ゲノム情報を利用する新規プロテインチップの開発

利用基因组信息开发新型蛋白质芯片

• 批准号: 16011218
• 负责人: 三原 久和
• 金额: $ 2.94万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16011218/
• 关键词: ペプチド; タンパク質; プロテインチップ; マイクロアレイ

ヒトゲノムプロジェクトやポストゲノムプロジェクトをはじめ、ゲノムおよびプロテオーム関連研究が急速に進展している。当該領域のブレークスルーのためには、プロテオーム解析を、飛躍的に発展させる「プロテインチップ」の開発が不可欠である。申請者らは、このようなプロテインチップの一つとして、立体構造をデザインしたペプチドを用いた、高効率なタンパク質検出システムである、ペプチドマイクロアレイの開発を進めている。本研究では、申請者が長年研究し得意とする立体構造をデザインしたペプチドを用いたペプチドマイクロアレイの開発を基盤とし、ゲノム情報を利用したペプチドデザインによるプロテインチップ開発を目的とした研究を実施し、成果を得た。結合の選択性および特異性を制御することを狙い、プロテイン認識用ペプチド(捕捉剤)として、ゲノム情報を利用しタンパク質・タンパク質相互作用をミミックした立体構造をデザインしたペプチドライブラリを設計した。2次・3次元構造を規制したペプチドをゲノム情報とコンピュータ科学を駆使し、申請者らの長年の経験を生かしデザインした。立体構造上にリン酸基や糖鎖などのタンパク質補因子を配置させたペプチドも設計した。これらのデザインペプチドをチップ応用するために,蛍光基をペプチド中に導入し多種同時合成可能な高効率合成法を確立した。これらデザインペプチドライブラリを、基盤的には確立してきている基板材料(ガラス基板・金基板)へアレイ化する技術を発展させた。作成したペプチドアレイを用いて、実際に種々のタンパク質を蛍光分光法(強度法)やAR(金の異常反射測定法)による認識・検出を行うシステムを構築した。「プロテインチップ」装置に結びつくドライアレイ法も開発した。

ヒトゲノムプロジェクトやポストゲノムプロジェクトをはじめ, ゲノムおよびプロテオームrelated research and rapid progress している. When the field's のブレークスルーのためには, プロテオームanalytic を, fly The jumping に発 exhibition させる「プロテインチップ」の开発がcannot owe である. Applicants are required to useいた, high-efficiency なタンパクquality 検出システムである, ペプチドマイクロアレイの开発を入めている. This research is based on the fact that the applicant has been proud of his long-term research and has a three-dimensional structure.インしたペプチドを Use いたペプチドマイクロアレイの开発をBasic Information and Use of Informationロテインチップ开発をPurpose and research are carried out, and the results are obtained. Combining the specificity of the selection, the specificity, the control, the sniper, and the sniper, the sniper, the sniper, the sniper, the sniper, the sniper, the sniper, the sniper, the sniper, the sniper, the intelligence It is designed using the をミミックした three-dimensional structure using the しタンパクMATSU and タンパクMATTER interaction をミミックたをデザインしたペプチドライブラリを. 2nd and 3rd Dimensional Structural Regulations and Information SystemsタScienceを駆士し、Applicant らの久年の経験を生かしデザインした. The three-dimensional structure of the にリン acid group やsugar lock などのタンパクnutrient supplement factor を configuration させたペプチドも design した.これらのデザインペプチドをチップ応用するために,蛍光记をペIn the laboratory, we have introduced a variety of simultaneous synthesis possibilities and established a high-efficiency synthesis method. The foundation of the foundation is established The substrate material (ガラス substrate, gold substrate) is the same as the original technology. The したペプチドアレイを is made with いて, 実记にkind 々のタンパクquality を蛍 spectrometry (intensity Method) やAR (Golden Abnormal Reflectometry) によるKnowledge・検出を行うシステムをconstruct した. "プロテインチップ" device is a knotted one.

项目成果

Peptide Arrays with Designed Secondary Structure for Protein Characterization Using Fluorescent Fingerprint Patterns

具有设计二级结构的肽阵列，可使用荧光指纹图样进行蛋白质表征

• 发表时间: 2004
• 期刊: Biopolymers 76
• 作者: Kin-ya Tomizaki;Kin-ya Tomizaki;Kenji Usui
• 通讯作者: Kenji Usui

Peptide Arrays with Designed α-Helical Structure for Characterization of Proteins from FRET Fingerprint Patterns

具有设计的 α 螺旋结构的肽阵列，用于通过 FRET 指纹图谱表征蛋白质

• 发表时间: 2004
• 期刊: Molecular Diversity 8
• 作者: Kenji Usui

A Chromism-Based Assay (CHROBA) Technique for in situ Detection of Protein Kinase Activity

原位检测蛋白激酶活性的基于显色分析 (CHROBA) 技术

• 发表时间: 2005
• 期刊: Bioorg.Med.Chem.Lett. 15
• 作者: Kin-ya Tomizaki