的存在”J.Am.Chem.Soc.. 123. 757-758 (2001)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Odoko M.: "Optimization of the constant of methionine S^δ-C^ε bond for X-PLOR refinement of protein structure"J.Appl.Cryst.. 34. 80-81 (2001)
Odoko M.:“蛋氨酸 S^δ-C^ε 键常数的优化,用于蛋白质结构的 X-PLOR 精修”J.Appl.Cryst.. 34. 80-81 (2001)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Lee S.J.: "Intermonomer interactions in dimmer of bovine heart cytochrome c oxidase"Acta Cryst.. D57. 941-947 (2001)
Lee S.J.:“牛心细胞色素 c 氧化酶二聚体中单体间的相互作用”Acta Cryst.. D57。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
S.Yoshikawa: "Hand bock of Copper Pharmacology and Toxicology"Humana Press Inc. Totowa NJ. 21 (2002)
S.Yoshikawa:“铜药理学和毒理学手册”Humana Press Inc. Totowa NJ。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
コール酸フリー呼吸鎖複合体Ⅳ標品による進化で獲得した核由来サブユニットの機能解明
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批准号:22K06130
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2022
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负责人:伊藤 恭子
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依托单位:
三次元構築肝細胞、胃上皮細胞を用いたヘリコバクター感染の詳細解明
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批准号:20590457
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.16万
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财政年份:2008
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负责人:伊藤 恭子
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依托单位:
木部分化過程における新奇制御因子の単離と分子ネットワークの解析
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批准号:19870005
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
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资助金额:$2.0万
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财政年份:2007
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负责人:伊藤 恭子
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依托单位:
単量体、2量体ウシチトクロム酸化酵素の構造と機能
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批准号:17048028
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2005
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负责人:伊藤 恭子
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依托单位:
長期入院児の学校復帰に際しての心理教育的援助〜原場教師の視点から〜
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批准号:15905007
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
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资助金额:$0.15万
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财政年份:2003
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负责人:伊藤 恭子
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依托单位:
P.denitrificansチトクロム酸化酵素の2次元結晶化及び電子線回折実験
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批准号:04780184
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1992
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负责人:伊藤 恭子
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依托单位:
思考訓練による小学校低学年学業不振児の治療教育
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批准号:X40235-----15007
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists
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资助金额:$0.03万
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财政年份:1965
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负责人:伊藤 恭子
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依托单位:
海外基金