RNA蛋白複合体の情報発現分子機械としての動的機構

RNA蛋白复合物作为信息表达分子机器的动力学机制

• 批准号: 14035251
• 负责人: 嶋本 伸雄
• 金额: $ 1.79万
• 依托单位: National Institute of Genetics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14035251/
• 关键词: 大腸菌RNAポリメラーゼ; DNAスライディング; DNAグルーブ; グルーブトラッキング; ナノ回転計

多くのDNA結合タンパク質は、DNAの特定の位置(specific site)に結合した特異的複合体(specific complex)として機能する。specific complexは、タンパク質のDNA上のスライディングをとおして形成されることがあることを1993年に大腸菌RNA polymeraseを用いて証明した。スライディングはspecific complexの形成を加速する。しかし、スライディング時に塩基配列をどのようにして、読みとるのか、ということと、細胞内のRNA上のスライディングをどのようにして防いでいるかは長らく不明であった。もし、スライディング時にタンパク質がgroove trackingを行うならば、スライディング時に常時塩基配列は読め、また、RなにはB型DNAのようなgrooveは存在しないので、上記の疑問は解決する。そこで樹脂ビーズに蛍光小球を一つ結合させ、ナノ回転計を作製した。この回転計を光ピンセットで基盤表面から2-3μmの位置に固定し(回転は自由)、DNAをトルクが伝わるように、複数のビオチンアビジン結合により固定した。この回転計の運動を、(1)DNA無し、(2)DNAは有るが、大過剰のヘパリンや短鎖DNAをくわえて、スライディング複合体が形成できないようにした(3)DNAは有り、スライディング複合体は形成できるが、基盤は固定して、特定の方向の回転は誘起されない系(4)(3)の系で、基盤を一方向に動かし、特定の方向の回転を誘起すると、(4)の場合のみ、連続的な回転運動が観測された。この結果はgroove trackingが存在することを証明しており、上記の問題に対する回答が得られた。

Many DNA-binding proteins bind to specific sites of DNA and function as specific complexes. Specific complex, DNA, DNA The formation of specific complexes is accelerated. When the gene is aligned, the gene is aligned, and the RNA in the cell is aligned. For example, if the DNA type is B, the DNA type is B. If the DNA type is B, the DNA type is B. For example, if you want to make a reservation, please contact us. The light source of this kind is fixed at the position of 2 - 3 μ m on the surface of the substrate (free), DNA is fixed at the position of 2 - 3 μ m on the surface of the substrate (free), DNA is fixed at the position of 2 - 3 μ m on the surface of the substrate (free), and DNA is fixed at the position of 2 - 3 μ m on the surface of the substrate (free). (1) DNA does not exist;(2) DNA does not exist;(3) DNA does not exist;(4) DNA does not exist;(5) DNA does not exist;(6) DNA does not exist;(7) DNA does not exist;(8) DNA does not exist;(9) DNA does not exist;(10) DNA does not exist;(11) DNA does not exist;(12) DNA does not exist;(13) DNA does not exist;(14) DNA does not exist;(15) DNA does not exist;(16) DNA does not exist;(17) DNA does not exist;(18) DNA does not exist;(19) DNA does not exist;(19) DNA does not exist;(10) DNA does not exist;(10) DNA does not exist;(11) DNA does not exist;(10) DNA does not exist;(19) DNA does not exist;(10) DNA does not exist;(10) DNA does not exist;(11) DNA does not exist;(10) DNA does not (4) The movement of the ring and the ring is measured. The result is that groove tracking exists and the answer to the question is obtained.

项目成果

嶋本伸雄: "分子レベルで見たタンパク質とDNAとの結合"総研大ジャーナル. 1. 42-47 (2002)

Nobuo Shimamoto：“蛋白质和 DNA 在分子水平上的结合”Sokendai Journal 1. 42-47 (2002)。

Susa, M., Sen, R., Shimamoto, N.: "Generality of the branched pathway in transcription initiation by Escherichia coli RNA polymerase"J.Biol.Chem.. 277. 15407-15412 (2002)

Susa, M.、Sen, R.、Shimamoto, N.：“大肠杆菌 RNA 聚合酶转录起始中分支途径的一般性”J.Biol.Chem.. 277. 15407-15412 (2002)

嶋本伸雄: "ナノバイオマシン〜世界が血眼の次世代デバイスの代表"NIF NEWS. 12月号. 2-2 (2002)

Nobuo Shimamoto：“纳米生物机器 - 令世界兴奋的下一代代表性设备”NIF NEWS 12 月 2-2 号（2002 年）。

嶋本伸雄: "わかる実験医学(原核生物の転写反応)"羊土社(In press). (2003)

Nobuo Shimamoto：“了解实验医学（原核生物的转录反应）”Yodosha（正在出版）（2003 年）。

Shimamoto, N: "Movements of RNA polymerase along DNA in Methods of Enzymology"Methods of Enzymology. (in press). (2003)

Shimamoto, N：“酶学方法中 RNA 聚合酶沿 DNA 的运动”酶学方法。