植物SRY遺伝子:ナデシコ科雌雄異株植物ヒロハノマンテマのY染色体特異的遺伝子

植物SRY基因：Hirohanomatema（石竹科雌雄异株植物）的Y染色体特异性基因。

• 批准号: 14014209
• 负责人: 河野 重行
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14014209/
• 关键词: 雌雄異株植物; ヒロハノマンテマ; Y染色体; 植物SRY遺伝子; BACライブラリー; RAPD-PCR法; STSマーカー; FISH法

本研究の目的は、ヒロハノマンテマ(9,400Mb)のY染色体(860Mb)の雄性決定領域とそこにコードされた雄性決定遺伝子(植物のSRY遺伝子)を同定することにある。このため、雄ゲノムを用いたBACライブラリーの構築を進めている。ヒロハノマンテマのY染色体STSマーカー(ScD05)に類似した配列を含むBACクローン断片を得た。この断片には蕾で優先的に発現している遺伝CCLS96.1が存在しており、雄では葉より蕾において転写産物の蓄積が多く、雌の蕾では蓄積がほとんどないことがわかった。ただし、CCLS96.1は、non-coding RNAで、タンパク質をコードしていないことが示唆された。ヒロハノマンテマの染色体末端には、特徴的なサテライトDNA(S1-distal-satDNA)が、常染色体では8対の両腕と3対の片腕に局在し、性染色体てはX染負体の両碗とY染色体の下腕に局在する。構築中のBACライブラリーからS1-distal-SatDNAの繰り返し構造を含む11個のBACクローンを単離した。各クローンの繰り返し単位(約310bp)の塩基配列を決定し、近隣結合法を用いて無根系統樹を作成したところ、11個のBACクローンより得られた繰り返し単位は4つのクラスター(SacI, KpnI, E, Fファミリー)を形成した。染色体上の分布を調べるため、KpnIファミリーとSacIファミリーの配列をプローブとしてマルチカラーFISHを行ったところ、KpnIファミリーは7番染色体に存在することを見出した。KpnIファミリーを含むBACクローン(#15B12)にはKpnIファミリー約450個からなるストレッチがほぼ完全に含まれているが、このストレッチに隣接する領域はY染色体短腕末端に相同性があることが示唆されている。この領域付近でY染色体特異的遺伝子の探索を続行している。

The purpose of this study is to determine the male determination of the Y chromosome (860Mb) of the ヒロハノマンテマ(9,400Mb) The field of determination is the same as the male determination of the field of determination.このため, 男ゲノムを Use いたBACライブラリーのconstruct を入めている.ヒロハノマンテマのY chromosome STSマーカー(ScD05) is similar to the したalignment and contains the むBAC クローン fragments.この片には雷で Prioritized に発成している伝CCLS96.1がexistent しており、男では叶The product of より雷において転writes the product の accumulates が多く, and the female の雷では accumulates がほとんどないことがわかった.ただし, CCLS96.1は, non-coding RNA で, タンパク之quality をコードしていないことが时憆された.ヒロハノマンテマのchromosome terminal には, special なサテライトDNA (S1-distal-satDNA)が, The autosomal chromosomes are the upper and lower parts of the body, and the sex chromosomes are the X chromosome and the Y chromosome. The BAC system under construction contains 11 BAC components. Each クローンの缲り returned to the single digit (approximately 310 bp) was determined based on the base alignment, and the nearest neighbor method was used to create an unrooted phylogenetic tree. Made of したところ、11のBACクローンより得られた缲り回し単bitは4つのクラスター(SacI, KpnI, E, Fファミリー)をformingした. Distribution on chromosomesルチカラーFISHを行ったところ, KpnIファミリーは7 chromosomes にexistent することを见出した. KpnIファミリーを有BACクローン(#15B12)にはKpnIファミリーabout 450 からなるストレッチがほぼComplete にcontaining まれているが, このストレッチに adjacent する field はY chromosome short wrist end にidentity があることが Show 唆されている. The field is close to the Y-chromosome-specific inheritance and exploration.

项目成果

Nakao, S.: "RAPD isolation of a Y chromosome-specific ORF in a dioecious plant, Silene latifolia"Genome. 45. 413-420 (2002)

Nakao, S.：“雌雄异株植物 Silene latifolia 中 Y 染色体特异性 ORF 的 RAPD 分离”基因组。

Uchida, W.: "Distribution of internal telomere-like repeats and their adjacent sequences in a dioecious plant, Silene latifolia"Chromosoma. 111. 313-320 (2002)

Uchida, W.：“雌雄异株植物 Silene latifolia 中内部端粒样重复及其相邻序列的分布”染色体。

Uchida, W.: "Interstitial telomere-like repeats in the genome of Arabidopsis thaliana"Genes Genet.Syst.. 77. 63-67 (2002)

Uchida, W.：“拟南芥基因组中的间质端粒样重复”Genes Genet.Syst.. 77. 63-67 (2002)

Obara, M.: "A plant Y chromosome-STS marker encoding a degenerate retrotransposon"Genes Genet. Syst.. 77. 393-398 (2002)

Obara, M.：“编码简并逆转录转座子的植物 Y 染色体-STS 标记”Genes Genet。

Miyazawa, Y.: "Isolation and expression of a novel starch-storing cell-specific gene containing the KH RNA binding domain from tobacco-cultured cells BY-2"J.Exp.Bot.. 53. 2451-2452 (2002)

Miyazawa, Y.：“从烟草培养细胞 BY-2 中分离和表达一种新型淀粉储存细胞特异性基因，其含有 KH RNA 结合结构域”J.Exp.Bot.. 53. 2451-2452 (2002)