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ライシジン合成酵素を標的とした抗生物質の開発

开发针对大豆油苷合酶的抗生素

基本信息

批准号：
16017229
负责人：
鈴木勉
金额：
$ 5.76万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16017229/
关键词：
tRNA RNA修飾酵素ライシジン抗生物質 MALDI-TOF

项目摘要

研究代表者は、tRNA修飾酵素の研究から、抗生物質のターゲットとして最もふさわしい酵素を発見した。ライシジン(Lysidine;L)は側鎖にリジンを持ったシチジンの誘導体であり、バクテリアのAUAコドンを解読するイソロイシンtRNAに特異的に存在する。Lはアンチコドン1字目に存在し、tRNAが転写後にCからLへ修飾されることで、遺伝暗号解読能がAUGからAUAへと変化すると同時に、アミノ酸受容能がメチオニンからイソロイシンへとスイッチすることが知られている。したがって、AUAコドンの翻訳にはLの修飾が不可欠であり、Lを合成する修飾酵素遺伝子も必須遺伝子である。我々は3年程前から、機能未知遺伝子群の中から網羅的にRNA修飾遺伝子を同定するプロジェクト(リボヌクレオーム解析)を開始し、ライシジン合成酵素遺伝子(tRNA^<Ile> lysidine synthetase=tilS)を同定することに成功した[Mol Cell, 12,689-698.]。この遺伝子は必須遺伝子であり、全てのバクテリアに共通に存在する。またヒトを含め動物には存在しないことが知られている。したがってこの遺伝子あるいは酵素を阻害する薬剤は、原理的に最も副作用の少ない抗生物質であると考えられる。今年度は、ライシジン合成酵素TilSによるライシジン生合成の触媒メカニズムを詳細に検討した結果、二段階の独立した反応で構成される事を明らかにした[Ikeuchi et al., Mol Cell, 19,235-246(2005)]。また、TilSによるtRNAの基質認識機構を解析した結果、TilSはイソロイシンtRNAのアンチコドンループとアクセプターステムの2つの塩基対合(4-69/5-68)を厳密に認識することを明らかとした。さらに、東工大の濡木理教授との共同研究により、Aquifex aeolicusのTilSの結晶構造を明らかにし[Nakanishi et al., Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 21,7487-7492(2005)]、TilSとATP,リジン、tRNAとの相互作用様式が推定された。これらの基礎的研究は、Tilsの阻害を作用機序とした抗生物質の開発に有用な知見である。

Research representatives are interested in the discovery of tRNA modifying enzymes, antibiotics, and other enzymes. Lysidine (L) is the specific presence of a locked-in enzyme in the inducer of the enzyme, and a locked-in enzyme in the AUA receptor. L is the first word to be written, tRNA is the first word to be written, C is the first word to be written, and the second word to be written is the first word to be written, and the third word to be written is the first word to be written. A modified enzyme must be synthesized in order to modify the DNA sequence. Three years ago, we successfully identified RNA modification genes in a subset of functionally unknown genes <Ile>[Mol Cell, 12,689-698.]. All these documents must exist in common. There is no doubt that the animals exist. The most common side effects of antibiotics are enzyme inhibitors and antibiotics. This year, the synthesis of enzyme tilS, the synthesis of enzyme tilS, the synthesis Mol Cell, 19,235-246(2005)]。As a result of the analysis of the substrate recognition mechanism of TilS tRNA, the substrate recognition mechanism of TilS tRNA was clearly identified by the combination of 4-69/5-68 of the substrate recognition mechanism of TilS tRNA. The crystal structure of Aquifex aeolicus and TilS was studied by Nakanishi et al., Acad.Sci.USA, 21, 7487 -7492(2005)], TilS, ATP, and tRNA interactions are presumed. This basic research is aimed at understanding the mechanism of Tils 'inhibition and the development of antibiotics.

项目成果

期刊论文数量（32）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

RNA修飾の世界-見過ごされているRNAの質的な情報

RNA 修饰的世界 - 被忽视的 RNA 定性信息

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
影响因子：
0
作者：
鈴木勉;加藤敬行;鈴木勉;鈴木勉
通讯作者：
鈴木勉

Codon-specific translational defect caused by a wobble modification deficiency in mutant tRNA from a human mitochondrial disease

DOI：
10.1073/pnas.0405173101
发表时间：
2004-10-19
期刊：
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子：
11.1
作者：
Kirino, Y;Yasukawa, T;Suzuki, T
通讯作者：
Suzuki, T

RNA中のイノシン化部位を特定する方法

如何识别 RNA 中的肌苷酸位点