核内受容体のアポ/ホロ構造の差構造解析による化学物質の受容体結合リスク評価法

基于核受体apo/holo结构差异结构分析的化学物质受体结合风险评估方法

• 批准号: 14042250
• 负责人: 野瀬 健
• 金额: $ 2.69万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 2003
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14042250/
• 关键词: 内分泌撹乱化学物質; 環境ホルモン; レセプター; エストロゲン受容体; 分子モデリング

内分泌撹乱化学物質・環境ホルモンの生態系への影響は、様々な化学物質がホルモン受容体と結合し、疑似(ニセ)の作用を引き起こすことに起因する。この受容体結合メカニズムを解明することは、化学物質の受容体結合性を判別する基礎的なデータとなる点で重要であるが、現時点ではリガンドが結合していないレセプター(アポ体)の立体構造はRXRレセプターのみが知られているに過ぎず、直接的な結合試験なしでは様々な化学物質の受容体結合特性を評価するのが困難な状況である。そこで本研究では、分子モデリングの手法を用いてエストロゲン受容体のアポ体タンパク質のリガンド結合部位(LBD)の立体構造を解析・構築することでリガンド結合部位の構造を決定し、種々の化学物質の結合性の予測を行なうとともに、環境ホルモンリスク評価法を確立することを目的に、以下を研究を実施した。まず、分子モデリングで作製したエストロゲン受容体LBDを鋳型としてドッキング計算プログラムを用いた結合性の予測を行った。その結果、高い精度で計算が可能なAffinityプログラムを用いると、複合体エネルギーの値から危険性物質のグルーピングが可能なことが判明した。しかし、ハイスループットを目指した高速ドッキング法では、計算方法の改良が必要であることが明らかとなった。一方、環境ホルモンリスク評価法として近年注目を集めている、核内受容体LBDのリガンド結合に伴う構造変化を認識する抗体を用いたセンシング法の作動機序を分子モデリングを用いて解析しところ、コンホメーション変化の効果的なセンシングには、1)リジッドなヘリックス構造を保持したまま、リガンド結合時に受容体と結合することで分子表面を隠すH12にN端側ループ領域を加えた部位、2)H12に附帯するループ領域、あるいはC末端のループ領域のみ、を抗原として用いることが必要なことを明らかにした。

Effects of endocrine disrupting chemicals on ecosystems and environmental conditions, and possible causes of chemical interactions with receptors The receptor binding property of a chemical substance is difficult to evaluate by direct binding test. The binding property of a chemical substance to a receptor is difficult to evaluate. This study aims to analyze and construct the three-dimensional structure of the LBD, determine the structure of the LBD, predict the binding properties of species of chemical substances, and establish an environmental evaluation method. The molecular structure of the receptor LBD is determined by the molecular structure of the receptor LBD. Results, high accuracy, calculation, possibility, complex generation, value, hazardous substance, possibility, identification It is necessary to improve the calculation method of high speed and high speed. A method of evaluation of environmental factors in recent years has been studied. The structure of the receptor LBD has been changed. The antibody has been used to analyze the molecular structure of the receptor LBD. The structure of the receptor LBD has been changed. When binding, the receptor binds to the surface of the molecule. The N-terminal region of the molecule binds to the surface of the molecule. The N-terminal region of the molecule binds to the surface of the molecule.

项目成果

Daisuke Asai, et al.: "Biochemical Evaluation of Hormonal Activity of Endocrine Disruptors by Sensing the Estrogen Receptor Conformation Changes"Peptide Science 2002. (印刷中). (2003)

Daisuke Asai 等人：“通过感知雌激素受体构象变化对内分泌干扰物的激素活性进行生化评估”，肽科学 2002 年（出版中）。

In Y.et al.: "Aggregation feature of fluorine-substituted benzene rings and intermolecular C-H center…center … center … F interaction : Crystal structure analyses of mono- and trifluoro-L-phenylalanines"CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN. 51(11). 1258-126

Y.等人：“氟取代苯环和分子间C-H中心…中心…中心…F相互作用的聚集特征：单氟和三氟-L-苯丙氨酸的晶体结构分析”《化学与药物通报》51(11)。 .1258-126

Hideki Ishimori, et al.: "The Effect of the Peptide Corresponding to the No.12 α-Helix on the conformation Change in the Estrogen Receptor Activation"Peptide Science 2002. (印刷中). (2003)

Hideki Ishimori 等人：“对应于 12 号 α-螺旋的肽对雌激素受体激活构象变化的影响”肽科学 2002 年。（出版中）。