生殖系列発生過程における高次遺伝子発現制御の包括的解析

种系发育过程中高阶基因表达调控的综合分析

• 批准号: 15080209
• 负责人: 阿部 訓也
• 金额: $ 75.97万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15080209/
• 关键词: 始原生殖細胞; 多能性幹細胞; 遺伝子発現; エピジェネティク; 生殖細胞分化; ゲノム再プログラム化; 生殖細胞; DNAメチル化; エピジェネティクス; ES細胞; EG細胞; マイクロアレイ; 胚性幹細胞; EST解析; マイクロアレイ解析; 発生分化; cDNA解析

哺乳類の初期胚には,将来成体のすべての細胞に分化する能力を持つ多分化能細胞が存在し、ここからES細胞のような胚性幹細胞を樹立することが出来る。これらの胚性多能性細胞と始原生殖細胞(PGC)は発生学的にみて、類似した性質を持つことが示唆されており、両者の類似性、相違点を明確にすることはこれらの細胞で生じるゲノム再プログラム化や生殖細胞分化過程の解明に重要と考えられる。我々は各発生段階の胚体から純化したPGC、および代表的な幹細胞であるES細胞、PGCから派生したEG細胞、精原細胞由来のGS細胞などの幹細胞、およびES細胞から試験管内で分化したPGC様細胞(in vitro PGC; iPGC)のトランスクリプトームの比較解析を行った。その結果、ES細胞とPGCは有意に異なる発現プロファイルを持つことが分かった。各細胞タイプの発現プロファイルの主成分分析を行ったところ、これらはES細胞に類似したグループとPGCに類似した集団の2つのグループに大別できることが明らかとなった。GS細胞はPGCと非常によく似たプロファイルを有しており、iPGCもPGCのグループに分類された。調べた6つのEG細胞株のうち、5つはES細胞と同様のプロファイルを示したが、興味深いことに雌由来EG細胞株、TMA58GのみがPGCグループに分類され、この細胞株の遺伝子発現、その制御に関与するエピジェネティック状態がPGCに類似していることが示唆された。また、主成分分析の結果を元にして、ES細胞、PGCを特徴づける遺伝子群(signature gene)を同定することに成功した。これらのsignature geneの解析により、EG細胞やiPGCとES細胞、あるいはPGCの共通点、相違点を明らかにすることに成功した。

Adult mammals の early embryo に は, future の す べ て の cells に す る ability can つ more differentiated cells が existence を し, こ こ か ら ES cells の よ う な を embryonic stem cells establish す る こ と が る. こ れ ら の embryonic pluripotent cells と beginning of primordial germ cells (PGC) は 発 raw learn に み て, similar し た nature を hold つ こ と が in stopping さ れ て お り, struck の similarity, and conceives を clear に す る こ と は こ れ ら の cells born で じ る ゲ ノ ム again プ ロ グ ラ ム や germ cell differentiation process の interpret に important と exam え ら れ る. I 々 は born each 発 Duan Jie の body か ら purification し た PGC, お よ び representative な stem cell で あ る ES cells, PGC か ら derived し た EG cells, SSCS origin の GS な ど の stem cells, お よ び ES cells か ら test tube で differentiation し た PGC others in cells (in vitro PGC; iPGC) <s:1> トラ ス ス リプト リプト ム ム ム comparison and analysis of を lines った. The そ <s:1> results showed that the とPGC of ES cells was intentionally に abnormal なる, and プロファ を を を held とが とが とが scores and った った. Each cell タ イ プ の 発 now プ ロ フ ァ イ ル の pca を line っ た と こ ろ, こ れ ら は ES cells に similar し た グ ル ー プ と PGC に similar し た set 団 の 2 つ の グ ル ー プ に comparing で き る こ と が Ming ら か と な っ た. GS cells <s:1> PGCと are very によく similar to たプロファ <s:1> <s:1> を を を and are classified as された てお てお <e:1> された, iPGC <s:1> PGC <s:1> グ グ プに プに プに された された された された された. Adjustable べ た 6 つ の EG cell lines の う ち, 5 つ は と ES cells with others の プ ロ フ ァ イ ル を shown し た が, deep interest い こ と に female origin EG cell lines, TMA58G の み が PGC グ ル ー プ に classification さ れ, こ の cell lines の heritage 伝 発 now, そ の suppression に masato and す る エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ッ ク state が PGC に similar し て い る こ Youdaoplaceholder0 indicates された. ま た, principal component analysis results の を yuan に し て, ES cells, PGC を, 徴 づ け る heritage 伝 subgroup (signature) gene with fixed す を る こ と に successful し た. こ れ ら の signature gene analytical に の よ り, EG cells や iPGC と ES cells, あ る い は PGC の in common, and conceives を Ming ら か に す る こ と に successful し た.

项目成果

Tsuda, M., Abe K., et al.: "Conserved role of nanos proteins in germ cell development."Science. 301. 1239-1241 (2003)

Tsuda, M., Abe K., et al.：“纳米蛋白在生殖细胞发育中的保守作用。”科学。

Abe, K., et al.: "Gene content of the 750 kb critical region for mouse embryonic ectoderm lethal tcl-w5."Mamm.Genome. (in press). (2004)

Abe, K. 等人：“小鼠胚胎外胚层致死 tcl-w5 的 750 kb 关键区域的基因内容。”Mamm.Genome。

Mitsunaga, K., Abe K., et al.: "Loss of PGC-specific expression of the orphan nuclear receptor ERR-β results in reduction of germ cell number in mouse embryos."Mech.Dev.. (in press). (2004)

Mitsunaga, K.、Abe K. 等人：“孤儿核受体 ERR-β 的 PGC 特异性表达的丧失导致小鼠胚胎中生殖细胞数量的减少。”Mech.Dev..（出版中）。 (2004)

Comparison of gene expression in male and female mouse blastocysts revealed imprinting of the X-linked gene, Rhox5/Pem, at preimplantation stages

• DOI: 10.1016/j.cub.2005.11.071
• 发表时间: 2006-01-24
• 期刊: CURRENT BIOLOGY
• 影响因子: 9.2
• 作者: Kobayashi, S;Isotani, A;Okabe, M
• 通讯作者: Okabe, M

Which C57BL/6 Substrain is used for the background strain of your mouse?

您的小鼠的背景品系使用哪种 C57BL/6 亚品系？

• 发表时间: 2007
• 作者: Kazuyuki Mekada;et. al.
• 通讯作者: et. al.