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ミスマッチ構造認識分子を活用するSNPs探索システムの構築

ミスマッチ構造認識分子を活用するSNPs探索システムの構築
使用错配结构识别分子构建SNP搜索系统
批准号：
12024210
负责人：
中谷 和彦
金额：
$1.73万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2000 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12024210/
关键词：
SNPG-GミスマッチSPR分子認識

项目摘要

项目成果

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SNPsの探索は、緊急かつ極めて重要な課題であり、様々な検出手法が提案され利用されている。現時点でSNPs検出に最も有効な手法と考えられているDNAチップを用いる方法は、チップ作成にかかる時間、コストをどの様に低減させるかなど、将来に渡って大規模にかつ日常的に使用する上での問題点が指摘されていた。多量のサンプルから確実にSNPsを含んでいるサンプルをスクリーニングにより選別しておくことにより解決できるが、塩基配列に関係なくSNPsの存在を検出する手法は知られていなかった。本研究「ミスマッチ構造認識分子を活用するSNPs探索システムの構築」では、SNPsの一つとして、グアニン-グアニン(G-G)ミスマッチを標的として選び、G-Gミスマッチを含むDNAに高感度で結合するG-Gミスマッチ認識分子の開発に成功した。我々の創出したG-Gミスマッチ認識分子は低分子ながら、G-Gミスマッチに対して1×10の7乗(M^<-1>)の結合常数を示し、G-Aミスマッチに比べて600倍以上のG-G選択性を示すことを明らかにした。この分子を表面プラズモン共鳴(SPR)センサーのチップ表面に固定化し、ミスマッチDNAの検出を試みた。その結果G-Gミスマッチを含む27bpのDNAに対して、顕著な応答すなわちセンサーチップへのDNAの結合が確認された。対照実験としてG-A、G-Tミスマッチを含むDNAを用いた場合では応答は弱く、ミスマッチを含まないDNAによる応答強度と大差なかった。この結果から、G-Gミスマッチ認識分子を固定化したSPRチップを使った新しいSNPs検出法が実際に可能であることが示唆された。
期刊论文(1)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Kazuhiko Naka Tani: "Scanning of G-G mismatch in DNA by synthetic ligand using surface plasmon resonance"Nature Biotechnology. 19. 51-55 (2001)
Kazuhiko Naka Tani：“使用表面等离子体共振通过合成配体扫描 DNA 中的 G-G 错配”《自然生物技术》。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Elucidation of the binding pathway of mismatch-binding molecules to abnormally elongated repeat sequences and their shortening-inducing effects
  • 批准号：
    22H00351
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额：
    $27.29万
  • 财政年份：
    2022
  • 负责人：
    中谷 和彦
  • 依托单位：
    Osaka University
ナノポアシーケンサーにおける一塩基分解能を達成する塩基読み取り分子に関する研究
  • 批准号：
    14F04039
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $1.47万
  • 财政年份：
    2014
  • 负责人：
    中谷 和彦
  • 依托单位：
    Osaka University
RNA鎖中の(CAG)nリピート配列を認識する低分子リガンドの創製に関する研究
  • 批准号：
    06F06061
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额：
    $1.54万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    中谷 和彦
  • 依托单位：
    Osaka University
CAGリピート結合リガンドの発見に基づいたリピート伸長抑制
  • 批准号：
    17019039
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $3.07万
  • 财政年份：
    2005
  • 负责人：
    中谷 和彦
  • 依托单位：
    Osaka University