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植物SRY遺伝子:ヒロハノマンテマのY染色体特異的ゲノム構造と雄性決定遺伝子

植物SRY基因：Y染色体特异性基因组结构和Hirohanomatema雄性性别决定基因

基本信息

批准号：
15013215
负责人：
河野重行
金额：
$ 3.58万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究の目的は、ナデシコ科の雌雄異株植物、ヒロハノマンテマSilene latifoliaのY染色体にある雄性決定領域とそこにコードされた雄性決定遺伝子(植物SRY遺伝子)を同定することにある。こうした研究を通じて、1)植物の巨大ゲノムの一部(本研究課題ではY染色体)のみを研究対象として取り扱う手法を確立し、2)高等植物にも拘わらず性染色体が発達した意味を明らかにする。具体的な研究目標は、1)BACライブラリーを拡充し、2)Y染色体上腕末端にある繰返し配列やSTSマーカーを指標にY染色体特異的なBACクローンのコンティグを構築する。3)コンティグを精査し繰返し配列やSTSマーカー近傍からY染色体特異的な遺伝子を見出す。4)ヒロハノマンテマあるいはアラビドプシスを用いた性転換系を確立し、新に単離されたY染色体特異的な遺伝子の性転換能を検証できるシステムを構築する。平成15年度の具体的な研究実施計画に関しては、高等植物から無傷のDNAを大量に単離する方法を確立し、Y染色体上腕末端に特異的な繰返し配列を指標に、BACクローンのコンティグを構築することを研究の中心とした。具体的には、1)BACライブラリーの拡充:13年度以降細胞核の単離法に改良を加え、BACクローンの獲得数を飛躍的に増大させた。現在のBACライブラリーは、クローン数32,642、インサートサイズ50〜200kbで、ゲノムのカバー率は約80%となっている。2)Y染色体特異的BACクローンの単離:Y染色体特異的STSを用いた4D-PCR高速スクリーニングで上記のBACライブラリーから7つのY染色体特異的BACクローンを単離した。3)BACクローンのシーケンスとY染色体特異的遺伝子の検出:FISH法によってY染色体特異的配列の蓄積が最も著しいと推定された127kのインサートをもつMS2-9d12Fの前塩基配列をショットガンシーケンスし、47個のORFを同定した。

The purpose of this study is to identify the male and female plants of the family SRY (plant SRY). The Y chromosome of the plant is the same as that of the male (plant). The purpose of this study is to determine the accuracy of the study. (1) the study of the giant plant (the subject of this study is on the Y chromosome). The purpose of the study is to make sure that the technique is established, and 2) the sex chromosome of higher plants means that it is clear that the sex chromosome is not available. The specific research objectives are as follows: 1) BAC chromosome filling, 2) the wrist terminal end of the Y chromosome is arranged with the line "STS chromosome", which refers to the "BAC" of the Y chromosome characteristic. 3) if you want to get back to STS, you will find that there is a special Y chromosome in your cell. 4) in order to make sure that the sex is fixed and the Y chromosome is special, the sex can be detected in the first place. 4) in the first place, it is necessary to make sure that the Y chromosome is specific. In the 15 years of Pingcheng, specific research programs were carried out in Pingcheng, a large number of isolation methods were confirmed in higher plant DNA, special arrangements were made at the wrist end of the Y chromosome, and BAC was used in the research center. Specific information, 1) BAC drugs are used in the following years: in the 13th year, the nuclei of the cells were improved and added, and the BAC cells were collected in the first few years. At present, the rate of BAC infection is about 32642 per cent, and the rate is about 80 per cent per month. 2) BAC