SNPs探索分子素子(ミスマッチ結合分子リガンド)の開発

SNP探索分子装置（错配结合分子配体）的开发

• 批准号: 14013033
• 负责人: 中谷 和彦
• 金额: $ 4.1万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14013033/
• 关键词: ミスマッチ; DNA; ナフチリジン; SNP

我々は従来のSNPs探索手法とは根本的に異なる、全く新しいSNPs検出コンセプトを創案し、G-Gミスマッチに結合するナフチリジン二量体を分子設計し、これを表面プラズモン共鳴センサーに固定した、「SNPs探索分子素子」を提案しこれを実証した。このナフチリジンダイマーの分子設計指針を拡張し、他のミスマッチ認識を高精度で認識する分子の創製を目指す。一方、ナフチリジン二量体が極めて強くG-Gミスマッチに結合することを利用して、全てのミスマッチをナフチリジンダイマーを用いて検出する手法を検討した。1)成果の内容(1)G-Gミスマッチ-ナフチリジンダイマー複合体の構造を明らかにした。GSC菊地博士との共同研究により、複合体の構造を我々が提案しているジグザグインターカレーションであることを明らかにした。これにより、次の分子設計指針を明確に出来た。(2)G-Aミスマッチに結合する分子の開発に成功した。アデニンを認識するナフチリドンとグアニンを認識するナフチリジンのハイブリッド分子を用いて、G-AミスマッチDNAを強く安定化することに成功した。(2)A-Aミスマッチの認識に成功した。A-Aミスマッチを極めて強く安定化することに成功した。複合体構造をNMRにより解析中である。全ての研究内容に関して、国内外を問わず我々が最先端の研究成果を挙げている。自前のコンセプトに基づく研究であり、他の追随を許していない。現時点では、T-Tミスマッチは、水素結合パターンがマッチする分子を用いているにもかかわらず、安定化出来ない。G-G、G-A、A-Aミスマッチは全てプリン塩基だけが関わるミスマッチであったので、ピリミジン塩基であるTの認識には根本的に何か考えが足りない可能性がある。

I 々 は 従 to の SNPs exploration technique と は fundamental に different な る, whole new し く い SNPs 検 out コ ン セ プ ト を gestate し, G - G ミ ス マ ッ チ に combining す る ナ フ チ リ ジ ン two を し molecular design, quantity body こ れ を surface プ ラ ズ モ ン resonance セ ン サ ー に fixed し た, proposed "SNPs to explore molecular subtype eumelanin" を し こ れ を card be し た. こ の ナ フ チ リ ジ ン ダ イ マ ー の pointer を molecular design company, zhang し, he の ミ ス マ ッ チ knows を high-precision で す る molecular の created を refers す. Party, ナ フ チ リ ジ ン 2 quantity body が め extremely strong て く G - G ミ ス マ ッ チ に combining す る こ と を using し て, whole て の ミ ス マ ッ チ を ナ フ チ リ ジ ン ダ イ マ ー を with い て 検 out す る gimmick を beg し 検 た. 1) Results and contents: (1)G-G ッチ ス ッチ-ナフチリジ ナフチリジ ダ <s:1> <s:1> complex <s:1> structure を figure ら ら に に た た GSC chrysanthemum to Dr と の joint research に よ り, complex の structure を I 々 が proposal し て い る ジ グ ザ グ イ ン タ ー カ レ ー シ ョ ン で あ る こ と を Ming ら か に し た. <s:1> れによ れによ, the sub-molecular design pointer を is clearly に た. (2)G-A ッチに ス ッチに ッチに combined with する molecule ス successfully developed に and <s:1> た. ア デ ニ ン を know す る ナ フ チ リ ド ン と グ ア ニ ン を know す る ナ フ チ リ ジ ン の ハ イ ブ リ ッ を ド molecules with い て, G - A ミ ス マ ッ チ DNA を strong く stabilization す る こ と に successful し た. (2)A-A ッチ ス ッチ ッチ ッチ recognize に success た. A-A ス ス ッチを extremely めて strong く stabilization する とに とに successful た た. Complex structure をNMRによ である in the analysis である. The entire て て research content に is related to <s:1> て, domestic and foreign を questions わず, my 々が most advanced <s:1> research results を挙げて る る る. Since his predecessor コ セプトに セプトに based his づく research on であ, he <s:1> followed を xu て な な な. Now point で は, T - T ミ ス マ ッ チ は, water element combination パ タ ー ン が マ ッ チ す る molecular を with い て い る に も か か わ ら ず, stabilization な い. , G - G - G A, A - A ミ ス マ ッ チ は full て プ リ ン salt base だ け が masato わ る ミ ス マ ッ チ で あ っ た の で, ピ リ ミ ジ ン salt base で あ る T の know に は what fundamental に か exam え が foot り な い possibility が あ る.