CD44の糖鎖認識とシグナル伝達制御に関する構造生物学的研究

CD44碳水化合物识别与信号转导控制的结构生物学研究

• 批准号: 17046003
• 负责人: 寺沢 宏明
• 金额: $ 3.33万
• 依托单位: Kumamoto University (2006)The University of Tokyo (2005)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17046003/
• 关键词: 交差飽和法; CD44; NMR; 相互作用解析; プロテオグリカン; ヒアルロン酸; コンドロイチン硫酸; 立体構造変化

細胞の遊走機構を理解する上で、主要な細胞接着分子であるCD44と細胞外マトリックスの主要成分であるヒアルロン酸(Hyaluronic acid ; HA)やコンドロイチン硫酸プロテオグリカン(PG)との相互作用を構造生物学的に解明することは重要である。本特定領域研究において、CD44のヒアルロン酸結合ドメイン(HA-binding domain ; HABD)の二次構造とHA結合部位を同定した。さらにHA結合に伴い、HA結合部位と異なる部位に構造変化が誘起されることを示した。次に、HA結合状態でのCD44 HABDの立体構造を決定した。その結果、リガンド非結合状態に比較して、CD44のC末端領域がランダム様に構造変化することを明らかにした。CD44は、低分子量HAの添加により、細胞外領域においてプロテアーゼによる切断が誘導されることが示されている。HA結合によるC末端領域のランダム様への構造変化とプロテアーゼによる切断との相関を調べるため、in vitroにおけるCD44のトリプシン分解を試みた。その結果、リガンド非結合状態に比較して、HA結合状態においてC末端領域における分解速度の亢進が見られた。さらに、HABDの立体構造に基づき、C末端領域の高次構造保持に重要と考えられるアミノ酸残基に変異を導入した。変異体のHA結合能を測定した結果、野生型と比較し、高い結合活性を有することを明らかにした。変異体はHA非存在下においてもC末端領域がランダム構造をとることがわかった。野生型において構造多型に由来する2組(major, minor)のNMRピークが検出され、minorピークのスペクトルパターンが変異体とほぼ一致することを明らかとした。以上の結果は、CD44が2状態間の平衡を有し、低分子量HAの結合に伴い、プロテアーゼ感受性が高い立体構造へと移行することを示唆する。

The cellular machinery understands the importance of molecular interaction in biology, which is the main component of Hyaluronic acid (Hyaluronic acid; HA). It is important to understand the interaction of sulfuric acid and sulfuric acid. The purpose of this study is to study the homology of the binding site of HA in the combination of CD44, CD44 and HA-binding domain (HABD) in this specific field. After the combination of HA and HA, the chemical reaction of the part of the joint and the part of the joint of HA will show the signs of the disease. The combination of secondary and HA status makes a decision on the three-dimensional system of CD44 HABD. The results show that the results are not combined with the status of the comparison, and the CD44 terminal domain is the key to improve the performance of the system. CD44, low molecular weight HA, low molecular weight, low molecular weight. HA is combined with the C-terminal field information system, which is used to analyze the chemical properties of each other, such as in vitro, CD44, and so on. The results showed that the decomposition rate of the C-terminal domain was significantly higher than that of the uncombined state comparison and the HA combination analysis. In the field of C-terminal, it is important to study the importance of high-order fabrication of acid residues in the fields of C-terminal, HABD, and C-terminal. The results, wild type and high binding activity were determined by HA binding assay. In the presence of a non-existent HA, the C-terminal domain is not available. The origin of wild type virus (major, minor), NMR phenotype, and minor phenotype were analyzed in two groups. The results of the above results, CD44 2-shaped interstitial balance, low molecular weight HA combined with concomitant, low molecular weight and high sensitivity stereotactic imaging showed that the transfer rate was instigated.

项目成果

Backbone resonance assignments for the Fv fragment of catalytic antibody 6D9 complexed with a transition state analogue

与过渡态类似物复合的催化抗体 6D9 的 Fv 片段的主链共振分配

• 发表时间: 2005
• 期刊: Journal of Biomolecular NMR 33
• 作者: Mugishima;M.Tsuda;M.et al.;M.Kitajima;S.Horie;H.Takayama;K.Matsumoto;K.Matsumoto;Masayoshi Sakakura;Masayoshi Sakakura
• 通讯作者: Masayoshi Sakakura

Ligand-induced Structural Changes of the CD44 Hyaluronan-binding Domain Revealed by NMR*

• DOI: 10.1074/jbc.m608425200
• 发表时间: 2006-12
• 期刊: Journal of Biological Chemistry
• 影响因子: 4.8
• 作者: M. Takeda;Shinji Ogino;R. Umemoto;M. Sakakura;M. Kajiwara;K. Sugahara;Haruko Hayasaka;M. Miyasaka;H. Terasawa;I. Shimada

Identification and characterization of a second chromophore of DNA photolyase from Thermus thermophilus HB27

• DOI: 10.1074/jbc.m507972200
• 发表时间: 2005-10-28
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Ueda, T;Kato, A;Shimada, I
• 通讯作者: Shimada, I