课题基金 / 基金详情

RNA修飾が関与する高次生命現象と遺伝子発現調節機構

RNA修飾が関与する高次生命現象と遺伝子発現調節機構
涉及RNA修饰的高等生物现象和基因表达调控机制
批准号：
22247027
负责人：
鈴木 勉
金额：
$14.31万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2010
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2010 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22247027/
关键词：
RNA修飾RNAエディティングnon-coding RNAmiRNAマススペクトロメトリー

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本プロジェクトではRNAの質的な側面、特にRNAの転写後修飾に着目し、RNAが関与する遺伝子発現調節機構と高次生命現象の探索と解明を目的とする。A-to-IRNAエディティングは、二本鎖構造を形成したRNA中のアデノシン(A)が二本鎖特異的アデノシンデアミナーゼ(ADAR)の作用により脱アミノ化され、イノシン(I)へと修飾される機構である。その修飾酵素(ADAR1およびADAR2)は必須遺伝子であり、I修飾は、トランスクリプトームの複雑性の増大と、転写後の遺伝子調節に関与することが知られ、高次なレベルでの生命現象に深く関わっていると考えられる。また、I修飾の異常やADAR1の変異は様々な疾患を引き起こすことが知られている。我々は、ゲノムワイドにイノシン化部位を実験的に同定するため、イノシン特異的な化学修飾と逆転写PCR法を組み合わせた新規手法であるInosine Chemical Erasing(ICE)法を開発した。実際にICE法を用いてヒト脳由来転写産物を解析したところ、4,395箇所の新規部位を同定することに成功した。さらに、新規に同定されたイノシン化部位について機能解析を行ったところ、イントロン領域に生じたイノシンは、スプライシングの過程において異常なエキソンが取り込まれるのを防止する役割を持っていることが判明した。以上の成果は、Nature Chemical Biology誌のarticleとして、9月12日付のオンライン版として公開された。
英文摘要
本プロジェクトではRNAの質的な側面、特にRNAの転写後修飾に着目し、RNAが関与する遺伝子発現調節機構と高次生命現象の探索と解明を目的とする。A-to-IRNAエディティングは、二本鎖構造を形成したRNA中のアデノシン(A)が二本鎖特異的アデノシンデアミナーゼ(ADAR)の作用により脱アミノ化され、イノシン(I)へと修飾される機構である。その修飾酵素(ADAR1およびADAR2)は必須遺伝子であり、I修飾は、トランスクリプトームの複雑性の増大と、転写後の遺伝子調節に関与することが知られ、高次なレベルでの生命現象に深く関わっていると考えられる。また、I修飾の異常やADAR1の変異は様々な疾患を引き起こすことが知られている。我々は、ゲノムワイドにイノシン化部位を実験的に同定するため、イノシン特異的な化学修飾と逆転写PCR法を組み合わせた新規手法であるInosine Chemical Erasing(ICE)法を開発した。実際にICE法を用いてヒト脳由来転写産物を解析したところ、4,395箇所の新規部位を同定することに成功した。さらに、新規に同定されたイノシン化部位について機能解析を行ったところ、イントロン領域に生じたイノシンは、スプライシングの過程において異常なエキソンが取り込まれるのを防止する役割を持っていることが判明した。以上の成果は、Nature Chemical Biology誌のarticleとして、9月12日付のオンライン版として公開された。
期刊论文(8)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Agmatidine, an agmatine-conjugated cytidine found at the anticodon wobble position of archaeal tRNAIle essential for AUA decoding
胍丁胺，一种在古菌 tRNAIle 的反密码子摆动位置发现的胍丁胺缀合胞苷，对于 AUA 解码至关重要
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [伊藤秀城, 石渡信一, Tsutomu Suzuki]
通讯作者： Tsutomu Suzuki
Hsc70/Hsp90 chaperone machinery mediates RISC-loading of small RNA duplexes
Hsc70/Hsp90 伴侣机制介导小 RNA 双链体的 RISC 加载
DOI： --
发表时间： 2010
期刊： Molecular Cell
影响因子： 16
作者： [Iwasaki, S., Kobayashi, M., Yoda, M., Sakaguchi, Y., Suzuki, T., Tomari, Y.]
通讯作者： Y.
Reversible Infantile Respiratory Chain Deficiency: A Clinical and Molecular Study
DOI： 10.1002/ana.22111
发表时间： 2010-12-01
期刊： ANNALS OF NEUROLOGY
影响因子： 11.2
作者： [Mimaki, Masakazu, Hatakeyama, Hideyuki, Goto, Yu-ichi]
通讯作者： Goto, Yu-ichi
マススペクトロメトリーを用いたmiRNAの直接解析
使用质谱法直接分析 miRNA
DOI： --
发表时间： 2010
期刊：
影响因子： --
作者： [S.Kamio, Q.Cao, K.Abe, T.Yamada M.Inomoto, Y.Ono, 等, Nishikimi A, 鈴木勉, 矢野直峰, 實松史幸, 鈴木勉]
通讯作者： 鈴木勉
共 8 条
    Dynamic regulation of RNA modification and biological process
    • 批准号：
      18H05272
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
    • 资助金额：
      $124.63万
    • 财政年份：
      2018
    • 负责人：
      鈴木 勉
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    ライシジン合成酵素を標的とした抗生物質の開発
    • 批准号：
      16017229
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $5.76万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      鈴木 勉
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    ヒトRNAエディティング部位の探索とRNA修飾関連遺伝子群の網羅的同定
    • 批准号：
      16012214
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $4.35万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      鈴木 勉
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    新規機能配列選択法を用いたリボソームRNAの機能解析
    • 批准号：
      15030206
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $4.1万
    • 财政年份：
      2003
    • 负责人：
      鈴木 勉
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    海外基金